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Laboratoire d'Océanographie Microbienne
UMR 7621

 

Le Laboratoire d'Océanographie MICrobienne (LOMIC) a été crée le 01 Janvier 2010. Cette Unité Mixte de Recherche Sorbonne Université-CNRS (UMR 7621) est rattachée à l'Institut National des Sciences de l'Univers (INSU) du CNRS, mais est aussi thématiquement en interaction forte avec l'Institut d'Ecologie et de l'Environnement (INEE) et l'Institut des Sciences Biologiques (INSB) du CNRS.

 

Le LOMIC rassemble des compétences dans les domaines de la biogéochimie marine, de l'écologie microbienne, de la biodiversité, de la physiologie et de l'écotoxicologie des microorganismes marins et des biotechnologies. Cette pluridisciplinarité permet d'aborder de manière originale des questions aux frontières de la science.

 

L’objectif général du LOMIC est d’étudier les interactions réciproques entre un milieu changeant et varié, l’océan, et les micro-organismes qui l’habitent de manière intégrative du gène à l'écosystème. Notre travail concerne tout à la fois des questions de recherche fondamentale (ex. réponses des microorganismes aux changements globaux de l'environnement) et de recherche appliquée avec des partenariats industriels (ex. bioremédiation, valorisation des microalgues).

 

Evaluation par le Haut Conseil de l’évaluation de la recherche et de l’enseignement supérieur (Hcéres)

Le LOMIC a été évalué par Hcéres durant la campagne de la vague D (2017-2018). Vous trouverez ci-dessous les liens des différents documents constituant cette évaluation :

- Bilan scientifique (2014-2017), projet scientifique (2019-2023) et sélection de produits et d'activités de recherche du LOMIC. Lien

- Rapport du comité HCERES suite à la visite du 11-12 décembre 2017. Lien

15/09/18

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ACTUALITÉS

    • Conférence Pierre Barré

      Pierre Barré chercheur CNRS au Laboratoire de Géologie de l’ENS à Paris, donneral le vendredi à 11 h une conférence dans l’amphithéâtre.
      Caractériser et quantifier le carbone organique persistant dans les sols 
      Pierre Barré (Laboratoire de Géologie de l’ENS, UMR 8538)
      Du fait de son importance pour la qualité des sols et les régulations climatiques, la matière organique du sol (MOS) a fait l’objet de...

    • Tom Delmont conference and introduction to the anvi'o interface

      Tom Delmont, postdoc researcher at the Genoscope on the TARA Oceans project, will visit the LOMIC on Thursday 18th October.
      http://merenlab.org/tutorials/infant-gut/
      Tom will also give a research seminar at 14:00 entilted:
      "From metagenomes to genomes and back: high resolution surveys of marine microbial populations"
      https://www.researchgate.net/profile/Tom_Delmont

    • Lucas Tisserand démarre une thèse au LOMIC

      Lucas Tisserand a débuté en octobre une thèse avec un contrat doctoral de Sorbonne Université (ED129), sous la direction de Fabien Joux, sur l’étude la biodégradation de la matière organique d’origine terrigène dans les milieux aquatiques marins et d’eau douce et l’identification des acteurs microbiens. Il s’agit d’un travail qui sera réalisé en partie sur différentes plateformes expérimentales (CEREEP...

    • Offres stages Master2 2019



      Assessing the quality and molecular composition of dissolved organic matter produced by marine prokaryotes: Role of nutrient availability
      Heterotrophic bacterioplankton play a key role in organic matter processing in all aquatic ecosystems, with consequences on the cycling of carbon and other elements. Heterotrophic bacteria and archaea reprocess roughly 50% of organic carbon that is fixed by phytoplankton...

    • Accueil au LOMIC de Valérie Barbe, chercheuse au Genoscope d’Evry

      Dans le cadre d’un accord de collaboration entre le CEA/Genoscope et le LOMIC, Valérie Barbe sera présente deux ans à Banyuls. Valérie est une microbiologiste spécialisée dans l’analyse de génomes bactériens et de données métagénomiques. Elle est impliquée dans la mission TARA-Pacific et travaillera notamment en collaboration avec Jean-François Ghiglione sur l’étude de la biodégradation des plastiques...

    • Prix du meilleur poster étudiant au 17th ISME-meeting et soutenance de thèse en octobre pour Laëtitia Dadaglio

      Laëtitia a reçu l’un des prix décernés aux meilleurs posters étudiants au 17th International Symposium on Microbial Ecology (ISME-meeting) qui a eu lieu en août à Leipzig (Allemagne) avec un poster intitulé « How do the phytoplankton spring blooms reshape the bacterial community composition in the Arctic Ocean? ».
      Laëtitia soutiendra sa thèse intitulée « Dynamique des communautés bactériennes en réponse...

    • Arrivée de Léo Chasselin, assistant ingénieur projet ANR CINNAMON

      Léo Chasselin a intégrer le LOMIC le 3 septembre 2018 en tant qu'assistant ingénieur sur une contrat d'un an pour travailler dans le cadre du projet ANR CINNAMON.

    • Suivez le LOMIC sur Twitter

      Le Laboratoire d'Océanographie Microbienne LOMIC est maintenant sur Twitter - Suivez l'actualité de nos recherches et découvrez les projets auxquels nous participons !
      https://twitter.com/LOMIC_UMR7621

    • Recrutement d'Eva Ortega-Retuerta comme chercheuse au CNRS

      Eva Ortega-Retuerta a intégré en juin le LOMIC comme chargée de recherche au CNRS en section 19. Eva développera un projet de recherche intitulé "The microbial carbon pump in a changing Mediterranean Sea".
      L'ensemble du LOMIC lui souhaite la bienvenue.
       
       
       

      Figure 1. The biological carbon pump; adapted from https://earthobservatory.nasa.gov. The microbial carbon pump loop is drawn in yellow

    • Journée du LOMIC 2018

      La journée du LOMIC 2018 se tiendra le vendredi 8 juin au Jardin Méditerranéen de Banyuls.


      Programme :
      09:00 - Welcome
      Theme 1: Regulation of microbial functions by environmental parameters
      09:10 – Coco KOEDOODER
      The role of the glyoxylate shunt in the acclimation to iron stress in a marine heterotrophic bacterium
      09:30 – Tanguy SOULIE
      Impact of the nutrients and vitamins availabilities on microcosms...

    • Conférence Valérie Barbe

      Le LOMIC accueille Valérie BARBE pour une conférence intitulée "Le SAV des OMICs" le vendredi 1er juin à 11h (salle de conférences).
      Valérie BARBE est chercheuse au CEA et responsable du "Laboratoire de biologie moléculaire pour l'étude des Génomes" au Génoscope d'Evry.
      Résumé de la conférence :
      Le Genoscope est le Centre National de Séquençage. Depuis sa création, il s’est spécialisé bien entendu dans...

    • Offres thèses 2018 - Ecole Doctorale Sciences de l'Environnement



      Le LOMIC propose pour la rentrée 2018 deux sujets de thèse à l'Ecole Doctorale Sciences de l'Environnement (ED129).
      Pré-candidature sujets 2018 date limite d'inscription le 31 Mai 2018
      Sujet 1 :Influence des formations d'eau Levantine Intermédiaire sur la productivité des écosystèmes ultra-oligotrophes de Méditerranée orientale dans un contexte de changement climatique
      Responsables : P. Conan / M. Pujo-Pay...

    • Une réévaluation de l'importance des petites diatomées du nanoplancton à l'échelle globale entraîne une révision des flux de carbone dans les écosystèmes pélagiques

      Dans le cadre du programme DeWex-MERMEX, Mireille Pujo-Pay et Pascal Conan (LOMIC) ont participé à la rédaction d'un article paru dans Nature Communications en collaboration avec des membres du MIO de Marseille, du CEFREM de Perpignan, de l'École Normale Supérieure de Paris, du Simons Centre en inde, du CEA-Genoscope d'Evry, et de la station biologique de Roscoff.
      Les diatomées sont l'un des principaux...

    • Arrival of three new PhD students at LOMIC

      Between October and November 2017, three new thesis begin at LOMIC:
      Justine JACQUIN (contrat doctoral UPMC) will study the biodegradation of plastic polymers at sea. (Theme 3)
      Angel RAINCONICYT funding, Chile) will study the Consequences of environmental disturbances on aquatic microbial structure and their functional stability. (Theme 2)
      Jingguang CHEN (Chinese Scholarship Council funding, China) will...

    • Accueil de Sara Beier

      The LOMIC welcome Dr. Sara BEIER as Associated scientist from the Leibniz institute for Baltic Sea Research Warnemuende to develop her project funded by the German Research Foundation (DFG) and entilted: "Genetic Structure of Microbial Communities as a Signature of their Functional Stability".
      This original project funded for three year will explore the response of bacterial communities to disturbance...

    • Parution des prospectives INSU Océan atmosphère 2017-2022

      Le bilan et les prospectives 2017-2022 de la Commission Spécialisée Océan Atmosphère (CSOA) de l'Institut National des Sciences de l'Univers viennent de paraitre.
      Ce travail constitue la synthèse des ateliers préparatoires et du colloque de Toulouse (15-17 nov. 2016) réalisée sous la direction de Stéphane Blain, Président de la CSOA.
      Le LOMIC a également contribué à ce travail au travers de la participation...

Traductions :

Highlight Publication

Use of plankton-derived vitamin B1 precursors, especially thiazole-related precursor, by key marine picoeukaryotic phytoplankton
R. W Paerl, F.-Y. Bouget, J-C. Lozano, V. Vergé,P. Schatt, E. E. Allen, B. Palenik and F. Azam
The ISME Journal (2016)
 
Several cosmopolitan marine picoeukaryotic phytoplankton...

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Contact

Directeur : Fabien JOUX

Tel : 33 (0)4 68 88 73 42

E-mail : joux @ obs-banyuls.fr

 

 

Directeur adjoint : François-Yves BOUGET

Tel : 33 (0)4 68 88 73 50

E-mail : francois-yves.bouget @ obs-banyuls.fr

 

Gestion - Secrétariat : Frédérique SANZ

Tel : 33 (0)4 68 88 73 01

E-mail : frederique.sanz @ obs-banyuls.fr

 

Assistant de prévention : Philippe CATALA

Tel : 33 (0)4 68 88 73 53

E-mail : catala@obs-banyuls.fr

 

Formation permanente : Jocelyne CAPARROS

Tel : 33 (0)4 68 88 73 85

E-mail : jocelyne.caparros @ obs-banyuls.fr

Le LOMIC en chiffres


6 Chercheurs CNRS
4 Enseignant-chercheurs

1 Chercheur accueilli

9 Tech/Ingénieurs
4 Post doctorants
9 Etudiants en thèse

4 Etudiants Master2

2 Etudiants Ingénieur