Aller au contenu Aller au menu Aller à la recherche

accès rapides, services personnalisés
Laboratoire d'Océanographie Microbienne
UMR 7621

Jean-François GHIGLIONE

Ghiglione Jean-François

Directeur de recherche CNRS

 

Laboratoire d'Océanographie Microbienne (LOMIC) UMR7621

1 Avenue Fabre - 66650 Banyuls sur mer

Tél: (33) 4 68 88 73 16

E-mail: ghiglione@obs-banyuls.fr

 

-Co-fondateur de la Société Plastic@Sea

-Co-directeur du GDR Polymères et Océans

-Co-directeur du RTP Ecotoxicologie microbienne (EcotoxicoMic)

-Membre du conseil scientifique de l'IFREMER

-Membre du conseil scientifique du Club d'entreprise BeMed

 

 

Thématiques de recherche:

  • Ecotoxicologie microbienne marine: réponse des microorganismes aux pollutions d'origines anthropiques (plastiques, pétroles, métaux lourds, pesticides) et mise en place de stratégies de surveillance et de dépollution de sites contaminés par bioremédiation.
  • Ecologie microbienne marine: rôle des microorganismes dans le fonctionnement du cycle biogéochimique du carbone dans les Océans, en relation avec des problématiques de changement climatique.

Diffusion du travail

  • Auteur ou co-auteur de plus de 65 publications de rang A et de 7 chapitres de livres. Editeur en chef de 2 issues spéciales.
  • Présentations à plus de 50 congrès internationaux et plus de 30 congrès nationaux (organisateur de 5 congrès). 
  • Plus de 90 communiqués de presse, 37 conférences publiques, 48 interventions télé/radio

Publications récentes:

- Jacquin et al. 2019. Microbial ecotoxicology of marine plastic debris: a review on colonization and biodegradation by the ‘plastisphere’ Frontiers in microbiology 10:865.

- Planes et al. 2019. The Tara Pacific expedition: a pan-ecosystemic approach of the “-omics” complexity of coral reef holobionts across the Pacific Ocean. Plos Biology, 23;17(9):e3000483.

- Lambert et al. 2019. Rhythmicity of coastal marine picoeukaryotes, bacteria and archaea despite irregular environmental perturbations. ISME Journal 13(2):388-401.

- Catao et al. 2019. Shear stress as a major driver of marine biofilm communities in the NW Mediterranean Sea. Frontiers in microbiology 10:1768.

- Meistertzheim et al. 2019. Development of a quantitative PCR-high resolution melting assay for absolute measurement of coral-Symbiodiniaceae associations and its application to investigating variability at two geographic scales. Marine Biology 166:13.

- Fichez et al. 2019. Spatiotemporal variability in Terminos Lagoon (Mexico) waters during the 2009-2010 drought reveals upcoming trophic status shift in response to climate change. Regional Environmental Change 19:1787-1799.

- Dussud et al. 2018. Evidence of niche partitioning among bacteria living on plastics, organic particles and surrounding seawaters. Environmental Pollution 236: 807-816.

- Chapron et al. 2018 Microplastics are a serious threat for deep-water coral reefs. Scientific reports  8:15299.

- Ziegler et al. 2018. Status of coral reefs of Upolu (Independent State of Samoa) in the South West Pacific and recommendations to promote resilience and recovery of coastal ecosystems. Marine Pollution Bulletin 129:392-398.

- Celussi et al. 2018. Planktonic prokaryote and protist communities in a submarine canyon system in the Ligurian Sea (NW Mediterranean) Progress in Oceanography DOI: 10.1016/j.pocean.2018.10.002

- Dussud et al. 2018. Colonization of non-biodegradable and biodegradable plastics by marine microorganisms. Frontiers in microbiology 9:1571.

Cliquer ici pour accéder à liste complète des publications et communiqués de presse 

 

Responsabilités administratives:

Direction d'équipes:

 

Programmes de recherches:

- Coordinateur de 10 programmes nationaux (dont 2 ANR) et de 3 internationaux (dont 1 programme européen)

- Participation à plus de 35 programmes scientifiques dont 26 nationaux (dont 6 projets ANR) et à 9 internationaux (dont 4 projets Européens) avec plus de 300 jours de mission en mer (13 campagnes océanographiques).

- Projets en cours :

  • ANR-OXOMAR: Dégradation biotique et abiotique et toxicité des plastiques oxo-biodégradables en milieu marin; 2017-2021. Financé par ANR (coordinateur JF Ghiglione)
  • PHA-BIO: Biodégradabilité de polymères biosourcés de type PHA en milieu marin Financé par CNRS-TOTAL; 2019 (Coordinateur JF Ghiglione)
  • BIOGEOPLAST: Impact des micro plastiques sur les cycles biogéochimiques et les micro-organismes en milieu marin. Financé par CNRS; 2019 (Coordinateur JF Ghiglione)
  • MICRO-BEADS: Etude de la composition des microbilles, de leurs conditions de biodégradabilité et de leur toxicité en milieu marin (2017-2018). Financé par le Ministère de la transition écologique et solidaire (Coordinateur JF Ghiglione)
  • BIOTIGES: Etude de la composition des bâtonnets ouatés à usage domestique dont la tige est en plastique, de leurs conditions de biodégradabilité et de leur toxicité en milieu marin (2018-2019). Financé par le Ministère de la transition écologique et solidaire (Coordinateur: JF Ghiglione)

  • TARA-PACIFIC: Biodiversité des récifs coralliens et leur évolution face au changement climatique et aux pressions anthropiques (coordinateur S. Planes et D. Allemand) Financé par la fondation TARA et en partenariat avec le Génoscope.
  • ANR-CARIOCA: Coral reef acclimatization to ocean acidification at CO2 seeps (coordinateur R Rodolfo Metalpa - IRD Nouméa) [2016-2020]
  • ECOL-EAU: Combinaison de bio-essais pour l'évaluation des risques écologiques en milileu littoral; 2016. Financé par le CNRS - PEPS-FaiDoRA (coordinateur JF Ghiglione) - suite du projet VERMEILLECOTOX - Qualité Ecotoxicologique du littoral de la côte Vermeille  ; 2012-2015. Financé par l’Agence des Aires Marines Protégées et le Fond Européen pour la Pêche (Coordinateur : JF Ghiglione)
  • ANR-SGD: Décharges d'eaux sous-terraines: une source cachée de composés chimiques à l'interface terre-mer; 2016-2019. Financé par ANR (coordinateur P van Beek)

 

 

Encadrement d’étudiants, habilitation à diriger les recherches, culture scientifique:

  • Directeur de 5 thèses, 6 post-doctorants, 15 stagiaires de niveau Master 1 et 2, BTS, ou Ecole d’ingénieur.
  •  Habilitation à diriger les recherches (soutenue le 5 Juin 2012) Université Paris 6 - Voir le mémoire d’habilitation (pdf)

Thèses en ligne:

-Thèse en ligne de Claire Dussud: Caractérisation des communautés microbiennes associées à la colonisation des déchets plastiques en mer (soutenue le 2 Oct 2017) 

- Thèse en ligne de Caroline Sauret : Ecologie des communautés bactériennes marines soumises à une pollution pétrolière: influence des facteurs environnementaux, de la prédation et de la récurrence des pollutions (soutenue le 15 Décembre 2011)

- Thèse en ligne de Tatiana Severin : Régulation des cycles biogéochimiques par les communautés microbiennes pélagiques sous influence de perturbations physiques à méso-échelle (soutenue 23 septembre 2014)

 

Cours en ligne

 

Jean-François Ghiglione (ghiglione @ obs-banyuls.fr) - 05/12/19

Traductions :

    Le LOMIC en chiffres

    8 Chercheurs CNRS
    4 Enseignant-chercheurs

    2 Chercheurs accueillis

    9 Tech/Ingénieurs

    2 AI CDD
    5 Post doctorants
    9 Etudiants en thèse