Aller au contenu Aller au menu Aller à la recherche

accès rapides, services personnalisés
Laboratoire d'Océanographie Microbienne
UMR 7621

Jean-Claude LOZANO

 

 Dr. LOZANO Jean-Claude

Ingénieur de recherche CNRS, BAP A

Laboratoire d'Océanographie Microbienne (LOMIC) - UMR 7621 CNRS-UPMC

Avenue Fontaulé - 66650 Banyuls sur mer, France

Tél: 33 (0)4 68 88 73 97

E-mail: jean-claude.lozano @ obs-banyuls.fr

Carrière

2009-2017 : Ingénieur de recherche dans l'UMR 7621 LOMIC : équipe "Biologie systémique et réponses environnementales" et depuis 2014 sur les axes axes thématiques "Régulation des fonctions microbiennes par les paramètres environnementaux" et "Ecotoxicologie microbienne marine et ingénierie métabolique".

1995-2009 : Ingénieur de recherche dans l'UMR7628 "Modèles en Biologie Cellulaire et Evolutive": équipe "Régulation Moléculaire du Cycle Cellulaire" (labellisé Ligue Nationale contre le Cancer)

Cursus universitaire

1994 : Thèse d'Université Claude Bernard Lyon 1. Centre International de Recherches sur le Cancer dans    l'équipe "Méchanismes de la Cancérogénèse"

1989 : DEA (master II) Biologie cellulaire et microbiologie. Université de Marseille

1988 : Maîtrise en Biochimie. Université de Montpellier

1987 : Licence en Biochimie. Université de Montpellier

Compétences

Génétique, biologie marine, biotechnologie, biologie moléculaire, biochimie

 

Biologie moléculaire

Méthodes autour de la PCR et notamment l'isolement de nouveaux gènes (PCR dégénéré, RACE, marche sur chromosome...), criblage sur colonie bactérienne ou microalgue.

Extraction et purification des acides nucléiques: ADN, ARN, plasmides/ Northern, Southern blots et criblage de banques d'ADNc

ADN recombinant et génie génétique: RFLP, sous-clonage, techniques de transformation en bactérie, levure et microalgues, criblages

 

Protéines recombinantes et biochimie

SDS PAGE-Western blot

Proteines recombinantes (étiquettes/ corps d'inclusion pour production d'anticorps…)

Analyse des interactions protéine-protéine par GST pulldown, co-immunoprécipation avec protéines étiquettées ou pas, double-hybride en levure dirigé

Recherche de nouvelles interactions par double-hybride en levure sur banque (depuis l'analyse des protéines ou domaines appâts potentiels jusqu'à l'obtention de la protéine proie entière et validation de l'interaction).

 

Culture cellulaire : bactéries, levures, microalgues 

 

Bioinformatique : NCBI, UNIGENE, ENSEMBL, JGI, bioinformatics.psb  genomes

outils : BLAST, Clustal,  FASTA, ORF, GenScan, EXPASY proteomic tools

soumission de nouvelles séquences dans banque EMBL.

Publications et brevets

 

Enveloppes SOLEAU

1. Enveloppe N° 517324 220914 : François-Yves Bouget, Jean-Claude Lozano, Valérie Vergé et Philippe Schatt. « Procédé de fabrication de transgènes pour transformation de Ostreococcus tauri ».

2. Enveloppe N° 517325 220914. François-Yves Bouget, Jean-Claude Lozano, Valérie Vergé et Philippe Schatt «  Procédé de transformation d'Ostreococcus tauri par electroporation ».

3. Enveloppe N°531412 200215. François-Yves Bouget, Philippe Schatt, Jean-Claude Lozano et Valérie Vergé. « Culture Cellulaire et production d’exopolysaccharides chez Ostreococcus tauri ».

 

Publications

  1. Hugo Botebol, Gaelle Lelandais, Christophe Six, Emmanuel Lesuisse, Arnaud Meng, Lucie Bittner, Stéphane Lecrom, Robert Sutak, Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, Valérie Vergé, Stéphane Blain, François-Yves Bouget: Acclimation of a low iron adapted Ostreococcus strain to iron limitation through cell biomass lowering. Scientific Reports 12/2017; 7(1)., DOI:10.1038/s41598-017-00216-6
  2. Ryan W Paerl, Francois-Yves Bouget, Jean-Claude Lozano, Valérie Vergé, Philippe Schatt, Eric E Allen, Brian Palenik, Farooq Azam: Use of plankton-derived vitamin B1 precursors, especially thiazole-related precursor, by key marine picoeukaryotic phytoplankton. The ISME Journal 12/2016; 11(3)., DOI:10.1038/ismej.2016.145
  3. Gaëlle Lelandais, Ivo Scheiber, Javier Paz-Yepes, Jean-Claude Lozano, Hugo Botebol, Jana Pilátová, Vojtěch Žárský, Thibaut Léger, Pierre-Louis Blaiseau, Chris Bowler, François-Yves Bouget, Jean-Michel Camadro, Robert Sutak, Emmanuel Lesuisse: Ostreococcus tauri is a new model green alga for studying iron metabolism in eukaryotic phytoplankton. BMC Genomics 12/2016; 17(1)., DOI:10.1186/s12864-016-2666-6
  4. Hugo Botebol, Emmanuel Lesuisse, Robert Šuták, Christophe Six, Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, Valérie Vergé, Amos Kirilovsky, Joe Morrissey, Thibaut Léger, Jean-Michel Camadro, Audrey Gueneugues, Chris Bowler, Stéphane Blain, François-Yves Bouget: Central role for ferritin in the day/night regulation of iron homeostasis in marine phytoplankton. Proceedings of the National Academy of Sciences 11/2015; 112(47)., DOI:10.1073/pnas.1506074112
  5. Matthew T. Weirauch, Ally Yang, Mihai Albu, A.G. Cote, Alejandro Montenegro-Montero, Philipp Drewe, Hamed S. Najafabadi, Samuel A. Lambert, Ishminder Mann, Kate Cook, Hong Zheng, Alejandra Goity, van Bakel H, Lozano JC, Mary Galli, Lewsey MG, Eryong Huang, Tuhin Mukherjee, Xiaoting Chen, Reece-Hoyes JS, Sridhar Govindarajan, Gad Shaulsky, Albertha J.M. Walhout, Bouget FY, Gunnar Ratsch, Luis F. Larrondo, Joseph R. Ecker, Timothy R. Hughes: Determination and Inference of Eukaryotic Transcription Factor Sequence Specificity. Cell 09/2014; 158(6):1431-43., DOI:10.1016/j.cell.2014.08.009
  6. Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, Hugo Botebol, Valérie Vergé, Emmanuel Lesuisse, Stéphane Blain, Isabelle A. Carré, François‐Yves Bouget: Efficient gene targeting and foreign DNA removal by homologous recombination in the picoeukaryote Ostreococcus. The Plant Journal 04/2014; 78(6)., DOI:10.1111/tpj.12530
  7. François-Yves Bouget, Marc Lefranc, Quentin Thommen, Benjamin Pfeuty, Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, Hugo Botebol, Valérie Vergé: Transcriptional versus non-transcriptional clocks: A case study in Ostreococcus. Marine Genomics 04/2014; 14., DOI:10.1016/j.margen.2014.01.004
  8. Valérie Vergé, Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, Gérard Peaucellier: SGEBP, a giant protein from starfish oocytes able to interact with ERK. Molecular Reproduction and Development 10/2013; 80(10)., DOI:10.1002/mrd.22210
  9. Jean-Claude Lozano, Valérie Vergé, Philippe Schatt, Jennifer L Juengel, Gérard Peaucellier: Evolution of Cyclin B3 Shows an Abrupt Three-Fold Size Increase, due to the Extension of a Single Exon in Placental Mammals, Allowing for New Protein-Protein Interactions. Molecular Biology and Evolution 07/2012; 29(12)., DOI:10.1093/molbev/mss189
  10. El Batoul Djouani-Tahri, Frédéric Sanchez, Jean-Claude Lozano, François-Yves Bouget: A Phosphate-Regulated Promoter for Fine-Tuned and Reversible Overexpression in Ostreococcus: Application to Circadian Clock Functional Analysis. PLoS ONE 12/2011; 6(12):e28471., DOI:10.1371/journal.pone.0028471
  11. Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, Valérie Vergé, Jérôme Gobinet, Vincent Villey, Gérard Peaucellier: CDK5 is Present in Sea Urchin and Starfish Eggs and Embryos and Can Interact With p35, Cyclin E and Cyclin B3. Molecular Reproduction and Development 05/2010; 77(5):449-61., DOI:10.1002/mrd.21165
  12. Laure Lapasset, Bérengère Pradet-Balade, Valérie Vergé, Jean-Claude Lozano, Nathalie Oulhen, Patrick Cormier, Gérard Peaucellier: Cyclin B synthesis and rapamycinsensitive regulation of protein synthesis during starfish oocyte meiotic divisions. Molecular Reproduction and Development 11/2008; 75(11):1617 - 1626., DOI:10.1002/mrd.20905
  13. Yasmine Even, Sandrine Durieux, Marie-Line Escande, Jean Claude Lozano, Gérard Peaucellier, Dominique Weil, Anne-Marie Genevière: CDC2L5, a Cdk-Like kinase with RS domain, interacts with the ASF/SF2-associated protein p32 and affects splicing in vivo. Journal of Cellular Biochemistry 10/2006; 99(3):890-904., DOI:10.1002/jcb.20986
  14. Laure Lapasset, Bérengère Pradet-Balade, Jean-Claude Lozano, Gérard Peaucellier, André Picard: Nuclear envelope breakdown may deliver an inhibitor of protein phosphatase 1 which triggers cyclin B translation in starfish oocytes. Developmental Biology 10/2005; 285(1):200-10., DOI:10.1016/j.ydbio.2005.06.016
  15. Nicolas Offner, Jean Derancourt, Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, André Picard, Gérard Peaucellier: Cybip, a starfish cyclin B-binding protein, is involved in meiotic M-phase exit. Biochemical and Biophysical Research Communications 02/2003; 300(1):121-7., DOI:10.1016/S0006-291X(02)02797-3
  16. B Pradet-Balade, J.P. Medema, M López-Fraga, J.C. Lozano, G.M. Kolfschoten, A Picard, C Martínez-A, J.A. Garcia-Sanz, M Hahne: An endogenous hybrid mRNA encodes TWE-PRIL, a functional cell surface TWEAK-APRIL fusion protein. The EMBO Journal 12/2002; 21(21):5711-20., DOI:10.1093/emboj/cdf565
  17. Delphine Guillebault, Souphatta Sasorith, Evelyne Derelle, Jean-Marie Wurtz, Jean-Claude Lozano, Scott Bingham, Laszlo Tora, Hervé Moreau: A New Class of Transcription Initiation Factors, Intermediate between TATA Box-binding Proteins (TBPs) and TBP-like Factors (TLFs), Is Present in the Marine Unicellular Organism, the Dinoflagellate Crypthecodinium cohnii. Journal of Biological Chemistry 11/2002; 277(43):40881-6., DOI:10.1074/jbc.M205624200
  18. Jean-Claude Lozano, Eric Perret, Philippe Schatt, Cécile Arnould, Gérard Peaucellier, André Picard: Molecular Cloning, Gene Localization, and Structure of Human Cyclin B3. Biochemical and Biophysical Research Communications 03/2002; 291(2):406-13., DOI:10.1006/bbrc.2002.6458
  19. Jenifer Croce, Guy Lhomond, Jean-Claude Lozano, Christian Gache: ske-T, a T-box gene expressed in the skeletogenic mesenchyme lineage of the sea urchin embryo. Mechanisms of Development 09/2001; 107(1-2):159-162., DOI:10.1016/S0925-4773(01)00470-1
  20. Francois Marqués, J L Moreau, Gerard Peaucellier, J C Lozano, Philippe Schatt, Andre Picard, Isabelle Callebaut, Eric Perret, A M Genevière: A new subfamily of high molecular mass CDC2-related kinases with PITAI/VRE motifs. Biochemical and Biophysical Research Communications 01/2001; 279(3):832-7., DOI:10.1006/bbrc.2000.4042
  21. J L Moreau, François Marques, Abdelhamid Barakat, Philippe Schatt, J C Lozano, Gérard Peaucellier, André Picard, A M Genevière: Cdk2 Activity Is Dispensable for the Onset of DNA Replication during the First Mitotic Cycles of the Sea Urchin Early Embryo. Developmental Biology 09/1998; 200(2):182-97., DOI:10.1006/dbio.1998.8961
  22. J C Lozano, Philippe Schatt, François Marquès, Gérard Peaucellier, Philippe Fort, J P Féral, A M Genevière, André Picard: A Presumptive Developmental Role for a Sea Urchin Cyclin B Splice Variant. The Journal of Cell Biology 02/1998; 140(2):283-93.
  23. Corinne Galiana, Jean-Claude Lozano, Brigitte Bancel, Hisayoshi Nakazawa, Hiroshi Yamasaki: High frequency of Ki-ras amplification and p53 gene mutations in adenocarcinomas of the human esophagus. Molecular Carcinogenesis 12/1995; 14(4):286-93., DOI:10.1002/mc.2940140409
  24. Nikolai M. Mironov, Anne‐Marie Aguelon, Elysia Hollams, Jean-Claude Lozano, Hiroshi Yamasaki: Microsatellite alterations in human and rat esophageal tumors at selective loci. Molecular Carcinogenesis 05/1995; 13(1):1-5., DOI:10.1002/mc.2940130102
  25. Jean Claude Lozano, Hisayoshi Nakazawa, Marie‐Pierre Cros, R Cabral, Hiroshi Yamasaki: G→A mutations in p53 and Ha-ras genes in esophageal papillomas induced by N-nitrosomethylbenzylamine in two strains of rats. Molecular Carcinogenesis 01/1994; 9(1):33-9., DOI:10.1002/mc.2940090107

Gènes isolés et séquences déposées

1. Equus caballus cyclin B3 (CCNB3), mRNA

4,675 bp linear mRNA

NM_001281817.1 GI:529250180

 

2. Marthasterias glacialis mRNA for SGEBP protein

20,154 bp linear mRNA

HF934107.1 GI:527316253

 

3. Trichosurus vulpecula partial mRNA for activator of sperm specific transcription factor (FLH5/ACT gene)

777 bp linear mRNA

HE801368.1 GI:406033435

 

4. Trichosurus vulpecula partial mRNA for germ cell-less (GMCL 1 gene)

1,745 bp linear mRNA

HE801369.1 GI:406033437

 

5. Ornithorhynchus anatinus partial mRNA for c1orf14

1,358 bp linear mRNA

HE801370.1 GI:406033439

 

6. Canis familiaris mRNA for cyclin B3 (ccnb3 gene), splice variant 2

1,149 bp linear mRNA

AM261211.1 GI:371905518

 

7. Sus scrofa mRNA for cyclin B3 (CCNB3 gene), splice variant 1

4,188 bp linear mRNA

AM261212.1 GI:371905520

 

8. Sus scrofa mRNA for cyclin B3 (CCNB3 gene), splice variant 2

3,852 bp linear mRNA

AM261213.1 GI:371905522

 

9. Ornithorhynchus anatinus mRNA for cyclin B3 (ccnb3 gene)

1,872 bp linear mRNA

AM262748.1 GI:371905524

 

10. Ornithorhynchus anatinus partial ccnb3 gene for cyclin B3, exons 1-13

16,267 bp linear DNA

AM262812.1 GI:371905526

 

11. Trichosurus vulpecula ccnb3 gene for cyclin B3

1,728 bp linear DNA

AM262813.1 GI:371905528

 

12. Equus caballus mRNA for cyclin B3 (ccnb3 gene), splice variant 1

4,675 bp linear mRNA

AM283100.1 GI:371905530

 

13. Equus caballus mRNA for cyclin B3 (ccnb3 gene), splice variant 2

1,824 bp linear mRNA

AM283101.1 GI:371905532

 

14. Sus scrofa mRNA for cyclin B3 (ccnb3), splice variant 3

1,142 bp linear mRNA

AM292028.1 GI:371905534

 

15. Gallus gallus partial DGKK gene for DGKK protein and CCNB3 gene for cyclin B3

4,835 bp linear DNA

AM691545.1 GI:371905536

 

16. Homo sapiens mRNA for cyclin B1 (CCNB1V gene), short variant

2,098 bp linear mRNA

AM851053.1 GI:371905555

 

17. Homo sapiens mRNA for cyclin B2 (CCNB2V gene), short variant

2,508 bp linear mRNA

AM851054.1 GI:371905557

 

18. TPA_inf: Monodelphis domestica partial ccnb3 gene for cyclin B3, exons 1 and joined CDS

845 bp linear DNA

BN000957.1 GI:406145440

 

19. TPA_inf: Monodelphis domestica partial ccnb3 gene for cyclin B3, exons 2-11

14,511 bp linear DNA

BN000958.1 GI:371925046

 

20. Sphaerechinus granularis mRNA for cycling-dependent kinase 5 (cdk5 gene), variant 1

2,912 bp linear mRNA

AM421517.1 GI:291621762

 

21. Sphaerechinus granularis mRNA for cycling-dependent kinase 5 (cdk5 gene), variant 2

2,957 bp linear mRNA

AM421518.1 GI:291621764

 

22. Sphaerechinus granularis mRNA for cycling-dependent kinase 5 (cdk5 gene), variant 3

2,748 bp linear mRNA

AM421519.1 GI:291621766

 

23. Sphaerechinus granularis mRNA for cyclin-dependent kinase 5 activator protein (p35 gene)

3,969 bp linear mRNA

AM422701.1 GI:291621768

 

24. Marthasterias glacialis partial mRNA for cyclin E (cyc E gene)

1,683 bp linear mRNA

FN555232.1 GI:291622132

 

25. Canis lupus familiaris cyclin B3 (CCNB3), mRNA

4,378 bp linear mRNA

NM_001005763.1 GI:54114985

 

26. Canis familiaris mRNA for cyclin B3 (ccnb3)

4,398 bp linear mRNA

AJ833648.1 GI:52353166

 

27. Mus musculus cyclin B3 (Ccnb3), mRNA

4,554 bp linear mRNA

NM_183015.3 GI:164519023

 

28. Mus musculus mRNA for cyclin B3 (Ccnb3 gene), splice variant 1

4,576 bp linear mRNA

AJ555464.1 GI:29603429

 

29. Mus musculus mRNA for cyclin B3 (Ccnb3 gene), splice variant 2

1,616 bp linear mRNA

AJ555465.1 GI:29603431

 

30. Marthasterias glacialis partial mRNA for extracellular signal-regulated protein kinase (erk gene)

1,247 bp linear mRNA

AJ536587.1 GI:27763990

 

31. Homo sapiens partial mRNA for cyclin B3 (CCNB3 gene), variant A

342 bp linear mRNA

AJ421672.1 GI:17646002

 

32. Homo sapiens partial mRNA for cyclin B3 (CCNB3 gene), variant B

310 bp linear mRNA

AJ421673.1 GI:17646004

 

33. Homo sapiens partial mRNA for cyclin B3 (CCNB3 gene), variant C

380 bp linear mRNA

AJ421674.1 GI:17646006

 

34. Homo sapiens mRNA for cyclin B3 (CCNB3 gene)

4,513 bp linear mRNA

AJ314764.1 GI:14275557

 

35. Homo sapiens mRNA for cyclin B3 isoform 1 (CCNB3 gene)

1,201 bp linear mRNA

AJ314765.1 GI:14275559

 

36. Homo sapiens mRNA for cyclin B3 isoform 2 (CCNB3 gene)

1,521 bp linear mRNA

AJ314766.1 GI:14275561

 

 

 

 

 

 

22/11/17

Traductions :

    Le LOMIC en chiffres

    6 Chercheurs CNRS
    4 Enseignant-chercheurs

    1 Chercheur accueilli

    9 Tech/Ingénieurs
    4 Post doctorants
    9 Etudiants en thèse

    4 Etudiants Master2

    2 Etudiants ingénieur