Le Laboratoire d'Océanographie MICrobienne (LOMIC) a été crée le 01 Janvier 2010. Cette Unité Mixte de Recherche Sorbonne Université-CNRS (UMR 7621) est rattachée à l'Institut National des Sciences de l'Univers (INSU) du CNRS, mais est aussi thématiquement en interaction forte avec l'Institut d'Ecologie et de l'Environnement (INEE) et l'Institut des Sciences Biologiques (INSB) du CNRS.

Le LOMIC rassemble des compétences dans les domaines de la biogéochimie marine, de l'écologie microbienne, de la biodiversité, de la physiologie et de l'écotoxicologie des microorganismes marins et des biotechnologies. Cette pluridisciplinarité permet d'aborder de manière originale des questions aux frontières de la science.

L’objectif général du LOMIC est d’étudier les interactions réciproques entre un milieu changeant et varié, l’océan, et les micro-organismes qui l’habitent de manière intégrative du gène à l'écosystème. Notre travail concerne tout à la fois des questions de recherche fondamentale (ex. réponses des microorganismes aux changements globaux de l'environnement) et de recherche appliquée avec des partenariats industriels (ex. bioremédiation, valorisation des microalgues).

Evaluation par le Haut Conseil de l’évaluation de la recherche et de l’enseignement supérieur (Hcéres)

Le LOMIC a été évalué par Hcéres durant la campagne de la vague D (2017-2018). Vous trouverez ci-dessous les liens des différents documents constituant cette évaluation :

- Bilan scientifique (2014-2017), projet scientifique (2019-2023) et sélection de produits et d'activités de recherche du LOMIC. Lien

- Rapport du comité HCERES suite à la visite du 11-12 décembre 2017. Lien

15/09/18

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ACTUALITÉS

- 25.01.2021
  Offre de CDD Ingénieur d’étude de 4 mois en informatique/électronique
  
  Projet : Développement d'un simulateur de conditions naturelles de lumière et température pour la culture et le suivi automatisé de microalgues
  Contact : François-Yves Bouget (Fy.bouget@obs-banyuls.fr)
  Le laboratoire d’Océanographie microbienne (LOMIC) de l’observatoire océanologique de Banyuls sur Mer étudie les microalgues du phytoplancton par des approches de biologie et de génétique. Ils disposent...
- 03.11.2020
  Démarrage de deux nouvelles thèses au LOMIC
  Deux nouvelles thèses au LOMIC démarrent en octobre 2020 :
  -Rui ZHANG : Régulation microbienne de cycles de nutriments et de métaux traces dans l’Océan Austral.
  - Maxime BEAUVAIS : Rôle des interactions biotiques dans la régulation des blooms phytoplanctoniques hivernaux sur un site côtier de Méditerranée nord ouest.
  
  Nous leur souhaitons la bienvenue au LOMIC.
- 21.10.2020
  L’échantillonnage automatisé dans l’océan Austral : un défi relevé avec succès au large des îles Kerguelen
  Des chercheurs du Laboratoire d’océanographie microbienne (LOMIC, CNRS / Sorbonne Université), avec le soutien de la Division technique de l’INSU, viennent de franchir une nouvelle et importante étape en déployant un préleveur autonome à 50 m de profondeur au cœur des 50e hurlants. D’octobre 2016 à avril 2017, ce préleveur autonome a échantillonné tous les 11 jours l’océan ambiant. Un piège à particules...
- 19.10.2020
  Propositions stages Master2 2021
  
  Sujet 1 : Dynamique du plancton marin : Influence du régime lumineux sur le devenir du carbone et de l’azote fixés par les diazotrophes.
  Descriptif du sujet de stage
  Contacts : Sophie Rabouille (rabouille@obs-banyuls.fr), Eva Ortega-Retuerta (ortegaretuerta@obs-banyuls.fr)
  
  Sujet 2 : Etude comparative du transcriptome de souches tempérées et polaires de la picoalgue Bathycoccus prasinos
  Descriptif du...
- 13.10.2020
  Soutenance de thèse - Justine Jacquin
  Justine Jacquin soutiendra sa thèse intitulée “Ecotoxicologie microbienne des plastiques en mer : colonisation et biodégradation par la plastisphère » le vendredi 16 octobre à 9h.
  Résumé : De nos jours, les déchets plastiques ont envahi l’ensemble des écosystèmes marins du monde en n’épargnant aucune zone. La demande mondiale de plastique ne cesse de croitre d’année en année, malgré l’impact...
- 12.10.2020
  Thesis defense - Jingguang Cheng
  Monday, 12st of October at 14:00, Jingguang Chengwill defend his PhD tilted "Microplastics in the marine environment: an ecotoxicological perspective".
  Abstract : Oceanic plastic pollution is of major concern, with several million tonnes of plastic dumped in the ocean every year that are causing health threat to marine creatures. Impacts have been found at all the trophic chain levels from the zooplankton...
- 22.02.2020
  Démarrage du projet ANR RESTORE
  Le projet ANR RESTORE vise à étudier l’impact combiné des apports de matière organique dissoute et du réchauffement climatique dans les milieux aquatiques d’eau douce et marine, en s’intéressant plus particulièrement à la réponse structurelle et fonctionnelle des communautés microbiennes. Ce projet est porté par le LOMIC et regroupe cinq partenaires français (CEREEP, iEES Paris, MARBEC, ESE, ISYEB)...
- 29.01.2020
  Start of LIA MAST
  The international associated laboratory Multiscale Adaptive STrategies Laboratory (LIA MAST) provides a comprehensive analysis of the diverse adaptive strategies found in nature at distinct levels of biological organization including molecules, genes, cells, organisms and ecosystems. As this effort will integrate biological sciences, earth sciences and ecological sciences at 6 institutions in France...
- 08.01.2020
  Mission BINGO à Kerguelen
  Stéphane Blain, Ingrid Obernosterer, Audrey Gueneugues et Olivier Crispi sont partis pour une mission de deux mois et demi (mi-décembre-fin février) sur l’île Kerguelen afin d’étudier le rôle de la fonte des glaciers en tant que source de fertilisation en fer dans l’océan Austral. Cette région du globe joue un rôle majeur dans la régulation du CO2 atmosphérique et donc du climat, mais l’absorption...
- 21.10.2019
  Thesis defense - Coco Koedooder
  Monday, 21st of October at 14:00, Coco Koedooder will be defending her PhD in the amphitheatre A. Guille.
  Her thesis is titled: "The interplay between Fe-limitation, carbon and light in a (photo)heterotrophic bacterium"
  and will be examined by the following jury committee members:
  Yeala Shaked, Hebrew University of Jerusalem, IS (rapporteur)Eric Rosenfeld, Université de la Rochelle, FR (rapporteur)Emma...
- 18.10.2019
  Thesis defense - Pavla Debeljak
  Pavla Debeljak will defend her PhD titled « The coupling of carbon and iron cycles in the Southern Ocean through microbial metabolism» .
  It will take place in the amphitheatre Alain Guille on Friday, 18th of October at 9.30 pm.
- 20.09.2019
  Thesis defenese - Yan LIU
  Friday 20th September at 10:00, Yan LIU will be defending her PhD in the amphitheatre A. Guille.
  Her thesis is titled: "Spatial and temporal patterns in diatom-prokaryote associations in the Southern Ocean"
  and will be examined by the following jury committee members:
  Josep Gasol, Sébastien Monchy, Dominique Lamy, Emma Rochelle-Newalland Ingrid Obernosterer.
- 28.06.2019
  Nouvelle UE de Licence3 - Réponses des microorganismes aux changements globaux
  Une nouvelle UE de Licence3 sera proposée à Sorbonne Université en avril 2020. Cette UE intitulée "Réponses des microorganismes aux changements globaux : conséquences écologique, sanitaires et sociétales (CHANGE)" présente différentes illustrations de la réponse des microorganismes aux changements globaux qui affectent la planète et les conséquences sur la santé des hommes, des animaux et de l’environnement...
- 26.06.2019
  Tara trace les plastiques des fleuves
  Le 23 mai, la goélette de la Fondation Tara Océan a quitté Lorient pour une expédition de six mois sur les fleuves européens. À son bord, une quarantaine de scientifiques chargés d’évaluer la concentration de déchets plastiques charriés par les fleuves et leur impact sur les organismes marins.
  Jean-François Gighiglione est le responsable de cette mission scientifique.
  
  Journal du CNRS
  https://lejournal...
- 12.06.2019
  Les sources hydrothermales profondes stimulent des efflorescences phytoplanctoniques dans l’océan Austral
  Une équipe internationale incluant le LOMIC (Stéphane BLAIN, Mathieu REMBAUVILLE) révèle pour la première fois la présence d’efflorescences phytoplanctoniques directement stimulées par les apports en fer dissous de sources hydrothermales profondes dans l’océan Austral. Cette découverte a été obtenue en combinant des observations de flotteurs profileurs avec des données historiques d’éléments traces...
- 09.05.2019
  Ina Deutschmann conference
  Ina Deutschmann, postdoc researcher at the Institut de Ciències del Mar, Barcelona, will give a seminar on Tuesday 21th May at 11:00, entitled: "Disentangling environmental effects in microbial association networks".
  http://www.singek.eu/ina-deutschmann/

Traductions :

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Highlight Publication

Genetic tool development in marine protists: emerging model organisms for experimental cell biology
Nature Methods
volume 17, pages 481–494(2020)

Diverse microbial ecosystems underpin life in the sea. Among these microbes are many unicellular eukaryotes that span the diversity of the eukaryotic tree...

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