Jean-Claude LOZANO

Depuis janvier 2009, je travaille au Laboratoire d'Océanologie Microbienne (UMR 7621). L'unité d'accueil étudie des questions en océanographie et en écologie, par la mise en œuvre d’approches intégrées du gène à l’écosystème. Cette approche intégrative repose en partie sur l’utilisation d’organismes modèles au laboratoire telles que certaines microalgues. Je participe au développement de nouveaux protocoles de transformation et des outils moléculaires nécessaires afin de les promouvoir comme organismes modèles dans les applications allant de la physiologie aux biotechnologies (ingénierie des voies de biosynthèse) en passant par l'écotoxicologie et la fabrication de biocapteurs. Ce développement doit permettre la création de lignées à façon nécessaires aux recherches de l'unité et au développement de ressources génétiques proposées dans le cadre du projet investissement d’avenir EMBRC-France.  

Carrière

2009- : Ingénieur de recherche dans l'UMR 7621 LOMIC : équipe "Biologie systémique et réponses environnementales" et depuis 2014 sur les axes thématiques "Régulation des fonctions microbiennes par les paramètres environnementaux" et "Ecotoxicologie microbienne marine et ingénierie métabolique".

1995-2009 : Ingénieur de recherche dans l'UMR7628 "Modèles en Biologie Cellulaire et Evolutive": équipe "Régulation Moléculaire du Cycle Cellulaire" (labellisé Ligue Nationale contre le Cancer)

Cursus universitaire

1994 : Thèse d'Université Claude Bernard Lyon 1. Centre International de Recherches sur le Cancer dans l'équipe "Méchanismes de la Cancérogénèse"

1989 : DEA (master II) Biologie cellulaire et microbiologie. Université de Marseille

1988 : Maîtrise en Biochimie. Université de Montpellier

1987 : Licence en Biochimie. Université de Montpellier

Depuis 10 ans, mon activité s'est inscrite dans le cadre des projets suivants :

- 2020-2024 : ANR CLIMA-CLOCK. Photoperiodism in ubiquist model microalgae of marine phytoplankton: mechanisms and sensitivity to ocean temperature increase.

- 2015-2019 : ANR Defi1 Adaptation au Changement climatique. « PhotoPhyto » , Effect of global warming on the spring bloom initiation, Photoperiodism, Composition, adaptation.

- 2012-2015 : ANR Blanche « Phytoiron » (Iron metabolism in marine phytoplankton).

- 2014-2017 : ANR Labcom. “OTARI”. Ostreococcus tauri from research to Industry.

- Gordon and Betty Moore Foundation :

2020-2021 : A molecular toolbox for Bathycoccus prasinos and Ostreococcus lucimarinus

2017-2018 : Toward stable genetic transformation in phytoplanktonic picoeukaryotes

2016-2017 : Development of genetic transformation in phytoplanktonic picoeukaryotes

- 2017-2021 : H2020 European project  « ASSEMBLE+ » . Development of genetic resources in picoeukaryotes

- 2012-2017 : Investissement d’Avenir EMBRC France. (Genetic resources). “Insertion mutant collection in Ostreococcus”

Compétences

Génétique, biologie marine, biotechnologie, biologie moléculaire, biochimie.

Techniques

- Conception et mise en œuvre de nouveaux outils moléculaires et de protocoles pour l'analyse fonctionnelle des gènes de différentes microalgues (souches recombinantes contenant un gène d'intérêt modifié par remplacement, mutation ou délétion au locus par recombinaison homologue,  dans son expression par système d'expression inductible, collection de mutants d'insertion) avec développement de protocoles :

- pour l'obtention rapide de  transgènes mosaïques nécessaires pouvant atteindre 10 kb et composites jusqu'à 7 fragments.

- de transformation de plusieurs microalgues

- de criblage rapide des transformants par PCR, luminescence.

- Clonage  de gènes et caractérisation de leur fonction :

- Localisation du gène : Southern blot, marche sur chromosome.

- Expression transcriptionnelle et  localisation des transcripts dans un embryon : RT-PCR,  northern blot,  PCRQ, hybridation in situ.

- Recherche de nouvelles interactions par double-hybride en levure sur banque (depuis l'analyse des protéines ou domaines appâts potentiels jusqu'à l'obtention de la protéine proie entière et validation de l'interaction).

- Biologie moléculaire

Méthodes autour de la PCR et notamment l'isolement de nouveaux gènes (PCR dégénéré, RACE, marche sur chromosome...), criblage sur colonie bactérienne ou microalgue.

Extraction et purification des acides nucléiques: ADN, ARN, plasmides/ Northern, Southern blots et criblage de banques d'ADNc

ADN recombinant et génie génétique: RFLP, sous-clonage, techniques de transformation en bactérie, levure et microalgues, criblages

- Protéines recombinantes et biochimie

SDS PAGE-Western blot

Protéines recombinantes (étiquettes/ corps d'inclusion pour production d'anticorps…)

Analyse des interactions protéine-protéine par GST pulldown, co-immunoprécipation avec protéines étiquettées ou pas, double-hybride en levure dirigé

Recherche de nouvelles interactions par double-hybride en levure sur banque (depuis l'analyse des protéines ou domaines appâts potentiels jusqu'à l'obtention de la protéine proie entière et validation de l'interaction).

- Culture cellulaire : bactéries, levures, microalgues

- Bioinformatique : NCBI, UNIGENE, ENSEMBL, JGI, bioinformatics.psb  genomes

outils : BLAST, Clustal,  FASTA, ORF, GenScan, EXPASY proteomic tools

soumission de nouvelles séquences dans banque EMBL.

Activités administratives

-  Elu au CA de l'Observatoire (2004-2016) puis au conseil de la FR 3724 depuis 2019.

.  Anciens mandats au conseil de l'UMR 7628 (ancienne unité d'accueil jusqu'en 2010) , au conseil scientifique et au conseil de laboratoire de l'Observatoire.

- Anciens mandats d'élu au Comité National du  CNRS: section 26 (2009-2012) et au conseil scientifique du département SDV (ancien INSB, mandat 2001-2005).

- Expert au groupe national des personnes qualifiés pour le corps des IE en BAP A : campagnes avancement 2017 et 2018.

- Relecteur des profils de poste en BAP A pour les campagnes de concours externe dans le cadre du réseau des experts métiers DRH CNRS.

- Jury de concours externes 1 T, 1 IE et 8 IR, de concours interne IR (n°200 en 2012).

Publications et brevets

Enveloppes SOLEAU

1. Enveloppe N° 517324 220914 : François-Yves Bouget, Jean-Claude Lozano, Valérie Vergé et Philippe Schatt. « Procédé de fabrication de transgènes pour transformation de Ostreococcus tauri ».

2. Enveloppe N° 517325 220914. François-Yves Bouget, Jean-Claude Lozano, Valérie Vergé et Philippe Schatt «  Procédé de transformation d'Ostreococcus tauri par electroporation ».

3. Enveloppe N°531412 200215. François-Yves Bouget, Philippe Schatt, Jean-Claude Lozano et Valérie Vergé. « Culture Cellulaire et production d’exopolysaccharides chez Ostreococcus tauri ».

Publications

1. Lambert S, Lozano JC, Bouget FY*, Galand P* (*co-corresponding authors). Seasonal marine microorganisms change neighbors under remarkable weather conditions. Environmental Microbiology (revised manuscript).
2. Faktorová D, Nisbet R.E, Fernández Robledo JA ….Bouget FY... ... Lozano JC…Vergé V… Lukeš J. (2019). Genetic tool development in marine protists: Emerging model organisms for experimental cell biology. Nature Methods, May 2020 17(5):1-1, doi: 10.1038/s41592-020-0828-6
3. Lambert S, Tragin M, Lozano JC, Ghiglione JF, Vaulot D, Bouget FY*, Galand PE* (2019). Rhythmicity of coastal marine picoeukaryotes, bacteria and archaea despite irregular environmental perturbations. ISME Journal, 13: 388–401 (*co-corresponding authors).
4. Gaëlle Lelandais, Ivo Scheiber, Javier Paz-Yepes, Jean-Claude Lozano, Hugo Botebol, Jana Pilátová, Vojtěch Žárský, Thibaut Léger, Pierre-Louis Blaiseau, Chris Bowler, François-Yves Bouget, Jean-Michel Camadro1, Robert Sutak and Emmanuel Lesuisse (2019] Ostreococcus tauriis a New Model Green Alga for Studying Iron Metabolism in Eukaryotic Phytoplankton. Book chapter in Prime Archives in Genetics, doi:10.37247/PAG.1.2019.2A
5. Henríquez−Castillo CA, Botebol H, Mouton A, Ramírez−Flandes S, Lozano JC, Lelandais G, Andrade S, Trefault N, De la Iglesia RA, Bouget FY (2018). Genetically engineered Ostreococcus tauri biosensors for copper pollution in coastal marine environments.Front. Environ. Sci., 22. doi.10.3389/fenvs.2018.00022.
6. Guyon JB, Vergé V, Schatt P, Lozano JC, Liennard M, Bouget  FY (2018). Comparative analysis of culture conditions for the optimization of carotenoid production in several strains of the picoeukaryote Ostreococcus. Mar. Drugs 16(3), 76; doi:10.3390/md1603007.
7. Hugo Botebol, Gaelle Lelandais, Christophe Six, Emmanuel Lesuisse, Arnaud Meng, Lucie Bittner, Stéphane Lecrom, Robert Sutak, Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, Valérie Vergé, Stéphane Blain, François-Yves Bouget: Acclimation of a low iron adapted Ostreococcus strain to iron limitation through cell biomass lowering. Scientific Reports 12/2017; 7(1)., DOI:10.1038/s41598-017-00216-6
8. Ryan W Paerl, Francois-Yves Bouget, Jean-Claude Lozano, Valérie Vergé, Philippe Schatt, Eric E Allen, Brian Palenik, Farooq Azam: Use of plankton-derived vitamin B1 precursors, especially thiazole-related precursor, by key marine picoeukaryotic phytoplankton. The ISME Journal 12/2016; 11(3)., DOI:10.1038/ismej.2016.145
9. Gaëlle Lelandais, Ivo Scheiber, Javier Paz-Yepes, Jean-Claude Lozano, Hugo Botebol, Jana Pilátová, Vojtěch Žárský, Thibaut Léger, Pierre-Louis Blaiseau, Chris Bowler, François-Yves Bouget, Jean-Michel Camadro, Robert Sutak, Emmanuel Lesuisse: Ostreococcus tauri is a new model green alga for studying iron metabolism in eukaryotic phytoplankton. BMC Genomics 12/2016; 17(1)., DOI:10.1186/s12864-016-2666-6
10. Hugo Botebol, Emmanuel Lesuisse, Robert Šuták, Christophe Six, Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, Valérie Vergé, Amos Kirilovsky, Joe Morrissey, Thibaut Léger, Jean-Michel Camadro, Audrey Gueneugues, Chris Bowler, Stéphane Blain, François-Yves Bouget: Central role for ferritin in the day/night regulation of iron homeostasis in marine phytoplankton. Proceedings of the National Academy of Sciences 11/2015; 112(47)., DOI:10.1073/pnas.1506074112
11. Matthew T. Weirauch, Ally Yang, Mihai Albu, A.G. Cote, Alejandro Montenegro-Montero, Philipp Drewe, Hamed S. Najafabadi, Samuel A. Lambert, Ishminder Mann, Kate Cook, Hong Zheng, Alejandra Goity, van Bakel H, Lozano JC, Mary Galli, Lewsey MG, Eryong Huang, Tuhin Mukherjee, Xiaoting Chen, Reece-Hoyes JS, Sridhar Govindarajan, Gad Shaulsky, Albertha J.M. Walhout, Bouget FY, Gunnar Ratsch, Luis F. Larrondo, Joseph R. Ecker, Timothy R. Hughes: Determination and Inference of Eukaryotic Transcription Factor Sequence Specificity. Cell 09/2014; 158(6):1431-43., DOI:10.1016/j.cell.2014.08.009
12. Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, Hugo Botebol, Valérie Vergé, Emmanuel Lesuisse, Stéphane Blain, Isabelle A. Carré, François‐Yves Bouget: Efficient gene targeting and foreign DNA removal by homologous recombination in the picoeukaryote Ostreococcus. The Plant Journal 04/2014; 78(6)., DOI:10.1111/tpj.12530
13. François-Yves Bouget, Marc Lefranc, Quentin Thommen, Benjamin Pfeuty, Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, Hugo Botebol, Valérie Vergé: Transcriptional versus non-transcriptional clocks: A case study in Ostreococcus. Marine Genomics 04/2014; 14., DOI:10.1016/j.margen.2014.01.004
14. Valérie Vergé, Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, Gérard Peaucellier: SGEBP, a giant protein from starfish oocytes able to interact with ERK. Molecular Reproduction and Development 10/2013; 80(10)., DOI:10.1002/mrd.22210
15. Jean-Claude Lozano, Valérie Vergé, Philippe Schatt, Jennifer L Juengel, Gérard Peaucellier: Evolution of Cyclin B3 Shows an Abrupt Three-Fold Size Increase, due to the Extension of a Single Exon in Placental Mammals, Allowing for New Protein-Protein Interactions. Molecular Biology and Evolution 07/2012; 29(12)., DOI:10.1093/molbev/mss189
16. El Batoul Djouani-Tahri, Frédéric Sanchez, Jean-Claude Lozano, François-Yves Bouget: A Phosphate-Regulated Promoter for Fine-Tuned and Reversible Overexpression in Ostreococcus: Application to Circadian Clock Functional Analysis. PLoS ONE 12/2011; 6(12):e28471., DOI:10.1371/journal.pone.0028471
17. Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, Valérie Vergé, Jérôme Gobinet, Vincent Villey, Gérard Peaucellier: CDK5 is Present in Sea Urchin and Starfish Eggs and Embryos and Can Interact With p35, Cyclin E and Cyclin B3. Molecular Reproduction and Development 05/2010; 77(5):449-61., DOI:10.1002/mrd.21165
18. Laure Lapasset, Bérengère Pradet-Balade, Valérie Vergé, Jean-Claude Lozano, Nathalie Oulhen, Patrick Cormier, Gérard Peaucellier: Cyclin B synthesis and rapamycin‐sensitive regulation of protein synthesis during starfish oocyte meiotic divisions. Molecular Reproduction and Development 11/2008; 75(11):1617 - 1626., DOI:10.1002/mrd.20905
19. Yasmine Even, Sandrine Durieux, Marie-Line Escande, Jean Claude Lozano, Gérard Peaucellier, Dominique Weil, Anne-Marie Genevière: CDC2L5, a Cdk-Like kinase with RS domain, interacts with the ASF/SF2-associated protein p32 and affects splicing in vivo. Journal of Cellular Biochemistry 10/2006; 99(3):890-904., DOI:10.1002/jcb.20986
20. Laure Lapasset, Bérengère Pradet-Balade, Jean-Claude Lozano, Gérard Peaucellier, André Picard: Nuclear envelope breakdown may deliver an inhibitor of protein phosphatase 1 which triggers cyclin B translation in starfish oocytes. Developmental Biology 10/2005; 285(1):200-10., DOI:10.1016/j.ydbio.2005.06.016
21. Nicolas Offner, Jean Derancourt, Jean-Claude Lozano, Philippe Schatt, André Picard, Gérard Peaucellier: Cybip, a starfish cyclin B-binding protein, is involved in meiotic M-phase exit. Biochemical and Biophysical Research Communications 02/2003; 300(1):121-7., DOI:10.1016/S0006-291X(02)02797-3
22. B Pradet-Balade, J.P. Medema, M López-Fraga, J.C. Lozano, G.M. Kolfschoten, A Picard, C Martínez-A, J.A. Garcia-Sanz, M Hahne: An endogenous hybrid mRNA encodes TWE-PRIL, a functional cell surface TWEAK-APRIL fusion protein. The EMBO Journal 12/2002; 21(21):5711-20., DOI:10.1093/emboj/cdf565
23. Delphine Guillebault, Souphatta Sasorith, Evelyne Derelle, Jean-Marie Wurtz, Jean-Claude Lozano, Scott Bingham, Laszlo Tora, Hervé Moreau: A New Class of Transcription Initiation Factors, Intermediate between TATA Box-binding Proteins (TBPs) and TBP-like Factors (TLFs), Is Present in the Marine Unicellular Organism, the Dinoflagellate Crypthecodinium cohnii. Journal of Biological Chemistry 11/2002; 277(43):40881-6., DOI:10.1074/jbc.M205624200
24. Jean-Claude Lozano, Eric Perret, Philippe Schatt, Cécile Arnould, Gérard Peaucellier, André Picard: Molecular Cloning, Gene Localization, and Structure of Human Cyclin B3. Biochemical and Biophysical Research Communications 03/2002; 291(2):406-13., DOI:10.1006/bbrc.2002.6458
25. Jenifer Croce, Guy Lhomond, Jean-Claude Lozano, Christian Gache: ske-T, a T-box gene expressed in the skeletogenic mesenchyme lineage of the sea urchin embryo. Mechanisms of Development 09/2001; 107(1-2):159-162., DOI:10.1016/S0925-4773(01)00470-1
26. Francois Marqués, J L Moreau, Gerard Peaucellier, J C Lozano, Philippe Schatt, Andre Picard, Isabelle Callebaut, Eric Perret, A M Genevière: A new subfamily of high molecular mass CDC2-related kinases with PITAI/VRE motifs. Biochemical and Biophysical Research Communications 01/2001; 279(3):832-7., DOI:10.1006/bbrc.2000.4042
27. J L Moreau, François Marques, Abdelhamid Barakat, Philippe Schatt, J C Lozano, Gérard Peaucellier, André Picard, A M Genevière: Cdk2 Activity Is Dispensable for the Onset of DNA Replication during the First Mitotic Cycles of the Sea Urchin Early Embryo. Developmental Biology 09/1998; 200(2):182-97., DOI:10.1006/dbio.1998.8961
28. J-C Lozano, Philippe Schatt, François Marquès, Gérard Peaucellier, Philippe Fort, J P Féral, A M Genevière, André Picard: A Presumptive Developmental Role for a Sea Urchin Cyclin B Splice Variant. The Journal of Cell Biology 02/1998; 140(2):283-93.
29. Corinne Galiana, Jean-Claude Lozano, Brigitte Bancel, Hisayoshi Nakazawa, Hiroshi Yamasaki: High frequency of Ki-ras amplification and p53 gene mutations in adenocarcinomas of the human esophagus. Molecular Carcinogenesis 12/1995; 14(4):286-93., DOI:10.1002/mc.2940140409
30. Nikolai M. Mironov, Anne‐Marie Aguelon, Elysia Hollams, Jean-Claude Lozano, Hiroshi Yamasaki: Microsatellite alterations in human and rat esophageal tumors at selective loci. Molecular Carcinogenesis 05/1995; 13(1):1-5., DOI:10.1002/mc.2940130102
31. Jean Claude Lozano, Hisayoshi Nakazawa, Marie‐Pierre Cros, R Cabral, Hiroshi Yamasaki: G→A mutations in p53 and Ha-ras genes in esophageal papillomas induced by N-nitrosomethylbenzylamine in two strains of rats. Molecular Carcinogenesis 01/1994; 9(1):33-9., DOI:10.1002/mc.2940090107