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Laboratoire d'Océanographie Microbienne
UMR 7621

Objectifs Axe 4

Responsable: Jean-François Ghiglione

 

Ce thème aborde les conséquences écologiques de pollutions marines à l’échelle des communautés microbiennes (écotoxicologie microbienne) et il s’intéresse aux ‘services rendus par les microorganismes’ comme technologie innovante et écoresponsable utilisant des microorganismes modèles (écotechnologie microbienne).


Nous abordons les questions:

  • de la dépollution de contaminants d’origine anthropique par les communautés microbiennes marines (bioremédiation). Nous développons une vision écosystémique des effets des agents d’origine anthropique en prenant en compte les limitations par les ressources (contrôle « bottom-up ») et par la lyse virale ou la prédation (contrôle « top-down ») qui sont les facteurs qui régulent la capacité des microorganismes à dégrader les polluants.
  • des mécanismes adaptatifs et de la résilience des communautés et des fonctions microbiennes soumises à des polluants d’origine anthropique.
  • de l’utilisation de microorganismes modèles pour le développement de bioindicateurs de la qualité écologique du milieu littoral.
  • de la valorisation des microalgues par bioingénierie métabolique afin de produire des composés à forte valeurs ajoutées.

 

A découvrir également: Le réseau thématique pluridisciplinaire d'Ecotoxicologie microbienne [EcotoxicoMic]

 

Thèse en cours: DUSSUD Claire (2014-2017) "Caractérisation des communautés microbiennes associées à la colonisation et à la dégradation des plastiques en mer "UPMC, Ecole Doctorale Science de l'Environnement. Direction : Jean-François Ghiglione (LOMIC)

 

Projets en cours


ANR-OTARI. Ostreococcus Tauri de la Recherche à l’Industrie (coordinateurs F-Y. Bouget / V. Usache). Financement ANR « Laboratoires Communs – Organismes de recherche / PME-ETI » [2014-2017].

 

ANR-OXOMAR Dégradation biotique et abiotique et toxicité des plastiques oxo-dégradables en milieu marin (coordinateur JF Ghiglione) Financé par l'Agence Nationale de la Recherche [2016-2020].

 

TARA-PACIFIC: Biodiversité des récifs coralliens et leur évolution face au changement climatique et aux pressions anthropiques (coordinateur S. Planes et D. Allemand) Financé par la fondation TARA et en partenariat avec le Génoscope.

 

ANR-CARIOCA: Coral reef acclimatization to ocean acidification at CO2 seeps (coordinateur R Rodolfo Metalpa - IRD Nouméa) [2016-2020]

 

ALGECO: Les algues corallines, un nouveau modèle pour l’étude du fonctionnement des récifs coralliens (coordinateur M Nugues, Univ Perpignan) Financé par le CNRS - PEPS Exomod [2016]

 

IMPRECI-M²: IMPacts RECIproques entre Microorganismes et Métaux traces en milieu marin côtier : qui contrôle qui ?
(coordinateur B Misson - Univ Toulon) Financé par le CNRS - EC2CO [2016-2017]

 

ECOL-EAU: Combinaison de bio-essais pour l'évaluation des risques écologiques en milieu littoral (coordinateur JF Ghiglione) Financé par le CNRS - PEPS FaiDoRA [2016].

 


Projets réalisés



-BERTOX. Ecotoxicité et biodiversité bactérienne à l’étang de Berre (PI Olivier Radakovitch, CEREGE). EC2CO [2010-2012]

-DIGAMÉ. Distribution, dégradation et impacts écotoxicologiques sur les microorganismes des pesticides dans les milieux côtiers et lagunaires méditerranéens (PI : F. Joux, LOMIC). EC2CO [2008-2009]

-IBISCUS. Indicateurs biologiques et chimiques de contaminations urbaines en milieu marin (PI Madeleine Goutx, LMGEM). EC2CO [2009-2011]

-MICSIPE. Accelerated corrosion influenced by microorganism of steel structure in port environment (PI Hervé Gueuné, CORRODYS) – EUROPE [2008-2011]

-MISECHICUI. Etude des MIcroorganismes dans des SEdiments CHIliens fortement contaminés par le CUIvre. (PI L. Quillet, Univ Rouen) - EC2CO [2010-2012]

-PLASTIC-MICRO. Caractérisation des communautés microbiennes associées à la colonisation et à la dégradation des plastiques en mer (coordinateur JF. Ghiglione) Financé par le CNRS-EC2CO [2014-2015].

-OTAUTOX. Validation d’une lignée luminescente transformée de la microalgue marine Ostreococcus tauri pour tester la toxicité d’hydrocarbures aromatiques polycycliques et d’un produit dispersant (PI F. Joux, F-Y. Bouget) Financement : Projet Innovant LOMIC 2014 [2014]

-REI. Biofilms et corrosion d’alliages inoxydables en eau de mer - DGA (Direction Générale de l’Armement- (PI Hervé Gueuné, CORRODYS) [2010-2012]

-SIPOREX. Identification des bactéries marines dégradant les hydrocarbures et les pesticides par une approche de DNA-Stable Isotope Probing. (PI J-F. Ghiglione, LOMIC). Financement: Projet Innovant LOMIC 2013 et fonds propres [2013]

-VERMEILLECOTOX. Etude spatio-temporelle des apports de contaminants et de la qualité écotoxicologique sur le littoral de la côte Vermeille. (PI JF. Ghiglione) - Europe / Agence des Aires Marines Protégées [2012-2014]

JF Ghiglione - 07/09/16

Actualités

    • Journées d'écotoxicologie microbienne, 21-23 mai 2014

      Ces journées ont pour objectif principal de réunir les écologistes microbiens qui étudient les conséquences des pollutions sur les communautés microbiennes et les services rendus par les microorganismes dans le domaine de la qualité écologique des milieux naturels. Elles seront un moment d’échange sur les avancées et les approches transversales utilisées en écotoxicologie microbienne dans différents...

    • MICROPHYT et le LOMIC créent un laboratoire de recherche commun

      La société MICROPHYT et le Laboratoire d’Océanographie Microbienne créent un laboratoire de recherche commun LABCOM. Ce projet financé pour 3 ans par l'ANR (appel d'offre « Laboratoires Communs – Organismes de recherche / PME-ETI »), est coordonné par François-Yves Bouget (DR CNRS, LOMIC) et Rémi Pradelles (Société Microphyt).
      Ce nouveau projet dénommé OTARI (acronyme de Ostreococcus Tauri de la...

    • Participation à la mission Tara Méditerranée sur les microplastiques


      Jean-François Ghiglione participe à la mission Tara Méditerranée qui a pour objectif d’évaluer l’impact des micro-plastiques sur la santé et le fonctionnement des écosystèmes en mer Méditerranée. Cette campagne de 7 mois permettra d’évaluer l’étendue du problème des plastiques qui s’accumulent de manière alarmante en mer Méditerranée. En collaboration avec d’autres laboratoires français et étrangers...

    • Special Issue Publication Announcement: Microbial Ecotoxicology

      A special issue of "Environmental Science and Pollution Research" (IF 2.76) dedicated to « Microbial Ecotoxicology » is open from 1st October 2014 to 31th January 2015.
      This special issue welcomes the most recent developments, researches and ideas in microbial ecotoxicology, with no restriction of the ecosystem studied. Potential topics include, but are not limited to:• microbial bioassays, biomarkers...

    • Une microalgue pour détecter des produits toxiques

       
      La microalgue marine Ostreocccus tauri est la plus petite cellule à noyau (eucaryote) connue. La transformation génétique de cette microalgue a permis de développer des biocapteurs luminescents capables de mesurer l’effet toxique de molécules utilisées dans les peintures antifouling de manière plus sensible que les tests écotoxicologiques classiques. L’automatisation du procédé de mesure...

Traductions :

    Nos dernières publications

    - Ghiglione JF, Martin-Laurent F, Pesce S (2016) Microbial ecotoxicology: an emerging discipline facing contemporary environmental threats. Environmental Science and Pollution Research, 23: 3981-3983
    - Sauret C, Tedetti M, Guigue C, Dumas C, Lami R, Pujo-Pay M, Conan P, Goutx M, Ghiglione JF (2016) Influence...

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