Le Laboratoire d'Océanographie MICrobienne (LOMIC) a été crée le 01 Janvier 2010. Cette Unité Mixte de Recherche UMPC-CNRS (UMR 7621) est rattachée à l'Institut National des Sciences de l'Univers (INSU) du CNRS, mais est aussi thématiquement en interaction forte avec l'Institut d'Ecologie et de l'Environnement (INEE) et l'Institut des Sciences Biologiques (INSB) du CNRS.
Le LOMIC rassemble des compétences dans les domaines de la biogéochimie marine, de l'écologie microbienne, de la biodiversité, de la physiologie et de l'écotoxicologie des microorganismes marins et des biotechnologies. Cette pluridisciplinarité permet d'aborder de manière originale des questions aux frontières de la science.
L’objectif général du LOMIC est d’étudier les interactions réciproques entre un milieu changeant et varié, l’océan, et les micro-organismes qui l’habitent de manière intégrative du gène à l'écosystème. Notre travail concerne tout à la fois des questions de recherche fondamentale (ex. réponses des microorganismes aux changements globaux de l'environnement) et de recherche appliquée avec des partenariats industriels (ex. bioremédiation, valorisation des microalgues).
ACTUALITÉS
12.05.2017
Conférence Ramon Massana (Insitut de Ciènces del Mar, CSIC, Barcelona)
Ramon Massana will present a seminar on Tuesday May 23 at 14:30 (Salle de conférence), entitled :
"Marine picoeukaryotes: Temporal and spatial dynamics accross large datasets"
Ramon Masssana obtained his PhD in Biology from the Autonomous University of Barcelona in 1993, focusing on trophic microbial interactions in a stratified lake. Afterwards, he spent two years as a postdoc in the University of...11.05.2017
Post doctotal position - biogeochemistry and microbial ecology
Researchers of the LOMIC need collaborators for their activities in the frame of linking marine biogeochemsitry and microbial ecology.
Details of the position
Contact: Pascal CONAN (conan@obs-banyuls.fr)
11.05.2017
Comprendre le climat dans la fureur de l'océan Austral
A la fin de 2016, la mission SOCLIM (Southern Ocean and Climate) a exploré les liens entre océan et climat dans la fureur de l’océan Austral. Il est possible de revivre en vidéo cette aventure scientifique et humaine grâce à deux journalistes (Le Monde, Universciences.tv) présents à bord du navire océanographique Marion-Dufresne.
Dans ce premier épisode, les trois responsables scientifiques de ce programme...
15.03.2017
4th Interlab Meeting Banyuls - Barcelona. Microbes & Microbis
The 4th Interlab Meeting Microbes: Biogeochemistry & Ecology, organized by LOMIC (Banyuls) and the Departement of Marine Biology and Oceanography (Institute of Marine Sciences, Barcelona) will be held at Banyuls on 22/23th May 2017.
Meeting contacts:
Ingrid Obernosterer, CNRS: ingrid.obernosterer@obs-banyuls.fr
Josep M. Gasol, CSIC: pepsol@icm.cisic.es
03.03.2017
Workshop LEFE-CYBER : Cycles biogéochimiques et diversité du vivant dans l’océan
Du 29 Mai 14:00h au 30 Mai 13:00h 2017 à l’Observatoire Océanologique de Banyuls.
Les micro- et macro-organismes sont des acteurs clef pour les cycles biogéochimiques des éléments majeurs et traces dans l’océan, le sédiment et aux interfaces. La prise en compte des caractéristiques biologiques des organismes et leur organisation au sein d’écosystèmes en termes de diversité, de fonctions ou d’interactions...
02.03.2017
Arrivée de Martine DEVIC au LOMIC, DR CNRS
Martine DEVIC, Directrice de Recherche au CNRS, a rejoint le LOMIC en janvier 2017.
Martine DEVIC a été responsable de l’équipe Développement de la graine chez Arabidopsis au LGDP de l’Université de Perpignan (1999-2010), puis co-responsable de l’ERL5300 CNRS-IRD Régulations Epigénétiques et Développement de la Graine (2011-2016) à Montpellier. A présent, son projet porte sur l’étude des mécanismes...
02.03.2017
Offres de thèse 2017
Le LOMIC propose deux sujets de thèse à l'Ecole Doctorale Sciences de l'Environnement de l'UPMC (ED129) :
- Impacts des polluants, des métaux traces et des éléments biogènes apportés par les fleuves et les résurgences d'eaux souterraines sur la productivité des écosystèmes marins côtiers en Méditerranée.
Directeur de thèse : CONAN Pascal (HDR), Co-directeur de thèse : PUJO-PAY Mireille
Contact : 04 68...
01.03.2017
Accueil de Cicéro Alvarez, PhD student
Cicero Alvares a rejoint le LOMIC pour sa troisième année de thèse intitulée « Interactions entre les facteurs abiotiques et l’horloge biologique sur le déclenchement des blooms phytoplanctoniques » et commencée à Sao Paulo au Brésil.L’objectif principal de ce projet est de vérifier comment les gènes de l’horloge régulent les taux de croissance saisonniers de l’algue Ostreococcus tauri sous différentes...
14.03.2017
Conférence Urania Christaki
Urania Christaki will present a seminar on Tuesday February 14 at 11:00h, entitled :
"The hidden diversity in a coastal marine ecosystem"
Urania Christaki, received her Bachelor degree in Biology from University of Athens. Then, she conducted two master degrees, first in Hydrobiology (University of St. Petersbourg, Russia) and then in Oceanography (University of Athens). In 1995 she defended her Ph...
05.01.2017
Soutenance HDR de Camila Fernandez
Camila Fernandez soutiendra son habilitation à diriger des recherches le vendredi 20 janvier 2017 à Banyuls.
Distribution, regulation and diversity of Nitrification and N2 fixation, two key processes of the marine nitrogen cycle
Résumé : Le cycle marin de l’azote fourni des sels nutritifs et/ou énergie pour une large fraction de la communauté microbienne. Il agit dans un continuum de conditions physico-chimiques...
08.11.2016
Une plateforme microalgale au service de la biotechnologie
La société Microphyt et le Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC – UPMC/CNRS) ont créé le laboratoire de recherche commun OTARI (acronyme de Ostreococcus tauri de la Recherche à l’Industrie), dont les coresponsables sont François-Yves Bouget (partie académique), directeur de recherche CNRS, et Rémi Pradelles (partie industrielle), en 2014 afin de développer une plateforme microalgale permettant...
01.10.2016
Démarrage de trois nouvelles thèse au LOMIC en 2016
Trois nouvelles thèses ont démarrées au LOMIC en octobre 2016 :
Coco KOEDOODER étudiera l’interaction phytoplancton-bactéries dans le couplage des cycles du fer et du carbone dans l’océan.
Yan LIU travaillera sur la respiration et la matière organique dans l'Océan Austral.
Pavla DEBELJAK travaillera sur le couplage des cycles du carbone et du fer au travers du métabolisme microbien dans l'Océan Austral...
20.09.2016
Soutenance de thèse de Mathieu Rembauville
Mathieu Rembauville a soutenu sa thèse intitulée « Ecological vectors of carbon and biomineral export in the Southern Ocean » le 20 septembre 2016 devant un jury composé de:
Stephanie Henson NOC, Southampton, Angleterre Rapporteur
Christine Klaas AWI, Bremerhaven, Allemagne Rapporteur
Tom Trull CSIRO, Hobart, Australie Examinateur
Bernard Quéguiner MIO, Marseille, France Examinateur
Damien Cardinal LOCEAN...
29.08.2016
Participation du LOMIC à l'expédition Green Edge en Arctique pour étudier l’impact de la réduction de la banquise sur la productivité de l’écosystème
Le LOMIC est impliqué dans le projet de recherche international Green Edge (« Phytoplankton spring bloom in the Arctic Ocean: past, present and future response to climate variations, and impact on carbon fluxes and the marine food web » 2014-2018 (http://www.greenedgeproject.info)) qui s’intéresse à la productivité primaire dans l’Océan Arctique et au devenir de la matière organique produite par le...
23.08.2016
Campagne océanographique dans la région patagonniene au Chili
Depuis sept ans, le programme COPAS SurAustral étudie le fjord Puyuhuapi, l'un des plus importants de la Patagonie Chilienne. Avec des profondeurs maximales dépassant les 200m, Puyuhuapi présente des évènements d’hypoxie récurrente (concentrations d’oxygène dissous dans la colonne d’eau inférieures à 1.4 mL par litre). L’augmentation de l’activité aquicole dans le fjord ces dernières années fait de...
12.07.2016
Conférence Gerhard Herndl
Conférence Mardi 12 juillet à 11h - Amphithéâtre
Prof. Gerhard Herndl
Université de Vienne, Dept. of Limnology and Bio-Oceanography
"Microbial Transformation of Organic Carbon in the Dark Ocean: From Bulk Measurements to Individual Molecules"
Microbial Oceanography Lab at the Univerity of Vienna:
http://www.microbial-oceanography.eu/
Highlight Publication
Use of plankton-derived vitamin B1 precursors, especially thiazole-related precursor, by key marine picoeukaryotic phytoplankton
R. W Paerl, F.-Y. Bouget, J-C. Lozano, V. Vergé,P. Schatt, E. E. Allen, B. Palenik and F. Azam
The ISME Journal (2016)
Several cosmopolitan marine picoeukaryotic phytoplankton...
Contact
Directeur : Fabien JOUX
Tel : 33 (0)4 68 88 73 42
E-mail : joux @ obs-banyuls.fr
Gestion - Secrétariat : Frédérique SANZ
Tel : 33 (0)4 68 88 73 01
E-mail : frederique.sanz @ obs-banyuls.fr
Assistant de prévention : Philippe CATALA
Tel : 33 (0)4 68 88 73 53
E-mail : catala@obs-banyuls.fr
Formation permanente : Jocelyne CAPARROS
Tel : 33 (0)4 68 88 73 85
E-mail : jocelyne.caparros @ obs-banyuls.fr
Le LOMIC en chiffres
6 Chercheurs CNRS
4 Enseignant-chercheurs
8 Personnels techniques
4 Post doctorants
8 Etudiants en thèse
4 Etudiants Master2