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DENNU LOUIS

DENNU Louis Doctorant Sorbonne Université (ED129) Laboratoire d'Océanographie Microbienne (LOMIC) - UMR 7621 CNRS-Sorbonne Université Avenue Fontaulé - 66650 Banyuls sur mer, France Tél : 04 68 88 73 34 E-mail : louis.dennu @ obs-banyuls.fr (louis.dennu @ obs-banyuls.fr)

Louis Dennu, encadré par François-Yves Bouget, vient de commencer sa thèse. Il a pour objectif d’évaluer l’importance des variations génomiques du phytoplancton dans l’adaptation à des niches environnementales spécifiques. Le modèle biologique choisi est la picoalgue Bathycoccus pour laquelle nous disposons de nombreuses souches isolées à différentes latitudes, du pôle à l’équateur et au cours des saisons en baie de Banyuls-sur-Mer. La première étape, initiée en stage, consiste à construire un pangénome de Bathycoccus à partir de 15 génomes assemblés de novo afin d’y représenter et d’y explorer la diversité génétique.

L’étude comparative des génomes permettra d’identifier les mécanismes de diversité génétique impliqués dans l’adaptation chez Bathycoccus et le rôle des variations structurales dans l’adaptation aux variations de lumière et de température, avec un focus particulier sur la plasticité génétique de l’horloge circadienne. Enfin, les marqueurs génomiques identifiés seront utilisés pour étudier la dynamique des populations de Bathycoccus aux échelles temporelle (série temporelle de Banyuls-sur-Mer et Blanès 2009-2017) et géographique (Tara Océans).