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Laboratoire d'Océanographie Microbienne
UMR 7621

ACTUALITÉS

    • 4th Interlab Meeting Banyuls - Barcelona. Microbes & Microbis

      The 4th Interlab Meeting Microbes: Biogeochemistry & Ecology, organized by LOMIC (Banyuls) and the Departement of Marine Biology and Oceanography (Institute of Marine Sciences, Barcelona) will be held at Banyuls on 22/23th May 2017.
       
      Meeting contacts:
      Ingrid Obernosterer, CNRS: ingrid.obernosterer@obs-banyuls.fr
      Josep M. Gasol, CSIC: pepsol@icm.cisic.es

    • Démarrage de trois nouvelles thèse au LOMIC en 2016

      Trois nouvelles thèses ont démarrées au LOMIC en octobre 2016 :
      Coco KOEDOODER étudiera l’interaction phytoplancton-bactéries dans le couplage des cycles du fer et du carbone dans l’océan.
      Yan LIU travaillera sur la respiration et la matière organique dans l'Océan Austral.
      Pavla DEBELJAK travaillera sur le couplage des cycles du carbone et du fer au travers du métabolisme microbien dans l'Océan Austral...

    • Soutenance de thèse de Mathieu Rembauville

      Mathieu Rembauville a soutenu sa thèse intitulée « Ecological vectors of carbon and biomineral export in the Southern Ocean » le 20 septembre 2016 devant un jury composé de:
      Stephanie Henson NOC, Southampton, Angleterre Rapporteur
      Christine Klaas AWI, Bremerhaven, Allemagne Rapporteur
      Tom Trull CSIRO, Hobart, Australie Examinateur
      Bernard Quéguiner MIO, Marseille, France Examinateur
      Damien Cardinal LOCEAN...

    • Workshop LEFE-CYBER : Cycles biogéochimiques et diversité du vivant dans l’océan

      Du 29 Mai 14:00h au 30 Mai 13:00h 2017 à l’Observatoire Océanologique de Banyuls.
      Les micro- et macro-organismes sont des acteurs clef pour les cycles biogéochimiques des éléments majeurs et traces dans l’océan, le sédiment et aux interfaces. La prise en compte des caractéristiques biologiques des organismes et leur organisation au sein d’écosystèmes en termes de diversité, de fonctions ou d’interactions...

    • Offres de thèse 2017

      Le LOMIC propose deux sujets de thèse à l'Ecole Doctorale Sciences de l'Environnement de l'UPMC (ED129) :


      - Impacts des polluants, des métaux traces et des éléments biogènes apportés par les fleuves et les résurgences d'eaux souterraines sur la productivité des écosystèmes marins côtiers en Méditerranée.
      Directeur de thèse : CONAN Pascal (HDR), Co-directeur de thèse : PUJO-PAY Mireille
      Contact : 04 68...

    • Conférence Urania Christaki

      Urania Christaki will present a seminar on Tuesday February 14 at 11:00h, entitled :

      "The hidden diversity in a coastal marine ecosystem"
      Urania Christaki, received her Bachelor degree in Biology from University of Athens. Then, she conducted two master degrees, first in Hydrobiology (University of St. Petersbourg, Russia) and then in Oceanography (University of Athens). In 1995 she defended her Ph...

    • Arrivée de Martine DEVIC au LOMIC, DR CNRS

      Martine DEVIC, Directrice de Recherche au CNRS, a rejoint le LOMIC en janvier 2017.  
      Martine DEVIC a été responsable de l’équipe Développement de la graine chez Arabidopsis au LGDP de l’Université de Perpignan (1999-2010), puis co-responsable de l’ERL5300 CNRS-IRD Régulations Epigénétiques et Développement de la Graine (2011-2016) à Montpellier. A présent, son projet porte sur l’étude des mécanismes...

    • Accueil de Cicéro Alvarez, PhD student

      Cicero Alvares a rejoint le LOMIC pour sa troisième année de thèse intitulée « Interactions entre les facteurs abiotiques et l’horloge biologique sur le déclenchement des blooms phytoplanctoniques » et commencée à Sao Paulo au Brésil.L’objectif principal de ce projet est de vérifier comment les gènes de l’horloge régulent les taux de croissance saisonniers de l’algue Ostreococcus tauri sous différentes...

    • Soutenance HDR de Camila Fernandez

      Camila Fernandez soutiendra son habilitation à diriger des recherches le vendredi 20 janvier 2017 à Banyuls.
      Distribution, regulation and diversity of Nitrification and N2 fixation, two key processes of the marine nitrogen cycle
      Résumé : Le cycle marin de l’azote fourni des sels nutritifs et/ou énergie pour une large fraction de la communauté microbienne. Il agit dans un continuum de conditions physico-chimiques...

    • Une plateforme microalgale au service de la biotechnologie

      La société Microphyt et le Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC – UPMC/CNRS) ont créé le laboratoire de recherche commun OTARI (acronyme de Ostreococcus tauri de la Recherche à l’Industrie), dont les coresponsables sont François-Yves Bouget (partie académique), directeur de recherche CNRS, et Rémi Pradelles (partie industrielle), en 2014 afin de développer une plateforme microalgale permettant...

    • Offre de stage de Master 2

      Effets de la lumière et de la température sur la croissance des espèces dominantes du bloom phytoplanctonique printanier en baie de Banyuls
      Le phytoplancton marin, à la base des chaînes alimentaires océaniques, joue un rôle clédans les cycles biogéochimiques en contribuant à environ 50% de la production primaire. Le réchauffement des océans est le principal facteur responsable des changements globaux...

    • Journée du LOMIC 2016

      La journée du LOMIC 2016 s'est tenue le 2 juin au Jardin Méditerranéen de Banyuls.
      Programme :
      10:20 - Mathieu REMBAUVILLEComposition en lipides des flux d'export dans l'Océan Austral
      10:40 - Natalia LLOPISLimitation en éléments nutritifs et formation de spores de résistance chez Chaetoceros hyalochaete
      11:00 - Valérie VERGÉLe projet Moore : transformation génétique des picoeucaryotes phytoplanctoniques...

    • Participation du LOMIC à l'expédition Green Edge en Arctique pour étudier l’impact de la réduction de la banquise sur la productivité de l’écosystème

      Le LOMIC est impliqué dans le projet de recherche international Green Edge (« Phytoplankton spring bloom in the Arctic Ocean: past, present and future response to climate variations, and impact on carbon fluxes and the marine food web » 2014-2018 (http://www.greenedgeproject.info)) qui s’intéresse à la productivité primaire dans l’Océan Arctique et au devenir de la matière organique produite par le...

    • Conférence Marti Gali-Tapias

      Dr. Marti GALI-TAPIAS proposera le jeudi 12 mai à 14h (amphithéâtre) une conférence intitulée :
      “Oceanic dimethylsulfide cycling. From upper-ocean budgets to large-scale estimates based on remote sensing data.”
       
      Marti est actuellement en postdoc dans l'unité TAKUVIK à l'Université Laval (Québec).
      Homepage: http://www.takuvik.ulaval.ca/team/marti_gali.php

    • Conférence Gerhard Herndl

      Conférence Mardi 12 juillet à 11h - Amphithéâtre
      Prof. Gerhard Herndl
      Université de Vienne, Dept. of Limnology and Bio-Oceanography
      "Microbial Transformation of Organic Carbon in the Dark Ocean: From Bulk Measurements to Individual Molecules"
       
      Microbial Oceanography Lab at the Univerity of Vienna:
      http://www.microbial-oceanography.eu/

    • Conférence David Kieber

      Conférence le 9 juin à 11h à l'amphithéâtre
      David J. KIEBER
      Department of Chemistry, State University of New York, College of Environmental Science and Forestry, Syracuse, NY
      Coupled Ocean-Atmosphere Loss of Refractory Marine Dissolved Organic MatterThe oceans hold a massive quantity of organic carbon that is greater than all terrestrial organic carbon biomass combined. Nearly all marine organic carbon...

    • Campagne océanographique dans la région patagonniene au Chili

      Depuis sept ans, le programme COPAS SurAustral étudie le fjord Puyuhuapi, l'un des plus importants de la Patagonie Chilienne. Avec des profondeurs maximales dépassant les 200m, Puyuhuapi présente des évènements d’hypoxie récurrente (concentrations d’oxygène dissous dans la colonne d’eau inférieures à 1.4 mL par litre). L’augmentation de l’activité aquicole dans le fjord ces dernières années fait de...

    • Accueil de Marcela Cornejo

       
       
      Dr Marcela Cornejo will be visiting the LOMIC between November 3rd and 17th 2010 in the frame of an ECOS-CONICYT exchange program.  She is a post doctoral fellow at the University of Concepcion (Chile), currently funded by the Gordon and Betty Moore Foundation (USA). Dr Cornejo is a specialist in the marine cycle of nitrous oxide (N2O), a powerful greenhouse gas biologically mediated in the ocean...

    • 2011

      Auger P. A, Diaz F, Ulses C, Estournel C, Neveux J, Joux F, Pujo-Pay M, Naudin J-JFunctioning of the planktonic ecosystem of the Rhone River plume (NW Mediterranean) during spring and its impact on the carbon export: a field data and 3-D modelling combined approach. Biogeosciences 8:3231-3261 (IF : 3.246)
      Aggarwal RK, Allainguillaume J, Bajay MM, … Medlin L, et al. Permanent Genetic Resources added...

    • Soutenance de HDR de Ingrid Obernosterer

      Les travaux intitulés : "Dissolved organic matter-bacteria interactions in the ocean" ont été présenté par Ingrid Obernosterer (CR CNRS) le lundi 18 juin à 14h dans l'amphithéâtre de l'observatoire devant le jury composé des rapporteurs Olivier Pringault (Chargé de Recherche, IRD, ECOSYM, Montpellier,  Marie-Alexandrine Sicre (Directrice de Recherche, CNRS, LSCE...

    • Soutenance de HDR de Jean-François Ghiglione

       Jean-François Ghiglione a soutenu sa HDR le 5 juin 2012 dans l'amphithéâtre de l'observatoire.  Ses travaux sont intitulés : Biodiversité bactérienne en milieu pélagique Influence des facteeus environnementaux et rôle dans le cycle du carbone

    • Soutenance de thèse de Marion Fourquez

       Marion présentera ses travaux de thèse intitulés, le lundi 24 Septembre, à 14 h dans l'amphithéâtre du Batiment A. 
       
      résumé des travaux : Le fer est un élément indispensable à la quasi-totalité des formes de vie sur Terre. Cependant, en milieu marin, sa biodisponibilité pour les microorganismes est particulièrement faible. En milieu océanique, le fer limite la production primaire et les processus...

    • Soutenance de thèse

      Mélissa Lagdhass soutiendra sa thèse le Lundi 29 Novembre à 14 h dans l'amphithéâtre du bâtiment B. Son travail co-encadré par I. Obernosterer et P. Lebaron est intitulé :
       Réponse de la communauté bactérienne marine à différentes sources nutritives : lien entre activité et diversité
      Résumé:
      L’étude de la relation entre la structure des communautés bactériennes marines et des différentes sources...

    • HDR: soutenance de Fabien Joux.

      Le 6 Octobre 2010, dans l'amphithéâtre de l'Observatoire de Banyuls. Fabien Joux, Maitre de conférence à l'UPMC et directeur adjoint du LOMIC a soutenu son HDR intitulée : Effet directs et indirects du rayonnement solaire ultraviolet sur les communautés microbiennes marines.

    • InterLab meeting LOMIC-CSIC 2013

      Le 2ieme InterLab Meeting organisé par le LOMIC et l'Institut Ciences del Mar a pris place le 4/5 Février 2013. 26 chercheurs, postdoc et etudiants sont venus à Banyuls pour un échange scientifique autour de présentations de travaux récents.

    • Ecole Chercheur Chemostat

      L'Ecole Chercheur "La Modelisation du Chemostat" s'est tenue du 4-7 Juin 2012 à Banyuls-sur-mer.
       
       Cette école a été organisée par le LOMIC (UPMC/CNRS) et l'équipe INRA-INRIA MODEMIC
       
      Comité d’organisation : Claude Lobry (email : lobrinria@wanadoo.fr) / Ingrid Obernosterer (email : ingrid.obernosterer@obs-banyuls.fr) / Alain Rapaport (email : rapaport@supagro.inra.fr)
       
      Intervenants: Alain...

    • Rencontre scientifique avec Institut de Ciències del Mar

      Le LOMIC et le Institut de Ciènciès del Mar ont organisé leur première rencontre scientifique du 28 au 29 septembre à Barcelone. Une trentaine de chercheurs dont 11 du LOMIC a participé à des présentations, discussions et moments de convivialité. Cette rencontre a été très enrichissante et rendez vous est pris pour la deuxième rencontre en 2012, à Banyuls sur mer.

    • Séminaire de Christophe Guinet

      Effet de la variabilité des conditions océanographiques sur le comportement de pêche à fine échelle chez l'éléphant de mer
       
      Séminaire Jeudi 03 mai 2012, Amphi A, 14:00Les ressources marines se répartissent dans l'espace en fonction des conditions océanographiques, qui jouent un rôle prépondérant (structure frontale, système upwelling, zone de glace de mer, zone d’apports fluviaux, teneur...

    • Séminaire de Jean Armengaud

       A l'invitation du LOMIC, Jean Armengaud, Chercheur au laboratoire de biochimie des systèmes perturbés du CEA à Marcoules, présente un séminaire intitulé : Les contes des mille et une protéines : protéo-génomique de microorganismes d’environnements extrêmes.
      Il exposera notamment les derniers résultats de ses recherche montrant comment l'étude des protéomes bactériens...

    • Visite de Phil Boyd

      Philip Boyd, professeur à l'Université d'Otago, Dunedin (Nouvelle Zélande) sera en visite au LOMIC jeudi 14 juin. A cette occasion il donnera un séminaire à 11h dans l'amphithéâtre : 
       
      Mapping phytoplankton iron utilization: Insights into Southern Ocean supply mechanisms
       
      The emerging field of ocean iron biogeochemistry has prompted interest in the identification and quantification of Fe...

    • MOORE Foundation

      $8M awarded to scientists from the Gordon and Betty Moore Foundation to accelerate development of experimental model systems in marine microbial ecology
      Le LOMIC fait parti des bénéficiaires de l'initiative en Microbiologie Marine financé par la MOORE Foundation pour accélérer le développement de modèles expérimentaux de microorganismes marins.
       
      Communiqué de presse de MOORE Foundation
       

    • Participation à la mission Tara Méditerranée sur les microplastiques


      Jean-François Ghiglione participe à la mission Tara Méditerranée qui a pour objectif d’évaluer l’impact des micro-plastiques sur la santé et le fonctionnement des écosystèmes en mer Méditerranée. Cette campagne de 7 mois permettra d’évaluer l’étendue du problème des plastiques qui s’accumulent de manière alarmante en mer Méditerranée. En collaboration avec d’autres laboratoires français et étrangers...

    • MICROPHYT et le LOMIC créent un laboratoire de recherche commun

      La société MICROPHYT et le Laboratoire d’Océanographie Microbienne créent un laboratoire de recherche commun LABCOM. Ce projet financé pour 3 ans par l'ANR (appel d'offre « Laboratoires Communs – Organismes de recherche / PME-ETI »), est coordonné par François-Yves Bouget (DR CNRS, LOMIC) et Rémi Pradelles (Société Microphyt).
      Ce nouveau projet dénommé OTARI (acronyme de Ostreococcus Tauri de la...

    • Une microalgue pour détecter des produits toxiques

       
      La microalgue marine Ostreocccus tauri est la plus petite cellule à noyau (eucaryote) connue. La transformation génétique de cette microalgue a permis de développer des biocapteurs luminescents capables de mesurer l’effet toxique de molécules utilisées dans les peintures antifouling de manière plus sensible que les tests écotoxicologiques classiques. L’automatisation du procédé de mesure...

    • Journées d'écotoxicologie microbienne, 21-23 mai 2014

      Ces journées ont pour objectif principal de réunir les écologistes microbiens qui étudient les conséquences des pollutions sur les communautés microbiennes et les services rendus par les microorganismes dans le domaine de la qualité écologique des milieux naturels. Elles seront un moment d’échange sur les avancées et les approches transversales utilisées en écotoxicologie microbienne dans différents...

    • Campagne AMOP au large du Pérou (25 janvier-23 fevrier 2014)

      La campagne AMOP a pour objectif de comprendre les processus impliqués dans la désoxygénation des océans et la possible extension des zones de minimum d’oxygène (OMZs), telles que celle qui est localisée au large des côtes du Pérou.
      Les Zones de Minimum d’Oxygène (OMZs), en tant que couches suboxiques, sont connues pour jouer un rôle-clé sur l’évolution du climat et des écosystèmes et ressources...

    • Réunion de travail sur les campagnes Dewex à Banyuls

       Les participants aux campagnes DeWEX du projet MermEX se sont réunis à Banyuls sur Mer les 17 et 18 octobre 2013 pour présenter les résultats préliminaires et évoquer les perspectives et la valorisation des données des 2 campagnes de février et d’avril dans un contexte d’observation intensif de la Méditerranée Nord occidentale (hiver 2013 -2013).

    • Le LOMIC à la recherche des cascades

      5 membres du LOMIC, P. Conan, J. capparos, C. Sauret, T. Séverin et M. Agab, embraquent sur le N/O Atalante pour cette mission
      La région du Cap de Creus avec son canyon adjacent est la principale zone d'exportation des eaux denses formées pendant l’hiver par refroidissement rapide des eaux de surface sur le plateau continental du Golfe du Lion (Méditerranée Nord Occidentale ; Fig. 1A). Des couplages...

    • La campagne KEOPS2 en ligne

       La campagne KEOPS piloté par le LOMIC quittera l'ile de la Reunion le 8 octobre. 9 scientifiques du LOMIC participerons à cette expédition de deux mois dans les 50eme hurlants. Pour suivre le déroulement de la campagne suivre le lien

    • Préparatifs pour les mers australes

      Le projet international KEOPS2, piloté par des chercheurs du LOMIC,  a pour objectif d’étudier le rôle de l’océan austral dans le contrôle du climat et le fonctionnement de l’écosystème marin.  Cinquante scientifiques de 9 laboratoires français et 6 instituts étrangers s’embarqueront en Octobre 2011, à destination des cinquantièmes hurlants, sur le Navire Océanographique Marion Dufresne de l’IPEV**...

    • Campagnes pendant l'été Austral

       C. Fernandez, chercheuse au LOMIC, a participé en janvier 2011 à une campagne océanographique au large du Chili central (36°S) dans le cadre du projet "Bio-Océanographic survey off central Chile, FIP2009-39". Cette zone du Pacfique Sud, dont la production biologique est parmi les plus élevées du monde est aussi connue par la présence d'eaux profondes dépourvues d'oxygène. Une série d'expériences...

    • campagne MOOMZ4

      La campagne MOOMZ4 (Microbial Oceanography in the Oxygen Minimum Zone) s'est déroulée entre le 15 et le 26 Mars 2012 à la station marine de Dichato de L'université de Concepcion dans la zone du minimum d'oxygène du Chili central. Une équipe internationale (Université de Copenhague et Aahrus au danemark, MIT et Oregon state university aux USA Université de Conception et LOMIC) a mené des expériences...

    • KEOPS2 : colloque post campagne

      Soixante cinq participants du projet international  KEOPS2, piloté par le LOMIC, se sont réunis du  5 au 7 septembre à Banyuls pour examiner les premiers résultats obtenus pendant la campagne océanographique qui s'était déroulée en octobre novembre 2011. les 35 présentations ont été suivies de nombreuses discussions. De celles ci vont découler la présentation des résultats dans des conférences internationales...

    • Campagne océanographique LATEX

       La campagne Océanographique LATEX va se dérouler du 31 aout au 24 septembre. 5 membres de l'équipe réponses et fonctions des microorganismes en biogéochimie marine , I. Obernosterer, S. Blain, L. Oriol, J. Capparos et N. Batailler embarquent sur le navire océanographique Suroit pour étudier le rôle d'un grand tourbillon présent dans le golfe du Lion sur les microorganismes et leur fonction dans...

    • Découverte d’un mécanisme d’adaptation de certaines espèces de phytoplancton marin à la carence en fer

      Des chercheurs issus d’un consortium de laboratoires mené par le LOMIC ont précisé le rôle de la ferritine dans l'adaptation de certianes espèces de phytoplancton à la carence au fer.
      La ferritine est une protéine présente dans les cellules de très nombreux organismes, de l’homme à la bactérie, qui possède la capacité de stocker de grandes quantités de fer. En permettant la réutilisation du fer...

    • Publication in Plant Cell: Efficient gene targeting and foreign DNA removal by homologous recombination in the picoeukaryote Ostreococcus

      With fewer than 8000 genes and a minimalist cellular organization, the green picoalga Ostreococcus tauri is one of the simplest photosynthetic eukaryotes. Ostreococcus tauri contains many plant-specific genes but exhibits a very low gene redundancy. The haploid genome is extremely dense with few repeated sequences and rare transposons. Thanks to the implementation of genetic transformation and vectors...

    • Publication in Cell journal: Determination and Inference of Eukaryotic Transcription Factor Sequence Specificity

      Détermination et prédiction des sites de reconnaissance des facteurs de transcription eucaryotes
      Un consortium international mené par des chercheurs de l’Université de Toronto, auquel est associé le Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC, UMR7621 UPMC-CNRS, Observatoire Océanologique, Banyuls sur Mer) a déterminé et prédit les séquences ADN de fixation d’environ un tiers des facteurs de...

    • ANR PHOTO-PHYTO. Effets du réchauffement climatique sur le déclenchement des blooms phytoplanctoniques marins

      Le réchauffement des océans est le principal facteur responsable des changements globaux de productivité, biomasse et phénologie (moment des blooms) des communautés phytoplanctoniques.
      Dans les océans tempérés, l’abondance et la diversité du phytoplancton augmentent de façon considérable entre l’hiver et le printemps. Ces blooms résultent vraisemblablement d’une combinaison de paramètres physiques...

    • Utiliser la génomique pour étudier le cycle du fer dans l’océan

      Une collaboration entre les équipes du laboratoire Biologie intégrative et organismes modèles (BIOM, CNRS / UPMC) et du Laboratoire d’océanographie microbienne (LOMIC, UPMC / CNRS) et un expert en modélisation du cycle du fer dans l’océan vient de montrer que l’analyse du génome de populations naturelles de microorganismes marins apportent des informations nouvelles sur les stratégies déployées par...

    • Photorésistance UV de Photobacterium révélée par la protéomique

      A lire dans :
      Matallana-Surget S., JouxF., Wattiez
      R., Lebaron P. (2012) Proteome analysis of the UVB-resistant marine bacterium, Photobacterium angustum S14.
      PlosOne 7(8): e42299
       

    • Symposium on UV radiation at COPAS


      Dans le cadre du LIA MORFUN un symposium intitule "UV radiation and marine ecosystems: Current research and strategies for the future" sera organisé au COPAS (Concepcion, Chile) le 5-7 Decembre 2012.
      Deux chercheurs de notre équipe, Camila Fernandez et Fabien Joux, sont invitées au symposium et presenteront leurs travaux recents sur le sujet.
       
      Lire plus http://www2.udec.cl/oceanoudec/pag_ASI13/eng/descrpcion...

    • L'horloge d'Ostreococcus décodée

       
      Les chercheurs du Laboratoire d’Océanographie Microbiologique (UMR7621 CNRS, Banyuls-sur-Mer) ont développé un nouveau modèle biologique ; la microalgue Ostreococcus. L’étude de l’horloge interne de ce microorganisme constitue une étape clé dans la compréhension de la physiologie générale du phytoplancton et dans le développement de nombreuses applications en biotechnologie. Ces travaux ont...

    • Pole to Pole Community Composition

       
      Des travaux de notre équipe récemment publié dans PNAS (Ghiglione et al. 2012) ont été sélectionné pour faire l’objet d’un communiqué de presse à la NSF
      A lire dans http://www.nsf.gov/news/news_summ.jsp?cntn_id=125685&WT.mc_id=USNSF_51&WT.mc_ev=click
       
       
       

    • Départ de Maria Nielsdottir

        Nous sommes tristes, (mais au même temps contents pour Maria) d'annoncer que Maria Nilelsdottir a quitté l'équipe pour poursuivre un Post Doc dans le groupe de Greg Cutter à Old Dominion University aux États-Unis.  Nous remercions Maria pour son travaille au sein de l'équipe et nous lui souhaitons une bonne chance dans sa nouvelle poste.

    • Special Issue Publication Announcement: Microbial Ecotoxicology

      A special issue of "Environmental Science and Pollution Research" (IF 2.76) dedicated to « Microbial Ecotoxicology » is open from 1st October 2014 to 31th January 2015.
      This special issue welcomes the most recent developments, researches and ideas in microbial ecotoxicology, with no restriction of the ecosystem studied. Potential topics include, but are not limited to:• microbial bioassays, biomarkers...

    • Le LOMIC en Corse

      Jocelyne Caparros a participé du 20 juin au 11 juillet au projet DUNE piloté par C. Guieu du LOV. Le déploiement  de grands mésocosmes dans la réserve marine de Scandola a pour objectif d'étudier l'impact des dépôts de poussières sahariennes sur les cycles biogéochimiques en mer Méditerranée. Le LOMIC a en charge dans ce projet l'étude de la communauté bactérienne (diversité et activité). 

    • Ecole Chercheur Chemostat

      L'Ecole Chercheur "La Modelisation du Chemostat" s'est tenu du 4-7 Juin a Banyuls-sur-mer.
       
       Cette école a été organisée par le LOMIC (UPMC/CNRS) et l'équipe INRA-INRIA MODEMIC
       
      Comité d’organisation : 
Claude Lobry (email : lobrinria@wanadoo.fr)
Ingrid Obernosterer (email : ingrid.obernosterer@obs-banyuls.fr) 
Alain Rapaport (email : rapaport@supagro.inra.fr)
       
      Intervenants: Alain Rapaport...

    • Reconnaissance pour Ingrid Obernosterer

       Le comité éditorial de la revue Limnology and Oceanography a désigné dans son bulletin Volume 20(4) December 2011, Ingrid Obernosterer comme "outstanding reviewer" . Ceci récompense la qualité du travail d'arbitre effectué pour cette revue .
      OUTSTANDING L&O REVIEWERS  Peer review is a crucial component of modern science. The fact that L&O is able to utilize the services of the best scientists as...

    • Massive Phytoplankton Blooms Under Arctic Sea Ice

      Durant son séjour postdoctoral au LOMIC, Eva Ortega-Retuerta a participé à trois missions océanographiques en Articque. Durant l'une d'entre elles, réalisée en juillet 2011 dans la Mer des Tchouktches (Chukchi Sea), des biomasses extrêmement élevées de phytoplancton ont été mesurées à l'interface mer / glace. Une meilleure prise en compte de l'importance de ces blooms est nécessaire dans le contexte...

    • Postdoctoral research follow


















      Post doctoral research fellow in microagal biotechnology at the Observatoire Océanologique of Banyuls, France.
       
      A postdoc position (1 year renewable 1 year) is available at the Laboratory of Microbial Oceanography, Observatoire Océanologique of Banyuls sur mer (France). The postdoc is supported by...

    • Massive Phytoplankton Blooms Under Arctic Sea Ice

      Durant son séjour postdoctoral au LOMIC, Eva Ortega-Retuerta a participé à trois missions océanographiques en Articque. Durant l'une d'entre elles, réalisée en juillet 2011 dans la Mer des Tchouktches (Chukchi Sea), des biomasses extrêmement élevées de phytoplancton ont été mesurées à l'interface mer / glace. Une meilleure prise en compte de l'importance de ces blooms est nécessaire dans le...

    • Photorésistance UV de Photobacterium révélée par la protéomique

      A lire dans :
      Matallana-Surget S., JouxF., WattiezR., Lebaron P. (2012) Proteome analysis of the UVB-resistant marine bacterium, Photobacterium angustum S14. PlosOne 7(8): e42299.
       

    • Le projet SOCLIM soutenu par la Fondation BNP Paribas




      Dans le cadre de son programme Climate Initiative, la Fondation BNP Paribas soutient 5 nouveaux projets de recherche scientifique sur le changement climatique pour un montant de 2,7 millions d’euros sur trois ans.Parmi ces 5 projet, figure le projet SOCLIM (Southern Ocean and Climate), dont les coordinateurs sont Stéphane Blain (LOMIC, Banyuls), Hervé Claustre (LOV, Villefranche)...

    • Publication in Nature Geosciences: Carbonate counter pump stimulated by natural iron fertilization in the Polar Frontal Zone

       
      Une nouvelle étude réalisée dans l'océan Austral par une équipe internationale de scientifiques impliquant Ian SALTER du Laboratoire d’Océanographie Microbienne (actuellement en détachement au Alfred Wegener Institute, Germany), révèle que la réponse de l'écosystème marin à un enrichissement naturel en fer est plus complexe et moins efficace à long terme, du point de vue du stockage du dioxyde...

    • Lien entre diversité bactérienne et cycle du carbone dans l’océan Austral

      Des chercheurs du Laboratoire d’océanographie microbienne (LOMIC/OOB, CNRS / UPMC) et du Laboratoire d’océanologie et de géosciences (LOG, CNRS / Université du Littoral Cote d’Opale / Université de Lille 1) ont collecté, pendant la campagne KEOPS2 dans l’océan Austral, un jeu de données inédit combinant des mesures de flux de carbone et de biodiversité microbienne. Les chercheurs ont ainsi pu démontrer...

    • Visite de Maria Nielsdottir

       
      Dr. Maria Nielsdottir is presently a visiting scientist in our research team. She is a post doctoral fellow at the University of Southamption (National Oceanography Centre, Southampton). Maria is currently working on iron uptake by phytoplankton in the North Atlantic Ocean.

    • Accueil de Ruben Escribano

      Le professeur Ruben ESCRIBANO de l’Universidad de Concepción (Chile) sera accueilli pour un mois au sein du LOMIC en septembre 2010.
       R. Escribano est spécialiste de la biologie du zooplankton et collabore avec C. Fernández du LOMIC sur l’étude de l’excrétion d’éléments azotés (principalement de type organique dissous) par des espèces clef de copépodes, organismes responsables d’une grande partie...

    • Accueil de Leanne Armand

      Le Dr. Leanne Armand du Marine and Coastal Phytoplnakton Laborarory (Macquarie University, North Ride, Australia) est accueillie au LOMIC en tant que Professeur invité de l’UPMC pendant le mois de septembre 2014. Leanne Armand est une des partenaires du projet international KEOPS (direction S. Blain) qui a pour objectif d’étudier la pompe biologique de CO2 dans l’océan austral et sa réponse à la...

    • Accueil de Véronica Molina

      Dr. Véronica Molina from the Departamento de Biologia. Facultad de Ciencias Naturales y Exactas. Universidad de Playa Ancha (Chile) will be invited by the UPMC as Professor for one month at the LOMIC (september 2015).
       
      Dr Molina has extensive expertise in molecular techniques (metagenomics, proteomics and Q-PCR) and has been working on the regulation of marine nitrogen cycle for the last 10 years...

    • Sujets de thèse LOMIC 2014

      Le Laboratoire d'Océanographie Microbienne propose deux sujets de thèses en 2014 soumis à financement à l'Ecole Doctorale Sciences de l'Environnement (ED129) :
      Sujet 1 - Respiration microbienne et source de matière organique dans l’océan (Responsable : Dr. Ingrid Obernosterer)
      Détail du sujet (77 KB)
      Sujet 2 - Caractérisation des communautés microbiennes associées à la colonisation et à la...

    • Soutenance de thèse Tatiana Séverin

      Tatiana Séverin soutiendra le Mardi 23 septembre à 13h30 dans l'amphithéâtre sa thèse intitulée "Régulation des cycles biogéochimiques par les communautés microbiennes pélagiques sous influence de perturbations physiques à méso-échelle".
      Résumé :
      Les épisodes de convection en milieu hauturier sont des processus physiques hivernaux récurrents, mais irréguliers, ayant un fort pouvoir perturbateur...

    • Soutenance de thèse Hugo Botebol

       
      Hugo Botebol a soutenu sa thèse le jeudi 11 décembre intitulée : "Influence de la lumière et de l'horloge circadienne dans la gestion de la carence en chez le genre Ostreococcus"
       
      Résumé: Le fer est un élément présent en abondance dans la croûte terrestre, indispensable à la quasi totalité des êtres vivants. Cependant, en milieu marin la biodisponibilité du fer est souvent faible et sporadique...

    • Soutenance de thèse Marine Blanchet

      Marine BLANCHET a soutenu sa thèse en cotutelle UPMC - Université Conception (Chili) et intitulée "Metabolic and composition changes in marine bacterial community exposed to variable natural organic matter bioreactivity" le Vendredi 16 Janvier 2015 devant le jury composé de :
      Dr. Emma Rochelle-Newall (rapporteur)
      Dr. Cristian Vargas (rapporteur)
      Dr. Thierry Bouvier (examinateur)
      Dr. Cristian Gallardo...

    • Soutenance thèse Denisse Sanchez

      Denisse Sanchez a soutenu sa thèse intitulée "Rôle des mécanismes abiotiques et biotiques dans la dynamique de la matière organique dissoute dans les écosystèmes marins pélagiques (Méditerranée Nord Occidentale)" le Mardi 6 octobre 2015 à l'Observatoire Océanologique de Banyuls.
       
      Résumé :
      Dans la présente étude qui effectue un premier bilan de la distribution et du devenir de la CDOM/FDOM aux...

    • Conférence Nicolas Mouquet

       
      Jeudi 6 février. Nicolas Moquet (Institut des Sciences de l'Evolution, Univ Montpellier)
      "Phylogenetic constraints on ecosystem functioning"
      It has been hypothesized that evolutionary history should influence the Biodiversity Ecosystem Functioning (BEF) relationship. This important new direction in the BEF literature is however based on few empirical investigations. Here we combine re-analysis...

    • Conférence Julie Dinasquet

       Vendredi 31 janvier.  Julie Dinasquet (University of Copenhagen, Marine Biology Section)
      "Substrate control of community composition and functional adaptation in marine bacterioplankton"
       
      A drop of sea-water is teeming with a million of bacteria, on which pelagic food-webs and biogeochemical cycles depend. These bacteria thrive on a wide range of dissolved organic carbon (DOC) compounds produced...

    • Séminaire de Stefan Bertilsson




      Pr. Stefan Bertilsson (Limnology Department Evolutionary Biology Centre, University Uppsala, Sweden)
      March 10th at 14:00 (Amphitheatre, bâtB)
      "Exposing the freshwater microbiome at the level of genes, genomes and metagenomes"
      Abstract:Freshwater lakes and marine ecosystems behave similarly in many ways, yet their resident microbial communities are fundamentally different...

    • Séminaire Isabelle Carré

      Isabelle CARRE (University of Warwick – UK) est présente au LOMIC dans le cadre d’Assemble (collaboration F-Y. Bouget), elle propose un exposé de ses travaux : Circadian clocks and their contribution to environmental stress tolerance Vendredi 25 avril à 11h00 en Amphithéâtre (Bat B)
       
      Plants are unable to evade changes in their environment but are capable of adaptation. An endogenous 24-h biological...

    • Séminaire Eva Sintes



      Dr. Eva Sintes (Microbial Oceanography Lab, University of Vienna, Austria), présentera le 17 septembre à 11h une conférence intitulée "Functional biogeography of deep ocean microbes".
      Abstract :Microbial biogeography and biodiversity have been studied extensively over the past decades. Most studies focused on the taxonomic characterization based on 16S rRNA gene. However...

    • Séminaire Alessandro Tagliabue

      Le Dr. Alessandro TAGLIABUE est accueilli au LOMIC par Stéphane BLAIN du 30 juin au 3 juillet 2015.
       
      Il donnera à cette occasion une conférence le mercredi 1er juillet à 11h (Amphithéâtre A. Guille)
      Role of Hydrothermal Vents in the Global Ocean Iron Cycle
      SUMMARY:
      Hydrothermal vents were only discovered in the late 1970s thanks to advances in undersea technology. Around the same time, new...

    • Journées d'écotoxicologie microbienne, 21-23 mai 2014

      Ces journées ont pour objectif principal de réunir les écologistes microbiens qui étudient les conséquences des pollutions sur les communautés microbiennes et les services rendus par les microorganismes dans le domaine de la qualité écologique des milieux naturels. Elles seront un moment d’échange sur les avancées et les approches transversales utilisées en écotoxicologie microbienne dans différents...

    • Workshop "When genetics meets oceanography" (14-16 October 2013 Banyuls-sur-Mer France)

      Scientific Committee
      Kathy Barbeau Scripps Institution of Oceanography/UC San Diego, USA. Stéphane Blain, Laboratoire d’Océanographie MIcrobienne, CNRS-Univ Paris06, Banyuls-sur-Mer France, François-Yves Bouget Laboratoire d’Océanographie MIcrobienne, CNRS-Univ Paris06, Banyuls-sur-Mer, France. Chris Bowler Département de Biologie, Ecole Normal Supérieure, Paris, France. Christel Hassler, Institut...

    • Interlab meeting 2015 ICM-LOMIC

      La 3ème rencontre Interlab MICROBES: Ecology and Biogeochemistry entre le LOMIC et l'Institut de Ciences del Mar (ICM) a eu lieu les 4 et 5 juin 2015 à Barcelona.
      Organisateurs : Ingrid Obernosterer (LOMIC) & Josep Gasol (ICM)
       
      Thursday June 4th
      15:00 Continental erosion and the rise of diatoms - Pedro Cermeño (ICM)
      15:15 Cocktail of organic matter and priming effect - Fabien Joux (LOMIC)...

    • Journée du LOMIC 2011

      La journée du LOMIC 2011 s'est déroulée aux terrasses de Collioure le 14 Juin .
      Elle a été l'occasion au travers de 17 présentations et de nombreuses discussions de faire un tour d'horizon des recherches actuellement en cours au sein de l'unité.
       
      09:00 09:30ACCUEIL  09:30 09:45Ian S.résultats µprojet 2010 09:45 10:00Camila F.résultats µprojet 2010 Etude de la sensibilité...

    • Journée du LOMIC 2012

      La journée du LOMIC 2012 s'est déroulée aux terrasses de Collioure le 4 Juin .
      Elle a été l'occasion au travers de 18 présentations et de nombreuses discussions de faire un tour d'horizon des recherches actuellement en cours au sein de l'unité.
       
      09:00 09:30ACCUEIL 09:30 09:45Ian Salter.pyroséquencage MOLA 09:45 10:00Florence Corelloucapteurs en plaque de variation de...

    • Journée du LOMIC 2013

      La journée du LOMIC 2013 s'est déroulée au terrasses de Collioure le 13 Juin.
       
       

    • Journée du LOMIC 2014

       La journée du LOMIC s'est déroulée le 11 juin 2014. Au cours de cette journée, 15 présentations ont été réalisées.
       
      Programme de la journée (52 KB)

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Landa, M., M. Cottrell, D. Kirchman, K. Kaiser, P.M. Medeiros, L. Tremblay, N. Baitailler, J. Caparros, P. Catala, K. Escoubeyrou, L. Oriol, S. Blain and I. Obernosterer (2013) Phylogenetic and structural response of heterotrophic bacteria to dissolved organic matter of different chemical composition...

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