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Laboratoire d'Océanographie Microbienne
UMR 7621

Le Laboratoire d'Océanographie MICrobienne (LOMIC) a été crée le 01 Janvier 2010. Cette Unité Mixte de Recherche UMPC-CNRS (UMR 7621) est rattachée à l'Institut National des Sciences de l'Univers (INSU) du CNRS, mais est aussi thématiquement en interaction forte avec l'Institut d'Ecologie et de l'Environnement (INEE) et l'Institut des Sciences Biologiques (INSB) du CNRS.

 

Le LOMIC rassemble des compétences dans les domaines de la biogéochimie marine, de l'écologie microbienne, de la biodiversité, de la physiologie et de l'écotoxicologie des microorganismes marins et des biotechnologies. Cette pluridisciplinarité permet d'aborder de manière originale des questions aux frontières de la science.

 

L’objectif général du LOMIC est d’étudier les interactions réciproques entre un milieu changeant et varié, l’océan, et les micro-organismes qui l’habitent de manière intégrative du gène à l'écosystème. Notre travail concerne tout à la fois des questions de recherche fondamentale (ex. réponses des microorganismes aux changements globaux de l'environnement) et de recherche appliquée avec des partenariats industriels (ex. bioremédiation, valorisation des microalgues).

25/02/16

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ACTUALITÉS

    • Campagne océanographique dans la région patagonniene au Chili

      Depuis sept ans, le programme COPAS SurAustral étudie le fjord Puyuhuapi, l'un des plus importants de la Patagonie Chilienne. Avec des profondeurs maximales dépassant les 200m, Puyuhuapi présente des évènements d’hypoxie récurrente (concentrations d’oxygène dissous dans la colonne d’eau inférieures à 1.4 mL par litre). L’augmentation de l’activité aquicole dans le fjord ces dernières années fait de...

    • Conférence Gerhard Herndl

      Conférence Mardi 12 juillet à 11h - Amphithéâtre
      Prof. Gerhard Herndl
      Université de Vienne, Dept. of Limnology and Bio-Oceanography
      "Microbial Transformation of Organic Carbon in the Dark Ocean: From Bulk Measurements to Individual Molecules"
       
      Microbial Oceanography Lab at the Univerity of Vienna:
      http://www.microbial-oceanography.eu/

    • Conférence David Kieber

      Conférence le 9 juin à 11h à l'amphithéâtre
      David J. KIEBER
      Department of Chemistry, State University of New York, College of Environmental Science and Forestry, Syracuse, NY
      Coupled Ocean-Atmosphere Loss of Refractory Marine Dissolved Organic MatterThe oceans hold a massive quantity of organic carbon that is greater than all terrestrial organic carbon biomass combined. Nearly all marine organic carbon...

    • Soutenance thèse Denisse Sanchez

      Denisse Sanchez a soutenu sa thèse intitulée "Rôle des mécanismes abiotiques et biotiques dans la dynamique de la matière organique dissoute dans les écosystèmes marins pélagiques (Méditerranée Nord Occidentale)" le Mardi 6 octobre 2015 à l'Observatoire Océanologique de Banyuls.
       
      Résumé :
      Dans la présente étude qui effectue un premier bilan de la distribution et du devenir de la CDOM/FDOM aux...

    • Accueil de Véronica Molina

      Dr. Véronica Molina from the Departamento de Biologia. Facultad de Ciencias Naturales y Exactas. Universidad de Playa Ancha (Chile) will be invited by the UPMC as Professor for one month at the LOMIC (september 2015).
       
      Dr Molina has extensive expertise in molecular techniques (metagenomics, proteomics and Q-PCR) and has been working on the regulation of marine nitrogen cycle for the last 10 years...

    • Découverte d’un mécanisme d’adaptation de certaines espèces de phytoplancton marin à la carence en fer

      Des chercheurs issus d’un consortium de laboratoires mené par le LOMIC ont précisé le rôle de la ferritine dans l'adaptation de certianes espèces de phytoplancton à la carence au fer.
      La ferritine est une protéine présente dans les cellules de très nombreux organismes, de l’homme à la bactérie, qui possède la capacité de stocker de grandes quantités de fer. En permettant la réutilisation du fer...

    • MOORE Foundation

      $8M awarded to scientists from the Gordon and Betty Moore Foundation to accelerate development of experimental model systems in marine microbial ecology
      Le LOMIC fait parti des bénéficiaires de l'initiative en Microbiologie Marine financé par la MOORE Foundation pour accélérer le développement de modèles expérimentaux de microorganismes marins.
       
      Communiqué de presse de MOORE Foundation
       

    • Lien entre diversité bactérienne et cycle du carbone dans l’océan Austral

      Des chercheurs du Laboratoire d’océanographie microbienne (LOMIC/OOB, CNRS / UPMC) et du Laboratoire d’océanologie et de géosciences (LOG, CNRS / Université du Littoral Cote d’Opale / Université de Lille 1) ont collecté, pendant la campagne KEOPS2 dans l’océan Austral, un jeu de données inédit combinant des mesures de flux de carbone et de biodiversité microbienne. Les chercheurs ont ainsi pu démontrer...

    • Séminaire Alessandro Tagliabue

      Le Dr. Alessandro TAGLIABUE est accueilli au LOMIC par Stéphane BLAIN du 30 juin au 3 juillet 2015.
       
      Il donnera à cette occasion une conférence le mercredi 1er juillet à 11h (Amphithéâtre A. Guille)
      Role of Hydrothermal Vents in the Global Ocean Iron Cycle
      SUMMARY:
      Hydrothermal vents were only discovered in the late 1970s thanks to advances in undersea technology. Around the same time, new...

    • Interlab meeting 2015 ICM-LOMIC

      La 3ème rencontre Interlab MICROBES: Ecology and Biogeochemistry entre le LOMIC et l'Institut de Ciences del Mar (ICM) a eu lieu les 4 et 5 juin 2015 à Barcelona.
      Organisateurs : Ingrid Obernosterer (LOMIC) & Josep Gasol (ICM)
       
      Thursday June 4th
      15:00 Continental erosion and the rise of diatoms - Pedro Cermeño (ICM)
      15:15 Cocktail of organic matter and priming effect - Fabien Joux (LOMIC)...

    • Soutenance de thèse Marine Blanchet

      Marine BLANCHET a soutenu sa thèse en cotutelle UPMC - Université Conception (Chili) et intitulée "Metabolic and composition changes in marine bacterial community exposed to variable natural organic matter bioreactivity" le Vendredi 16 Janvier 2015 devant le jury composé de :
      Dr. Emma Rochelle-Newall (rapporteur)
      Dr. Cristian Vargas (rapporteur)
      Dr. Thierry Bouvier (examinateur)
      Dr. Cristian Gallardo...

    • Soutenance de thèse Hugo Botebol

       
      Hugo Botebol a soutenu sa thèse le jeudi 11 décembre intitulée : "Influence de la lumière et de l'horloge circadienne dans la gestion de la carence en chez le genre Ostreococcus"
       
      Résumé: Le fer est un élément présent en abondance dans la croûte terrestre, indispensable à la quasi totalité des êtres vivants. Cependant, en milieu marin la biodisponibilité du fer est souvent faible et sporadique...

    • Publication in Plant Cell: Efficient gene targeting and foreign DNA removal by homologous recombination in the picoeukaryote Ostreococcus

      With fewer than 8000 genes and a minimalist cellular organization, the green picoalga Ostreococcus tauri is one of the simplest photosynthetic eukaryotes. Ostreococcus tauri contains many plant-specific genes but exhibits a very low gene redundancy. The haploid genome is extremely dense with few repeated sequences and rare transposons. Thanks to the implementation of genetic transformation and vectors...

    • Publication in Nature Geosciences: Carbonate counter pump stimulated by natural iron fertilization in the Polar Frontal Zone

       
      Une nouvelle étude réalisée dans l'océan Austral par une équipe internationale de scientifiques impliquant Ian SALTER du Laboratoire d’Océanographie Microbienne (actuellement en détachement au Alfred Wegener Institute, Germany), révèle que la réponse de l'écosystème marin à un enrichissement naturel en fer est plus complexe et moins efficace à long terme, du point de vue du stockage du dioxyde...

    • Publication in Cell journal: Determination and Inference of Eukaryotic Transcription Factor Sequence Specificity

      Détermination et prédiction des sites de reconnaissance des facteurs de transcription eucaryotes
      Un consortium international mené par des chercheurs de l’Université de Toronto, auquel est associé le Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC, UMR7621 UPMC-CNRS, Observatoire Océanologique, Banyuls sur Mer) a déterminé et prédit les séquences ADN de fixation d’environ un tiers des facteurs de...

    • Special Issue Publication Announcement: Microbial Ecotoxicology

      A special issue of "Environmental Science and Pollution Research" (IF 2.76) dedicated to « Microbial Ecotoxicology » is open from 1st October 2014 to 31th January 2015.
      This special issue welcomes the most recent developments, researches and ideas in microbial ecotoxicology, with no restriction of the ecosystem studied. Potential topics include, but are not limited to:• microbial bioassays, biomarkers...

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Highlight Publication

Landa M., Blain S., Christaki U., Monchy S., Obernosterer I. (2016) Shifts in bacterial community composition associated with increased carbon cycling in a mosaic of phytoplankton blooms. ISME Journal 10:39–50
 
Marine microbes have a pivotal role in the marine biogeochemical cycle of carbon...

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Contact

Directeur : Fabien JOUX

Tel : 33 (0)4 68 88 73 42

Fax : 33 (0)4 68 88 73 98

E-mail : joux @ obs-banyuls.fr

 

Gestion - Secrétariat : Frédérique SANZ

Tel : 33 (0)4 68 88 73 01

Fax : 33 (0)4 68 88 73 98

E-mail : frederique.sanz @ obs-banyuls.fr

 

Le LOMIC en chiffres


5 Chercheurs CNRS
4 Enseignant-chercheurs
7 Personnels techniques
2 Post doctorants
7 Etudiants en thèse

2 Etudiants Master2