Le Laboratoire d'Océanographie MICrobienne (LOMIC) a été crée le 01 Janvier 2010. Cette Unité Mixte de Recherche Sorbonne Université-CNRS (UMR 7621) est rattachée à l'Institut National des Sciences de l'Univers (INSU) du CNRS (rattachement principal)et l'Institut d'Ecologie et de l'Environnement (INEE) (rattachement secondaire).
Le LOMIC rassemble des compétences dans les domaines de la biogéochimie marine, de l'écologie microbienne, de la biodiversité, de la physiologie et de l'écotoxicologie des microorganismes marins et des biotechnologies. Cette pluridisciplinarité permet d'aborder de manière originale des questions aux frontières de la science.
L’objectif général du LOMIC est d’étudier les interactions réciproques entre un milieu changeant et varié, l’océan, et les micro-organismes qui l’habitent de manière intégrative du gène à l'écosystème. Notre travail concerne tout à la fois des questions de recherche fondamentale (ex. réponses des microorganismes aux changements globaux de l'environnement) et de recherche appliquée avec des partenariats industriels (ex. bioremédiation, valorisation des microalgues).
Evaluation par le Haut Conseil de l’évaluation de la recherche et de l’enseignement supérieur (Hcéres)
Le LOMIC a été évalué par Hcéres durant la campagne de la vague D (2017-2018). Vous trouverez ci-dessous les liens des différents documents constituant cette évaluation :
- Bilan scientifique (2014-2017), projet scientifique (2019-2023) et sélection de produits et d'activités de recherche du LOMIC. Lien
- Rapport du comité HCERES suite à la visite du 11-12 décembre 2017. Lien
ACTUALITÉS
05.02.2024
Arrivée au LOMIC de Marine Landa, chercheuse CNRS
Marina Landa a rejoint le LOMIC le 1er février en tant que chargée de recherche au CNRS (section 19, Système Terre : enveloppes superficielles) avec un projet de recherche sur les mécanismes et l’importance écologique de l'activité algicide chez les bactéries marines.
Ce projet de recherche vise à ouvrir la boîte noire de l'écologie bactérienne algicide en utilisant une combinaison d'outils classiques...
26.09.2022
Arrivée au LOMIC de Jérôme Bordereau, ingénieur d'étude en instrumentation
Jérôme Bordereau a intégré le CNRS en septembre 2001 au Laboratoire de Météorologie Dynamique situé à Palaiseau (Essonne) en tant qu’Électronicien. L'activité du Laboratoire est principalement axée sur l’Étude du climat et de la Dynamique de la Stratosphère. Intégré à l'équipe « Ballons », Jérôme a développé des instruments météorologiques destinés à être embarqués sous des ballons dérivant dans la...
26.09.2022
Arrivée au LOMIC de Bart Haegeman, chercheur en modélisation écologique
Après une thèse en physique théorique, Bart Haegeman s'est dirigé vers la modélisation mathématique en écologie, d'abord une dizaine d'années au Laboratoire de Biotechnologie Environnementale (LBE) à Narbonne, puis une autre dizaine d'années à la Station d'Ecologie Théorique et Expérimentale (SETE) à Moulis en Ariège. Il développe des approches quantitatives, allant des modèles théoriques plus conceptuels...
04.03.2022
PhD Thesis Proposition: Bioavailability of glacial iron to microbes in the Southern Ocean
The main objective of the PhD thesis is to investigate the bioavailability of different forms of glacial Fe to microorganisms in the SO. The determination of the bioavailability of Fe is a challenging issue, because not all the chemical forms of Fe are equally available. A biological approach to address this question is based on the metabolic activity and gene expression profiles of taxonomically...
16.08.2021
Expérience en mésocosmes à l'Ecotron Ile de France CEREEP
Après l’expérience en mésocosmes réalisée à MEDIMEER sur la lagune de Thau (cf. newsletter du mois de juin), une nouvelle expérience en mésocosmes a lieu actuellement sur la plateforme PLANAQUA du CEREEP-Ecotron Ile de France dans le cadre de l’ANR RESTORE (Fabien Joux).
Cette expérience vise à étudier les effets simples et combinés d’un apport de matière organique terrigène et d’une augmentation de...
16.08.2021
The missing ocean plastic sink: gone with the rivers
Jean-François Ghiglione est co-auteur d’un article qui vient d’être publié dans la revue Science, intitulé "The missing ocean plastic sink: gone with the rivers". Cet article a été piloté par nos collègues du CEFREM, en collaboration avec le LOMIC, le LEGOS et l’Université de Barcelone. Il fait partie d’un numéro spécial de la revue Science intitulé "Our plastics dilemma".
https://science.sciencemag...
03.11.2020
Démarrage de deux nouvelles thèses au LOMIC
Deux nouvelles thèses au LOMIC démarrent en octobre 2020 :
-Rui ZHANG : Régulation microbienne de cycles de nutriments et de métaux traces dans l’Océan Austral.
- Maxime BEAUVAIS : Rôle des interactions biotiques dans la régulation des blooms phytoplanctoniques hivernaux sur un site côtier de Méditerranée nord ouest.
Nous leur souhaitons la bienvenue au LOMIC.
21.10.2020
L’échantillonnage automatisé dans l’océan Austral : un défi relevé avec succès au large des îles Kerguelen
Des chercheurs du Laboratoire d’océanographie microbienne (LOMIC, CNRS / Sorbonne Université), avec le soutien de la Division technique de l’INSU, viennent de franchir une nouvelle et importante étape en déployant un préleveur autonome à 50 m de profondeur au cœur des 50e hurlants. D’octobre 2016 à avril 2017, ce préleveur autonome a échantillonné tous les 11 jours l’océan ambiant. Un piège à particules...
13.10.2020
Soutenance de thèse - Justine Jacquin
Justine Jacquin soutiendra sa thèse intitulée “Ecotoxicologie microbienne des plastiques en mer : colonisation et biodégradation par la plastisphère » le vendredi 16 octobre à 9h.
Résumé : De nos jours, les déchets plastiques ont envahi l’ensemble des écosystèmes marins du monde en n’épargnant aucune zone. La demande mondiale de plastique ne cesse de croitre d’année en année, malgré l’impact...
12.10.2020
Thesis defense - Jingguang Cheng
Monday, 12st of October at 14:00, Jingguang Chengwill defend his PhD tilted "Microplastics in the marine environment: an ecotoxicological perspective".
Abstract : Oceanic plastic pollution is of major concern, with several million tonnes of plastic dumped in the ocean every year that are causing health threat to marine creatures. Impacts have been found at all the trophic chain levels from the zooplankton...
22.02.2020
Démarrage du projet ANR RESTORE
Le projet ANR RESTORE vise à étudier l’impact combiné des apports de matière organique dissoute et du réchauffement climatique dans les milieux aquatiques d’eau douce et marine, en s’intéressant plus particulièrement à la réponse structurelle et fonctionnelle des communautés microbiennes. Ce projet est porté par le LOMIC et regroupe cinq partenaires français (CEREEP, iEES Paris, MARBEC, ESE, ISYEB)...
29.01.2020
Start of LIA MAST
The international associated laboratory Multiscale Adaptive STrategies Laboratory (LIA MAST) provides a comprehensive analysis of the diverse adaptive strategies found in nature at distinct levels of biological organization including molecules, genes, cells, organisms and ecosystems. As this effort will integrate biological sciences, earth sciences and ecological sciences at 6 institutions in France...
08.01.2020
Mission BINGO à Kerguelen
Stéphane Blain, Ingrid Obernosterer, Audrey Gueneugues et Olivier Crispi sont partis pour une mission de deux mois et demi (mi-décembre-fin février) sur l’île Kerguelen afin d’étudier le rôle de la fonte des glaciers en tant que source de fertilisation en fer dans l’océan Austral. Cette région du globe joue un rôle majeur dans la régulation du CO2 atmosphérique et donc du climat, mais l’absorption...
21.10.2019
Thesis defense - Coco Koedooder
Monday, 21st of October at 14:00, Coco Koedooder will be defending her PhD in the amphitheatre A. Guille.
Her thesis is titled: "The interplay between Fe-limitation, carbon and light in a (photo)heterotrophic bacterium"
and will be examined by the following jury committee members:
Yeala Shaked, Hebrew University of Jerusalem, IS (rapporteur)Eric Rosenfeld, Université de la Rochelle, FR (rapporteur)Emma...
18.10.2019
Thesis defense - Pavla Debeljak
Pavla Debeljak will defend her PhD titled « The coupling of carbon and iron cycles in the Southern Ocean through microbial metabolism» .
It will take place in the amphitheatre Alain Guille on Friday, 18th of October at 9.30 pm.
20.09.2019
Thesis defenese - Yan LIU
Friday 20th September at 10:00, Yan LIU will be defending her PhD in the amphitheatre A. Guille.
Her thesis is titled: "Spatial and temporal patterns in diatom-prokaryote associations in the Southern Ocean"
and will be examined by the following jury committee members:
Josep Gasol, Sébastien Monchy, Dominique Lamy, Emma Rochelle-Newalland Ingrid Obernosterer.
Highlight Publication
Genetic tool development in marine protists: emerging model organisms for experimental cell biology
Nature Methods
volume 17, pages 481–494(2020)
Diverse microbial ecosystems underpin life in the sea. Among these microbes are many unicellular eukaryotes that span the diversity of the eukaryotic tree...
Contact
Directeur : Fabien JOUX
Tel : 33 (0)4 68 88 73 42
E-mail : joux @ obs-banyuls.fr
Directrice adjointe : Eva ORTEGA-REUERTA
Tel : 33 (0)4 68 88 73 53
E-mail : ortegaretuerta @ obs-banyuls.fr
Gestion - Secrétariat : Frédérique SANZ
Tel : 33 (0)4 68 88 73 01
E-mail : frederique.sanz @ obs-banyuls.fr
Sylvie CABAL
Tel : 33 (0)4 30 19 24 90
Email : sylvie.cabal @ obs-banyuls.fr
Assistant de prévention : Philippe CATALA
Tel : 33 (0)4 68 88 73 53
E-mail : catala@obs-banyuls.fr
Formation permanente : Barbara MARIE
Tel : 33 (0)4 30 19 24 28
E-mail : barbara.marie @ obs-banyuls.fr
Le LOMIC en chiffres
12 chercheurs / enseignants chercheurs
1 chercheuses accueillie
9 Techniciens / Ingénieurs
16 étudiants PhD - Postdocs
environ 8 étudiants Master 2 / an