Le Laboratoire d'Océanographie MICrobienne (LOMIC) a été crée le 01 Janvier 2010. Cette Unité Mixte de Recherche Sorbonne Université-CNRS (UMR 7621) est rattachée à l'Institut National des Sciences de l'Univers (INSU) du CNRS, mais est aussi thématiquement en interaction forte avec l'Institut d'Ecologie et de l'Environnement (INEE) et l'Institut des Sciences Biologiques (INSB) du CNRS.
Le LOMIC rassemble des compétences dans les domaines de la biogéochimie marine, de l'écologie microbienne, de la biodiversité, de la physiologie et de l'écotoxicologie des microorganismes marins et des biotechnologies. Cette pluridisciplinarité permet d'aborder de manière originale des questions aux frontières de la science.
L’objectif général du LOMIC est d’étudier les interactions réciproques entre un milieu changeant et varié, l’océan, et les micro-organismes qui l’habitent de manière intégrative du gène à l'écosystème. Notre travail concerne tout à la fois des questions de recherche fondamentale (ex. réponses des microorganismes aux changements globaux de l'environnement) et de recherche appliquée avec des partenariats industriels (ex. bioremédiation, valorisation des microalgues).
Evaluation par le Haut Conseil de l’évaluation de la recherche et de l’enseignement supérieur (Hcéres)
Le LOMIC a été évalué par Hcéres durant la campagne de la vague D (2017-2018). Vous trouverez ci-dessous les liens des différents documents constituant cette évaluation :
- Bilan scientifique (2014-2017), projet scientifique (2019-2023) et sélection de produits et d'activités de recherche du LOMIC. Lien
- Rapport du comité HCERES suite à la visite du 11-12 décembre 2017. Lien
ACTUALITÉS
27.02.2019
Offres de thèses 2020 - Ecole doctorale Sciences de l'Environnement
Le LOMIC propose deux sujets de thèse au concours de l'Ecole Doctorale Sciences de l'Environnement (ED129) en 2020 :
Sujet 1 : Rôle des interactions biotiques dans la régulation des blooms phytoplanctoniques hivernaux sur un site côtier de Méditerranée nord ouest (France).
Contact :François-Yves BOUGET (fy.bouget@obs-banyuls.fr)
Détail du sujet 1
Sujet 2 : Etude des facteurs de contrôle de la distribution...
22.02.2020
Démarrage du projet ANR RESTORE
Le projet ANR RESTORE vise à étudier l’impact combiné des apports de matière organique dissoute et du réchauffement climatique dans les milieux aquatiques d’eau douce et marine, en s’intéressant plus particulièrement à la réponse structurelle et fonctionnelle des communautés microbiennes. Ce projet est porté par le LOMIC et regroupe cinq partenaires français (CEREEP, iEES Paris, MARBEC, ESE, ISYEB)...
29.01.2020
Start of LIA MAST
The international associated laboratory Multiscale Adaptive STrategies Laboratory (LIA MAST) provides a comprehensive analysis of the diverse adaptive strategies found in nature at distinct levels of biological organization including molecules, genes, cells, organisms and ecosystems. As this effort will integrate biological sciences, earth sciences and ecological sciences at 6 institutions in France...
08.01.2020
Mission BINGO à Kerguelen
Stéphane Blain, Ingrid Obernosterer, Audrey Gueneugues et Olivier Crispi sont partis pour une mission de deux mois et demi (mi-décembre-fin février) sur l’île Kerguelen afin d’étudier le rôle de la fonte des glaciers en tant que source de fertilisation en fer dans l’océan Austral. Cette région du globe joue un rôle majeur dans la régulation du CO2 atmosphérique et donc du climat, mais l’absorption...
21.10.2019
Thesis defense - Coco Koedooder
Monday, 21st of October at 14:00, Coco Koedooder will be defending her PhD in the amphitheatre A. Guille.
Her thesis is titled: "The interplay between Fe-limitation, carbon and light in a (photo)heterotrophic bacterium"
and will be examined by the following jury committee members:
Yeala Shaked, Hebrew University of Jerusalem, IS (rapporteur)Eric Rosenfeld, Université de la Rochelle, FR (rapporteur)Emma...
18.10.2019
Thesis defense - Pavla Debeljak
Pavla Debeljak will defend her PhD titled « The coupling of carbon and iron cycles in the Southern Ocean through microbial metabolism» .
It will take place in the amphitheatre Alain Guille on Friday, 18th of October at 9.30 pm.
20.09.2019
Thesis defenese - Yan LIU
Friday 20th September at 10:00, Yan LIU will be defending her PhD in the amphitheatre A. Guille.
Her thesis is titled: "Spatial and temporal patterns in diatom-prokaryote associations in the Southern Ocean"
and will be examined by the following jury committee members:
Josep Gasol, Sébastien Monchy, Dominique Lamy, Emma Rochelle-Newalland Ingrid Obernosterer.
28.06.2019
Nouvelle UE de Licence3 - Réponses des microorganismes aux changements globaux
Une nouvelle UE de Licence3 sera proposée à Sorbonne Université en avril 2020. Cette UE intitulée "Réponses des microorganismes aux changements globaux : conséquences écologique, sanitaires et sociétales (CHANGE)" présente différentes illustrations de la réponse des microorganismes aux changements globaux qui affectent la planète et les conséquences sur la santé des hommes, des animaux et de l’environnement...
26.06.2019
Tara trace les plastiques des fleuves
Le 23 mai, la goélette de la Fondation Tara Océan a quitté Lorient pour une expédition de six mois sur les fleuves européens. À son bord, une quarantaine de scientifiques chargés d’évaluer la concentration de déchets plastiques charriés par les fleuves et leur impact sur les organismes marins.
Jean-François Gighiglione est le responsable de cette mission scientifique.
Journal du CNRS
https://lejournal...
12.06.2019
Les sources hydrothermales profondes stimulent des efflorescences phytoplanctoniques dans l’océan Austral
Une équipe internationale incluant le LOMIC (Stéphane BLAIN, Mathieu REMBAUVILLE) révèle pour la première fois la présence d’efflorescences phytoplanctoniques directement stimulées par les apports en fer dissous de sources hydrothermales profondes dans l’océan Austral. Cette découverte a été obtenue en combinant des observations de flotteurs profileurs avec des données historiques d’éléments traces...
09.05.2019
Ina Deutschmann conference
Ina Deutschmann, postdoc researcher at the Institut de Ciències del Mar, Barcelona, will give a seminar on Tuesday 21th May at 11:00, entitled: "Disentangling environmental effects in microbial association networks".
http://www.singek.eu/ina-deutschmann/
06.05.2019
5ème Inter-lab meeting Barcelone-Banyuls
Les 2 et 3 Mai, une cinquantaine de chercheurs se sont réunis sur la Costa Brava pour le 5ème Inter-lab meeting. Cette rencontre, organisée par Josep Gasol (lnstitut des Sciences de la Mer, Barcelone) et Ingrid Obernosterer (LOMIC) était l’occasion d'un échange scientifique sur des recherches menées de chaque côté des Pyrénées sur le thème "Ecologie microbienne et Biogéochimie".
Programme scientifique...
19.04.2019
Sensing the Rainbow - conference Betty Sands
Betty Sands will give a talk on Friday the 19th April at 11:15 am at the amphitheatre.
She will describe her findings on the responses of the green algae Ostreococcus to red, green and blue light wavelengths and discuss her plans for further analysis. Techniques include differential gene expression from RNASeq data and comparison with measurements of photosynthetic parameters using the Phyto-PAM.
Betty...
18.04.2019
Thesis defense - Stefan Lambert
On Thursday the 18th of April at 14h, Stefan Lambert will be defending his PhD on the Seasonality and dynamics of microbial consortia in the Bay of Banyuls.This will take place in the amphitheater A. Guille.
Résumé:Dans les océans tempérés, les transitions printanières annuelles sont accompagnées de blooms phytoplanctoniques. Le phytoplancton joue un rôle essentiel dans les cyclesbiogéochimiques et...
06.03.2019
Conference Roberta Hansman
Dr. Roberta Hansman from the International Atomic Energy Agency (Monaco) will present a conference Friday 8th March at 11:00 entitled:
"Effects of Increased Temperature on Microbial Carbon Cycling in the Deep Ocean."
https://www.researchgate.net/profile/Roberta_Hansman/research
27.02.2019
Conférence Paul Steiner
Paul Steiner, PhD student at the Dept. of Limnology & Bio-Oceanography, University of Vienna, will present a conference Friday 1st March at 11:00 entitled:
"Bacterial community dynamics and DMSP concentrations in marine snow and the ambient water of the Adriatic Sea”
https://www.microbial-oceanography.eu/
https://www.youtube.com/watch?v=_8U9mPNKv3w
Highlight Publication
Rhythmicity of coastal marine picoeukaryotes, bacteria and archaea despite irregular environmental perturbations
Stefan Lambert, Margot Tragin, Jean-Claude Lozano, Jean-François Ghiglione, Daniel Vaulot, François-Yves Bouget & Pierre E. Galand
The ISME Journal. volume 13, pages388–401 (2019)
Seasonality...
Contact
Directeur : Fabien JOUX
Tel : 33 (0)4 68 88 73 42
E-mail : joux @ obs-banyuls.fr
Directeur adjoint : François-Yves BOUGET
Tel : 33 (0)4 68 88 73 50
E-mail : francois-yves.bouget @ obs-banyuls.fr
Gestion - Secrétariat : Frédérique SANZ
Tel : 33 (0)4 68 88 73 01
E-mail : frederique.sanz @ obs-banyuls.fr
Assistant de prévention : Philippe CATALA
Tel : 33 (0)4 68 88 73 53
E-mail : catala@obs-banyuls.fr
Formation permanente : Barbara MARIE
Tel : 33 (0)4 30 19 24 28
E-mail : barbara.marie @ obs-banyuls.fr
Le LOMIC en chiffres
8 Chercheurs CNRS
3 Enseignant-chercheurs
2 Chercheurs accueillis
9 Tech/Ingénieurs
6 Post doctorants
9 Etudiants en thèse
4 Etudiants Master2
2 Etudiants Ingénieur