ACTUALITÉS
15.10.2012
Pole to Pole Community Composition
Des travaux de notre équipe récemment publié dans PNAS (Ghiglione et al. 2012) ont été sélectionné pour faire l’objet d’un communiqué de presse à la NSF
A lire dans http://www.nsf.gov/news/news_summ.jsp?cntn_id=125685&WT.mc_id=USNSF_51&WT.mc_ev=click
15.03.2017
4th Interlab Meeting Banyuls - Barcelona. Microbes & Microbis
The 4th Interlab Meeting Microbes: Biogeochemistry & Ecology, organized by LOMIC (Banyuls) and the Departement of Marine Biology and Oceanography (Institute of Marine Sciences, Barcelona) will be held at Banyuls on 22/23th May 2017.
Meeting contacts:
Ingrid Obernosterer, CNRS: ingrid.obernosterer@obs-banyuls.fr
Josep M. Gasol, CSIC: pepsol@icm.cisic.es
06.05.2019
5ème Inter-lab meeting Barcelone-Banyuls
Les 2 et 3 Mai, une cinquantaine de chercheurs se sont réunis sur la Costa Brava pour le 5ème Inter-lab meeting. Cette rencontre, organisée par Josep Gasol (lnstitut des Sciences de la Mer, Barcelone) et Ingrid Obernosterer (LOMIC) était l’occasion d'un échange scientifique sur des recherches menées de chaque côté des Pyrénées sur le thème "Ecologie microbienne et Biogéochimie".
Programme scientifique...
03.09.2018
Accueil au LOMIC de Valérie Barbe, chercheuse au Genoscope d’Evry
Dans le cadre d’un accord de collaboration entre le CEA/Genoscope et le LOMIC, Valérie Barbe sera présente deux ans à Banyuls. Valérie est une microbiologiste spécialisée dans l’analyse de génomes bactériens et de données métagénomiques. Elle est impliquée dans la mission TARA-Pacific et travaillera notamment en collaboration avec Jean-François Ghiglione sur l’étude de la biodégradation des plastiques...
01.03.2017
Accueil de Cicéro Alvarez, PhD student
Cicero Alvares a rejoint le LOMIC pour sa troisième année de thèse intitulée « Interactions entre les facteurs abiotiques et l’horloge biologique sur le déclenchement des blooms phytoplanctoniques » et commencée à Sao Paulo au Brésil.L’objectif principal de ce projet est de vérifier comment les gènes de l’horloge régulent les taux de croissance saisonniers de l’algue Ostreococcus tauri sous différentes...
15.09.2014
Accueil de Leanne Armand
Le Dr. Leanne Armand du Marine and Coastal Phytoplnakton Laborarory (Macquarie University, North Ride, Australia) est accueillie au LOMIC en tant que Professeur invité de l’UPMC pendant le mois de septembre 2014. Leanne Armand est une des partenaires du projet international KEOPS (direction S. Blain) qui a pour objectif d’étudier la pompe biologique de CO2 dans l’océan austral et sa réponse à la...
05.11.2010
Accueil de Marcela Cornejo
Dr Marcela Cornejo will be visiting the LOMIC between November 3rd and 17th 2010 in the frame of an ECOS-CONICYT exchange program. She is a post doctoral fellow at the University of Concepcion (Chile), currently funded by the Gordon and Betty Moore Foundation (USA). Dr Cornejo is a specialist in the marine cycle of nitrous oxide (N2O), a powerful greenhouse gas biologically mediated in the ocean...
27.08.2010
Accueil de Ruben Escribano
Le professeur Ruben ESCRIBANO de l’Universidad de Concepción (Chile) sera accueilli pour un mois au sein du LOMIC en septembre 2010.
R. Escribano est spécialiste de la biologie du zooplankton et collabore avec C. Fernández du LOMIC sur l’étude de l’excrétion d’éléments azotés (principalement de type organique dissous) par des espèces clef de copépodes, organismes responsables d’une grande partie...
28.11.2017
Accueil de Sara Beier
The LOMIC welcome Dr. Sara BEIER as Associated scientist from the Leibniz institute for Baltic Sea Research Warnemuende to develop her project funded by the German Research Foundation (DFG) and entilted: "Genetic Structure of Microbial Communities as a Signature of their Functional Stability".
This original project funded for three year will explore the response of bacterial communities to disturbance...
03.01.2016
Accueil de Véronica Molina
Dr. Véronica Molina from the Departamento de Biologia. Facultad de Ciencias Naturales y Exactas. Universidad de Playa Ancha (Chile) will be invited by the UPMC as Professor for one month at the LOMIC (september 2015).
Dr Molina has extensive expertise in molecular techniques (metagenomics, proteomics and Q-PCR) and has been working on the regulation of marine nitrogen cycle for the last 10 years...
10.09.2014
ANR PHOTO-PHYTO. Effets du réchauffement climatique sur le déclenchement des blooms phytoplanctoniques marins
Le réchauffement des océans est le principal facteur responsable des changements globaux de productivité, biomasse et phénologie (moment des blooms) des communautés phytoplanctoniques.
Dans les océans tempérés, l’abondance et la diversité du phytoplancton augmentent de façon considérable entre l’hiver et le printemps. Ces blooms résultent vraisemblablement d’une combinaison de paramètres physiques...
29.11.2017
Arrival of three new PhD students at LOMIC
Between October and November 2017, three new thesis begin at LOMIC:
Justine JACQUIN (contrat doctoral UPMC) will study the biodegradation of plastic polymers at sea. (Theme 3)
Angel RAINCONICYT funding, Chile) will study the Consequences of environmental disturbances on aquatic microbial structure and their functional stability. (Theme 2)
Jingguang CHEN (Chinese Scholarship Council funding, China) will...
26.09.2022
Arrivée au LOMIC de Bart Haegeman, chercheur en modélisation écologique
Après une thèse en physique théorique, Bart Haegeman s'est dirigé vers la modélisation mathématique en écologie, d'abord une dizaine d'années au Laboratoire de Biotechnologie Environnementale (LBE) à Narbonne, puis une autre dizaine d'années à la Station d'Ecologie Théorique et Expérimentale (SETE) à Moulis en Ariège. Il développe des approches quantitatives, allant des modèles théoriques plus conceptuels...
26.09.2022
Arrivée au LOMIC de Jérôme Bordereau, ingénieur d'étude en instrumentation
Jérôme Bordereau a intégré le CNRS en septembre 2001 au Laboratoire de Météorologie Dynamique situé à Palaiseau (Essonne) en tant qu’Électronicien. L'activité du Laboratoire est principalement axée sur l’Étude du climat et de la Dynamique de la Stratosphère. Intégré à l'équipe « Ballons », Jérôme a développé des instruments météorologiques destinés à être embarqués sous des ballons dérivant dans la...
05.02.2024
Arrivée au LOMIC de Marine Landa, chercheuse CNRS
Marina Landa a rejoint le LOMIC le 1er février en tant que chargée de recherche au CNRS (section 19, Système Terre : enveloppes superficielles) avec un projet de recherche sur les mécanismes et l’importance écologique de l'activité algicide chez les bactéries marines.
Ce projet de recherche vise à ouvrir la boîte noire de l'écologie bactérienne algicide en utilisant une combinaison d'outils classiques...
02.10.2017
Arrivée de Barbara MARIE - IE CNRS
Barbara MARIE a rejoint le LOMIC le 2 octobre 2017 sur un poste de mobilité interne du CNRS.
Barbara est ingénieure d'étude en analyses chimiques. Elle sera en charge au LOMIC des techniques de caractérisation de la matière organique.
Barbara était précédemment en charge de l'unité de Géochimie minérale au sein du Service Analyse des Roches et des Minéraux, laboratoire de service à la recherche faisant...
03.12.2018
Arrivée de Léo Chasselin, assistant ingénieur projet ANR CINNAMON
Léo Chasselin a intégrer le LOMIC le 3 septembre 2018 en tant qu'assistant ingénieur sur une contrat d'un an pour travailler dans le cadre du projet ANR CINNAMON.
02.03.2017
Arrivée de Martine DEVIC au LOMIC, DR CNRS
Martine DEVIC, Directrice de Recherche au CNRS, a rejoint le LOMIC en janvier 2017.
Martine DEVIC a été responsable de l’équipe Développement de la graine chez Arabidopsis au LGDP de l’Université de Perpignan (1999-2010), puis co-responsable de l’ERL5300 CNRS-IRD Régulations Epigénétiques et Développement de la Graine (2011-2016) à Montpellier. A présent, son projet porte sur l’étude des mécanismes...
17.02.2014
Campagne AMOP au large du Pérou (25 janvier-23 fevrier 2014)
La campagne AMOP a pour objectif de comprendre les processus impliqués dans la désoxygénation des océans et la possible extension des zones de minimum d’oxygène (OMZs), telles que celle qui est localisée au large des côtes du Pérou.
Les Zones de Minimum d’Oxygène (OMZs), en tant que couches suboxiques, sont connues pour jouer un rôle-clé sur l’évolution du climat et des écosystèmes et ressources...
13.04.2012
campagne MOOMZ4
La campagne MOOMZ4 (Microbial Oceanography in the Oxygen Minimum Zone) s'est déroulée entre le 15 et le 26 Mars 2012 à la station marine de Dichato de L'université de Concepcion dans la zone du minimum d'oxygène du Chili central. Une équipe internationale (Université de Copenhague et Aahrus au danemark, MIT et Oregon state university aux USA Université de Conception et LOMIC) a mené des expériences...
23.08.2016
Campagne océanographique dans la région patagonniene au Chili
Depuis sept ans, le programme COPAS SurAustral étudie le fjord Puyuhuapi, l'un des plus importants de la Patagonie Chilienne. Avec des profondeurs maximales dépassant les 200m, Puyuhuapi présente des évènements d’hypoxie récurrente (concentrations d’oxygène dissous dans la colonne d’eau inférieures à 1.4 mL par litre). L’augmentation de l’activité aquicole dans le fjord ces dernières années fait de...
20.08.2010
Campagne océanographique LATEX
La campagne Océanographique LATEX va se dérouler du 31 aout au 24 septembre. 5 membres de l'équipe réponses et fonctions des microorganismes en biogéochimie marine , I. Obernosterer, S. Blain, L. Oriol, J. Capparos et N. Batailler embarquent sur le navire océanographique Suroit pour étudier le rôle d'un grand tourbillon présent dans le golfe du Lion sur les microorganismes et leur fonction dans...
31.03.2011
Campagnes pendant l'été Austral
C. Fernandez, chercheuse au LOMIC, a participé en janvier 2011 à une campagne océanographique au large du Chili central (36°S) dans le cadre du projet "Bio-Océanographic survey off central Chile, FIP2009-39". Cette zone du Pacfique Sud, dont la production biologique est parmi les plus élevées du monde est aussi connue par la présence d'eaux profondes dépourvues d'oxygène. Une série d'expériences pluridisciplinaires...
11.05.2017
Comprendre le climat dans la fureur de l'océan Austral
A la fin de 2016, la mission SOCLIM (Southern Ocean and Climate) a exploré les liens entre océan et climat dans la fureur de l’océan Austral. Il est possible de revivre en vidéo cette aventure scientifique et humaine grâce à deux journalistes (Le Monde, Universciences.tv) présents à bord du navire océanographique Marion-Dufresne.
Dans ce premier épisode, les trois responsables scientifiques de ce programme...
09.06.2016
Conférence David Kieber
Conférence le 9 juin à 11h à l'amphithéâtre
David J. KIEBER
Department of Chemistry, State University of New York, College of Environmental Science and Forestry, Syracuse, NY
Coupled Ocean-Atmosphere Loss of Refractory Marine Dissolved Organic MatterThe oceans hold a massive quantity of organic carbon that is greater than all terrestrial organic carbon biomass combined. Nearly all marine organic carbon...
12.07.2016
Conférence Gerhard Herndl
Conférence Mardi 12 juillet à 11h - Amphithéâtre
Prof. Gerhard Herndl
Université de Vienne, Dept. of Limnology and Bio-Oceanography
"Microbial Transformation of Organic Carbon in the Dark Ocean: From Bulk Measurements to Individual Molecules"
Microbial Oceanography Lab at the Univerity of Vienna:
http://www.microbial-oceanography.eu/
31.01.2014
Conférence Julie Dinasquet
Vendredi 31 janvier. Julie Dinasquet (University of Copenhagen, Marine Biology Section)
"Substrate control of community composition and functional adaptation in marine bacterioplankton"
A drop of sea-water is teeming with a million of bacteria, on which pelagic food-webs and biogeochemical cycles depend. These bacteria thrive on a wide range of dissolved organic carbon (DOC) compounds produced...
01.02.2019
Conférence Loïs Maignien
Loïs Maignien, maitre de conférence au Laboratoire des environnements extrêmes (UMR 6197) à l'Institut Universitaire Européen de la Mer (Université de Bretagne Occidentale), présentera le vendredi 8 février une conférence intitulée :
"The ACE-ecogenomics project, toward a genomic atlas of the Southern Ocean plankton"
http://pagesperso.univ-brest.fr/~maignien/contact.html
12.05.2016
Conférence Marti Gali-Tapias
Dr. Marti GALI-TAPIAS proposera le jeudi 12 mai à 14h (amphithéâtre) une conférence intitulée :
“Oceanic dimethylsulfide cycling. From upper-ocean budgets to large-scale estimates based on remote sensing data.”
Marti est actuellement en postdoc dans l'unité TAKUVIK à l'Université Laval (Québec).
Homepage: http://www.takuvik.ulaval.ca/team/marti_gali.php
16.02.2014
Conférence Nicolas Mouquet
Jeudi 6 février. Nicolas Moquet (Institut des Sciences de l'Evolution, Univ Montpellier)
"Phylogenetic constraints on ecosystem functioning"
It has been hypothesized that evolutionary history should influence the Biodiversity Ecosystem Functioning (BEF) relationship. This important new direction in the BEF literature is however based on few empirical investigations. Here we combine re-analysis...
27.02.2019
Conférence Paul Steiner
Paul Steiner, PhD student at the Dept. of Limnology & Bio-Oceanography, University of Vienna, will present a conference Friday 1st March at 11:00 entitled:
"Bacterial community dynamics and DMSP concentrations in marine snow and the ambient water of the Adriatic Sea”
https://www.microbial-oceanography.eu/
https://www.youtube.com/watch?v=_8U9mPNKv3w
09.12.2018
Conférence Pierre Barré
Pierre Barré chercheur CNRS au Laboratoire de Géologie de l’ENS à Paris, donneral le vendredi à 11 h une conférence dans l’amphithéâtre.
Caractériser et quantifier le carbone organique persistant dans les sols
Pierre Barré (Laboratoire de Géologie de l’ENS, UMR 8538)
Du fait de son importance pour la qualité des sols et les régulations climatiques, la matière organique du sol (MOS) a fait l’objet de...
12.05.2017
Conférence Ramon Massana (Insitut de Ciènces del Mar, CSIC, Barcelona)
Ramon Massana will present a seminar on Tuesday May 23 at 14:30 (Salle de conférence), entitled :
"Marine picoeukaryotes: Temporal and spatial dynamics accross large datasets"
Ramon Masssana obtained his PhD in Biology from the Autonomous University of Barcelona in 1993, focusing on trophic microbial interactions in a stratified lake. Afterwards, he spent two years as a postdoc in the University of...
06.03.2019
Conference Roberta Hansman
Dr. Roberta Hansman from the International Atomic Energy Agency (Monaco) will present a conference Friday 8th March at 11:00 entitled:
"Effects of Increased Temperature on Microbial Carbon Cycling in the Deep Ocean."
https://www.researchgate.net/profile/Roberta_Hansman/research
14.03.2017
Conférence Urania Christaki
Urania Christaki will present a seminar on Tuesday February 14 at 11:00h, entitled :
"The hidden diversity in a coastal marine ecosystem"
Urania Christaki, received her Bachelor degree in Biology from University of Athens. Then, she conducted two master degrees, first in Hydrobiology (University of St. Petersbourg, Russia) and then in Oceanography (University of Athens). In 1995 she defended her Ph...
30.05.2018
Conférence Valérie Barbe
Le LOMIC accueille Valérie BARBE pour une conférence intitulée "Le SAV des OMICs" le vendredi 1er juin à 11h (salle de conférences).
Valérie BARBE est chercheuse au CEA et responsable du "Laboratoire de biologie moléculaire pour l'étude des Génomes" au Génoscope d'Evry.
Résumé de la conférence :
Le Genoscope est le Centre National de Séquençage. Depuis sa création, il s’est spécialisé bien entendu dans...
06.12.2015
Découverte d’un mécanisme d’adaptation de certaines espèces de phytoplancton marin à la carence en fer
Des chercheurs issus d’un consortium de laboratoires mené par le LOMIC ont précisé le rôle de la ferritine dans l'adaptation de certianes espèces de phytoplancton à la carence au fer.
La ferritine est une protéine présente dans les cellules de très nombreux organismes, de l’homme à la bactérie, qui possède la capacité de stocker de grandes quantités de fer. En permettant la réutilisation du fer...
03.11.2020
Démarrage de deux nouvelles thèses au LOMIC
Deux nouvelles thèses au LOMIC démarrent en octobre 2020 :
-Rui ZHANG : Régulation microbienne de cycles de nutriments et de métaux traces dans l’Océan Austral.
- Maxime BEAUVAIS : Rôle des interactions biotiques dans la régulation des blooms phytoplanctoniques hivernaux sur un site côtier de Méditerranée nord ouest.
Nous leur souhaitons la bienvenue au LOMIC.
01.10.2016
Démarrage de trois nouvelles thèse au LOMIC en 2016
Trois nouvelles thèses ont démarrées au LOMIC en octobre 2016 :
Coco KOEDOODER étudiera l’interaction phytoplancton-bactéries dans le couplage des cycles du fer et du carbone dans l’océan.
Yan LIU travaillera sur la respiration et la matière organique dans l'Océan Austral.
Pavla DEBELJAK travaillera sur le couplage des cycles du carbone et du fer au travers du métabolisme microbien dans l'Océan Austral...
22.02.2020
Démarrage du projet ANR RESTORE
Le projet ANR RESTORE vise à étudier l’impact combiné des apports de matière organique dissoute et du réchauffement climatique dans les milieux aquatiques d’eau douce et marine, en s’intéressant plus particulièrement à la réponse structurelle et fonctionnelle des communautés microbiennes. Ce projet est porté par le LOMIC et regroupe cinq partenaires français (CEREEP, iEES Paris, MARBEC, ESE, ISYEB)...
02.12.2010
départ du container pour le Chili
LE LOMIC PARTICIPE AU REDEMARRAGE
DE L’OCEANOGRAPHIE AU CHILI
Après le tremblement de terre qui a frappé le Chili le 27 février 2010 (le 5ème en intensité enregistré depuis 1900), l'observatoire Océanologique de Banyuls s’est investi dans un mouvement de solidarité pour relancer l’océanographie Chilienne.
Les personnels du LOMIC ont largement contribué à cette opération, avec Camila fernandez...
24.10.2017
Doctoral thesis defense - Valentina Valdes
Valentina VALDES will defend her doctoral thesis on Tuesday October 31 at 14:00 - Amphithéâtre (videoconferencing with the University of Conception, Chile)
“The biogeochemical role of zooplankton for nitrogen and phosphorus recycling in the ocean”
The interaction between metazooplankton metabolism and the microbial loop is recognized as one of the principal mechanisms controlling the quantity, composition...
30.08.2013
Ecole Chercheur Chemostat
L'Ecole Chercheur "La Modelisation du Chemostat" s'est tenu du 4-7 Juin a Banyuls-sur-mer.
Cette école a été organisée par le LOMIC (UPMC/CNRS) et l'équipe INRA-INRIA MODEMIC
Comité d’organisation : Claude Lobry (email : lobrinria@wanadoo.fr) Ingrid Obernosterer (email : ingrid.obernosterer@obs-banyuls.fr) Alain Rapaport (email : rapaport@supagro.inra.fr)
Intervenants: Alain Rapaport...
30.08.2012
Ecole Chercheur Chemostat
L'Ecole Chercheur "La Modelisation du Chemostat" s'est tenue du 4-7 Juin 2012 à Banyuls-sur-mer.
Cette école a été organisée par le LOMIC (UPMC/CNRS) et l'équipe INRA-INRIA MODEMIC
Comité d’organisation : Claude Lobry (email : lobrinria@wanadoo.fr) / Ingrid Obernosterer (email : ingrid.obernosterer@obs-banyuls.fr) / Alain Rapaport (email : rapaport@supagro.inra.fr)
Intervenants: Alain...
16.08.2021
Expérience en mésocosmes à l'Ecotron Ile de France CEREEP
Après l’expérience en mésocosmes réalisée à MEDIMEER sur la lagune de Thau (cf. newsletter du mois de juin), une nouvelle expérience en mésocosmes a lieu actuellement sur la plateforme PLANAQUA du CEREEP-Ecotron Ile de France dans le cadre de l’ANR RESTORE (Fabien Joux).
Cette expérience vise à étudier les effets simples et combinés d’un apport de matière organique terrigène et d’une augmentation de...
06.10.2010
HDR: soutenance de Fabien Joux.
Le 6 Octobre 2010, dans l'amphithéâtre de l'Observatoire de Banyuls. Fabien Joux, Maitre de conférence à l'UPMC et directeur adjoint du LOMIC a soutenu son HDR intitulée : Effet directs et indirects du rayonnement solaire ultraviolet sur les communautés microbiennes marines.
09.05.2019
Ina Deutschmann conference
Ina Deutschmann, postdoc researcher at the Institut de Ciències del Mar, Barcelona, will give a seminar on Tuesday 21th May at 11:00, entitled: "Disentangling environmental effects in microbial association networks".
http://www.singek.eu/ina-deutschmann/
14.06.2015
Interlab meeting 2015 ICM-LOMIC
La 3ème rencontre Interlab MICROBES: Ecology and Biogeochemistry entre le LOMIC et l'Institut de Ciences del Mar (ICM) a eu lieu les 4 et 5 juin 2015 à Barcelona.
Organisateurs : Ingrid Obernosterer (LOMIC) & Josep Gasol (ICM)
Thursday June 4th
15:00 Continental erosion and the rise of diatoms - Pedro Cermeño (ICM)
15:15 Cocktail of organic matter and priming effect - Fabien Joux (LOMIC)...
04.10.2011
InterLab meeting LOMIC-CSIC 2013
Le 2ieme InterLab Meeting organisé par le LOMIC et l'Institut Ciences del Mar a pris place le 4/5 Février 2013. 26 chercheurs, postdoc et etudiants sont venus à Banyuls pour un échange scientifique autour de présentations de travaux récents.
15.06.2011
Journée du LOMIC 2011
La journée du LOMIC 2011 s'est déroulée aux terrasses de Collioure le 14 Juin .
Elle a été l'occasion au travers de 17 présentations et de nombreuses discussions de faire un tour d'horizon des recherches actuellement en cours au sein de l'unité.
09:00 09:30ACCUEIL 09:30 09:45Ian S.résultats µprojet 2010 09:45 10:00Camila F.résultats µprojet 2010 Etude de la sensibilité...
06.06.2012
Journée du LOMIC 2012
La journée du LOMIC 2012 s'est déroulée aux terrasses de Collioure le 4 Juin .
Elle a été l'occasion au travers de 18 présentations et de nombreuses discussions de faire un tour d'horizon des recherches actuellement en cours au sein de l'unité.
09:00 09:30ACCUEIL 09:30 09:45Ian Salter.pyroséquencage MOLA 09:45 10:00Florence Corelloucapteurs en plaque de variation de...
14.06.2013
Journée du LOMIC 2013
La journée du LOMIC 2013 s'est déroulée au terrasses de Collioure le 13 Juin.
09.07.2014
Journée du LOMIC 2014
La journée du LOMIC s'est déroulée le 11 juin 2014. Au cours de cette journée, 15 présentations ont été réalisées.
Programme de la journée (52 KB)
02.08.2016
Journée du LOMIC 2016
La journée du LOMIC 2016 s'est tenue le 2 juin au Jardin Méditerranéen de Banyuls.
Programme :
10:20 - Mathieu REMBAUVILLEComposition en lipides des flux d'export dans l'Océan Austral
10:40 - Natalia LLOPISLimitation en éléments nutritifs et formation de spores de résistance chez Chaetoceros hyalochaete
11:00 - Valérie VERGÉLe projet Moore : transformation génétique des picoeucaryotes phytoplanctoniques...
30.05.2018
Journée du LOMIC 2018
La journée du LOMIC 2018 se tiendra le vendredi 8 juin au Jardin Méditerranéen de Banyuls.
Programme :
09:00 - Welcome
Theme 1: Regulation of microbial functions by environmental parameters
09:10 – Coco KOEDOODER
The role of the glyoxylate shunt in the acclimation to iron stress in a marine heterotrophic bacterium
09:30 – Tanguy SOULIE
Impact of the nutrients and vitamins availabilities on microcosms...
20.11.2014
Journées d'écotoxicologie microbienne, 21-23 mai 2014
Ces journées ont pour objectif principal de réunir les écologistes microbiens qui étudient les conséquences des pollutions sur les communautés microbiennes et les services rendus par les microorganismes dans le domaine de la qualité écologique des milieux naturels. Elles seront un moment d’échange sur les avancées et les approches transversales utilisées en écotoxicologie microbienne dans différents...
20.12.2013
Journées d'écotoxicologie microbienne, 21-23 mai 2014
Ces journées ont pour objectif principal de réunir les écologistes microbiens qui étudient les conséquences des pollutions sur les communautés microbiennes et les services rendus par les microorganismes dans le domaine de la qualité écologique des milieux naturels. Elles seront un moment d’échange sur les avancées et les approches transversales utilisées en écotoxicologie microbienne dans différents...
10.09.2012
KEOPS2 : colloque post campagne
Soixante cinq participants du projet international KEOPS2, piloté par le LOMIC, se sont réunis du 5 au 7 septembre à Banyuls pour examiner les premiers résultats obtenus pendant la campagne océanographique qui s'était déroulée en octobre novembre 2011. les 35 présentations ont été suivies de nombreuses discussions. De celles ci vont découler la présentation des résultats dans des conférences internationales...
21.10.2020
L’échantillonnage automatisé dans l’océan Austral : un défi relevé avec succès au large des îles Kerguelen
Des chercheurs du Laboratoire d’océanographie microbienne (LOMIC, CNRS / Sorbonne Université), avec le soutien de la Division technique de l’INSU, viennent de franchir une nouvelle et importante étape en déployant un préleveur autonome à 50 m de profondeur au cœur des 50e hurlants. D’octobre 2016 à avril 2017, ce préleveur autonome a échantillonné tous les 11 jours l’océan ambiant. Un piège à particules...
L'horloge d'Ostreococcus décodée
Les chercheurs du Laboratoire d’Océanographie Microbiologique (UMR7621 CNRS, Banyuls-sur-Mer) ont développé un nouveau modèle biologique ; la microalgue Ostreococcus. L’étude de l’horloge interne de ce microorganisme constitue une étape clé dans la compréhension de la physiologie générale du phytoplancton et dans le développement de nombreuses applications en biotechnologie. Ces travaux ont...
04.10.2011
La campagne KEOPS2 en ligne
La campagne KEOPS piloté par le LOMIC quittera l'ile de la Reunion le 8 octobre. 9 scientifiques du LOMIC participerons à cette expédition de deux mois dans les 50eme hurlants. Pour suivre le déroulement de la campagne suivre le lien
19.10.2017
La variabilité des stocks biologiques de carbone dans l’océan Austral révélée par les flotteurs BGC-Argo
Plusieurs décennies de recherche ont été nécessaires pour faire émerger le rôle majeur joué par l’océan Austral dans le cycle du carbone et le contrôle du climat. Toutefois, son éloignement et les conditions météorologiques extrêmes ont rapidement imposé de sérieuses limites à l’acquisition de nouvelles données par les approches classiques, essentiellement basées sur des campagnes océanographiques...
25.02.2011
Le LOMIC à la recherche des cascades
5 membres du LOMIC, P. Conan, J. capparos, C. Sauret, T. Séverin et M. Agab, embraquent sur le N/O Atalante pour cette mission
La région du Cap de Creus avec son canyon adjacent est la principale zone d'exportation des eaux denses formées pendant l’hiver par refroidissement rapide des eaux de surface sur le plateau continental du Golfe du Lion (Méditerranée Nord Occidentale ; Fig. 1A). Des couplages...
20.06.2010
Le LOMIC en Corse
Jocelyne Caparros a participé du 20 juin au 11 juillet au projet DUNE piloté par C. Guieu du LOV. Le déploiement de grands mésocosmes dans la réserve marine de Scandola a pour objectif d'étudier l'impact des dépôts de poussières sahariennes sur les cycles biogéochimiques en mer Méditerranée. Le LOMIC a en charge dans ce projet l'étude de la communauté bactérienne (diversité et activité).
09.07.2014
Le projet SOCLIM soutenu par la Fondation BNP Paribas
Dans le cadre de son programme Climate Initiative, la Fondation BNP Paribas soutient 5 nouveaux projets de recherche scientifique sur le changement climatique pour un montant de 2,7 millions d’euros sur trois ans.Parmi ces 5 projet, figure le projet SOCLIM (Southern Ocean and Climate), dont les coordinateurs sont Stéphane Blain (LOMIC, Banyuls), Hervé Claustre (LOV, Villefranche)...
12.06.2019
Les sources hydrothermales profondes stimulent des efflorescences phytoplanctoniques dans l’océan Austral
Une équipe internationale incluant le LOMIC (Stéphane BLAIN, Mathieu REMBAUVILLE) révèle pour la première fois la présence d’efflorescences phytoplanctoniques directement stimulées par les apports en fer dissous de sources hydrothermales profondes dans l’océan Austral. Cette découverte a été obtenue en combinant des observations de flotteurs profileurs avec des données historiques d’éléments traces...
09.10.2015
Lien entre diversité bactérienne et cycle du carbone dans l’océan Austral
Des chercheurs du Laboratoire d’océanographie microbienne (LOMIC/OOB, CNRS / UPMC) et du Laboratoire d’océanologie et de géosciences (LOG, CNRS / Université du Littoral Cote d’Opale / Université de Lille 1) ont collecté, pendant la campagne KEOPS2 dans l’océan Austral, un jeu de données inédit combinant des mesures de flux de carbone et de biodiversité microbienne. Les chercheurs ont ainsi pu démontrer...
01.10.2018
Lucas Tisserand démarre une thèse au LOMIC
Lucas Tisserand a débuté en octobre une thèse avec un contrat doctoral de Sorbonne Université (ED129), sous la direction de Fabien Joux, sur l’étude la biodégradation de la matière organique d’origine terrigène dans les milieux aquatiques marins et d’eau douce et l’identification des acteurs microbiens. Il s’agit d’un travail qui sera réalisé en partie sur différentes plateformes expérimentales (CEREEP...
Marion Fourquez
The goal of my thesis is to investigate the implication of heterotrophic bacteria in iron and carbon cycles in the ocean.
My first objective is to develop a sensitive method to determine which bacterial groups are involved in the uptake of iron using micro-FISH technique (microautoradiography associated with fluorescence in situ hybridization).
I'm also focusing on their responses to iron limitation...
16.07.2012
Massive Phytoplankton Blooms Under Arctic Sea Ice
Durant son séjour postdoctoral au LOMIC, Eva Ortega-Retuerta a participé à trois missions océanographiques en Articque. Durant l'une d'entre elles, réalisée en juillet 2011 dans la Mer des Tchouktches (Chukchi Sea), des biomasses extrêmement élevées de phytoplancton ont été mesurées à l'interface mer / glace. Une meilleure prise en compte de l'importance de ces blooms est nécessaire dans le contexte...
16.07.2012
Massive Phytoplankton Blooms Under Arctic Sea Ice
Durant son séjour postdoctoral au LOMIC, Eva Ortega-Retuerta a participé à trois missions océanographiques en Articque. Durant l'une d'entre elles, réalisée en juillet 2011 dans la Mer des Tchouktches (Chukchi Sea), des biomasses extrêmement élevées de phytoplancton ont été mesurées à l'interface mer / glace. Une meilleure prise en compte de l'importance de ces blooms est nécessaire dans le...
Melissa Laghdass
October 2008-November 2010
Phd student, Université Pierre et Marie Curie (Paris, France)
Supervisors: I. Obernosterer and P Lebaron
Thesis defense: November 30 2010 at Banyuls sur mer
Current position: Post-Doc at the University of Rouen (France), CNRS UMR 6143, Morphodynamique Continentale et Côtière (M2C), Groupe de Microbiologie
Education
2007- MSc at the University of Lille...
30.06.2014
MICROPHYT et le LOMIC créent un laboratoire de recherche commun
La société MICROPHYT et le Laboratoire d’Océanographie Microbienne créent un laboratoire de recherche commun LABCOM. Ce projet financé pour 3 ans par l'ANR (appel d'offre « Laboratoires Communs – Organismes de recherche / PME-ETI »), est coordonné par François-Yves Bouget (DR CNRS, LOMIC) et Rémi Pradelles (Société Microphyt).
Ce nouveau projet dénommé OTARI (acronyme de Ostreococcus Tauri de la...
08.01.2020
Mission BINGO à Kerguelen
Stéphane Blain, Ingrid Obernosterer, Audrey Gueneugues et Olivier Crispi sont partis pour une mission de deux mois et demi (mi-décembre-fin février) sur l’île Kerguelen afin d’étudier le rôle de la fonte des glaciers en tant que source de fertilisation en fer dans l’océan Austral. Cette région du globe joue un rôle majeur dans la régulation du CO2 atmosphérique et donc du climat, mais l’absorption...
23.11.2015
MOORE Foundation
$8M awarded to scientists from the Gordon and Betty Moore Foundation to accelerate development of experimental model systems in marine microbial ecology
Le LOMIC fait parti des bénéficiaires de l'initiative en Microbiologie Marine financé par la MOORE Foundation pour accélérer le développement de modèles expérimentaux de microorganismes marins.
Communiqué de presse de MOORE Foundation
28.06.2019
Nouvelle UE de Licence3 - Réponses des microorganismes aux changements globaux
Une nouvelle UE de Licence3 sera proposée à Sorbonne Université en avril 2020. Cette UE intitulée "Réponses des microorganismes aux changements globaux : conséquences écologique, sanitaires et sociétales (CHANGE)" présente différentes illustrations de la réponse des microorganismes aux changements globaux qui affectent la planète et les conséquences sur la santé des hommes, des animaux et de l’environnement...
07.07.2014
Participation à la mission Tara Méditerranée sur les microplastiques
Jean-François Ghiglione participe à la mission Tara Méditerranée qui a pour objectif d’évaluer l’impact des micro-plastiques sur la santé et le fonctionnement des écosystèmes en mer Méditerranée. Cette campagne de 7 mois permettra d’évaluer l’étendue du problème des plastiques qui s’accumulent de manière alarmante en mer Méditerranée. En collaboration avec d’autres laboratoires français et étrangers...
29.08.2016
Participation du LOMIC à l'expédition Green Edge en Arctique pour étudier l’impact de la réduction de la banquise sur la productivité de l’écosystème
Le LOMIC est impliqué dans le projet de recherche international Green Edge (« Phytoplankton spring bloom in the Arctic Ocean: past, present and future response to climate variations, and impact on carbon fluxes and the marine food web » 2014-2018 (http://www.greenedgeproject.info)) qui s’intéresse à la productivité primaire dans l’Océan Arctique et au devenir de la matière organique produite par le...
14.11.2017
Parution des prospectives INSU Océan atmosphère 2017-2022
Le bilan et les prospectives 2017-2022 de la Commission Spécialisée Océan Atmosphère (CSOA) de l'Institut National des Sciences de l'Univers viennent de paraitre.
Ce travail constitue la synthèse des ateliers préparatoires et du colloque de Toulouse (15-17 nov. 2016) réalisée sous la direction de Stéphane Blain, Président de la CSOA.
Le LOMIC a également contribué à ce travail au travers de la participation...04.03.2022
PhD Thesis Proposition: Bioavailability of glacial iron to microbes in the Southern Ocean
The main objective of the PhD thesis is to investigate the bioavailability of different forms of glacial Fe to microorganisms in the SO. The determination of the bioavailability of Fe is a challenging issue, because not all the chemical forms of Fe are equally available. A biological approach to address this question is based on the metabolic activity and gene expression profiles of taxonomically...
12.10.2012
Photorésistance UV de Photobacterium révélée par la protéomique
A lire dans :
Matallana-Surget S., JouxF., Wattiez
R., Lebaron P. (2012) Proteome analysis of the UVB-resistant marine bacterium, Photobacterium angustum S14.
PlosOne 7(8): e42299
12.10.2012
Photorésistance UV de Photobacterium révélée par la protéomique
A lire dans :
Matallana-Surget S., JouxF., WattiezR., Lebaron P. (2012) Proteome analysis of the UVB-resistant marine bacterium, Photobacterium angustum S14. PlosOne 7(8): e42299.
11.03.2011
Préparatifs pour les mers australes
Le projet international KEOPS2, piloté par des chercheurs du LOMIC, a pour objectif d’étudier le rôle de l’océan austral dans le contrôle du climat et le fonctionnement de l’écosystème marin. Cinquante scientifiques de 9 laboratoires français et 6 instituts étrangers s’embarqueront en Octobre 2011, à destination des cinquantièmes hurlants, sur le Navire Océanographique Marion Dufresne de l’IPEV**...
03.09.2018
Prix du meilleur poster étudiant au 17th ISME-meeting et soutenance de thèse en octobre pour Laëtitia Dadaglio
Laëtitia a reçu l’un des prix décernés aux meilleurs posters étudiants au 17th International Symposium on Microbial Ecology (ISME-meeting) qui a eu lieu en août à Leipzig (Allemagne) avec un poster intitulé « How do the phytoplankton spring blooms reshape the bacterial community composition in the Arctic Ocean? ».
Laëtitia soutiendra sa thèse intitulée « Dynamique des communautés bactériennes en réponse...
25.09.2014
Publication in Cell journal: Determination and Inference of Eukaryotic Transcription Factor Sequence Specificity
Détermination et prédiction des sites de reconnaissance des facteurs de transcription eucaryotes
Un consortium international mené par des chercheurs de l’Université de Toronto, auquel est associé le Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC, UMR7621 UPMC-CNRS, Observatoire Océanologique, Banyuls sur Mer) a déterminé et prédit les séquences ADN de fixation d’environ un tiers des facteurs de...
11.11.2014
Publication in Nature Geosciences: Carbonate counter pump stimulated by natural iron fertilization in the Polar Frontal Zone
Une nouvelle étude réalisée dans l'océan Austral par une équipe internationale de scientifiques impliquant Ian SALTER du Laboratoire d’Océanographie Microbienne (actuellement en détachement au Alfred Wegener Institute, Germany), révèle que la réponse de l'écosystème marin à un enrichissement naturel en fer est plus complexe et moins efficace à long terme, du point de vue du stockage du dioxyde...
11.11.2014
Publication in Plant Cell: Efficient gene targeting and foreign DNA removal by homologous recombination in the picoeukaryote Ostreococcus
With fewer than 8000 genes and a minimalist cellular organization, the green picoalga Ostreococcus tauri is one of the simplest photosynthetic eukaryotes. Ostreococcus tauri contains many plant-specific genes but exhibits a very low gene redundancy. The haploid genome is extremely dense with few repeated sequences and rare transposons. Thanks to the implementation of genetic transformation and vectors...
Publications 2008
2008
Abboudi M, Jeffrey WH, Ghiglione JF, Pujo-Pay M, Oriol L, Sempéré R, Charrière B, Joux F Effects of photochemical transformations of dissolved organic matter on bacterial metabolism and diversity in three contrasting coastal sites in the Nothwestern Meditteranean Sea. Microb Ecol 55:344-357
Abboudi M, Matallana-Surget S, Rontani J-F, Sempéré R, Joux F (2008) Physiological alteration...Publications 2011
59 publications
Auger P. A, Diaz F, Ulses C, Estournel C, Neveux J, Joux F, Pujo-Pay M, Naudin J-JFunctioning of the planktonic ecosystem of the Rhone River plume (NW Mediterranean) during spring and its impact on the carbon export: a field data and 3-D modelling combined approach. Biogeosciences 8:3231-3261 (IF : 3.246)
Aggarwal RK, Allainguillaume J, Bajay MM, … Medlin L, et al. Permanent Genetic...
19.01.2012
Reconnaissance pour Ingrid Obernosterer
Le comité éditorial de la revue Limnology and Oceanography a désigné dans son bulletin Volume 20(4) December 2011, Ingrid Obernosterer comme "outstanding reviewer" . Ceci récompense la qualité du travail d'arbitre effectué pour cette revue .
OUTSTANDING L&O REVIEWERS Peer review is a crucial component of modern science. The fact that L&O is able to utilize the services of the best scientists as...
08.07.2018
Recrutement d'Eva Ortega-Retuerta comme chercheuse au CNRS
Eva Ortega-Retuerta a intégré en juin le LOMIC comme chargée de recherche au CNRS en section 19. Eva développera un projet de recherche intitulé "The microbial carbon pump in a changing Mediterranean Sea".
L'ensemble du LOMIC lui souhaite la bienvenue.
Figure 1. The biological carbon pump; adapted from https://earthobservatory.nasa.gov. The microbial carbon pump loop is drawn in yellow
04.01.2012
Remise de prix à Camila Fernandez
Camila Fernandez, chercheur au LOMIC (2ème à droite sur la photo) a reçu le prix leader du Sud :
La région de Concepcion au Chili distingue chaque année à travers ce prix "les 50 jeunes talents de toutes les disciplines dont l’activité professionnelle et les qualités personnelles qui ont fortement contribué au développement régional". Le prix a été remis le 29 décembre 2011 dans l’amphithéâtre du...
04.10.2011
Rencontre scientifique avec Institut de Ciències del Mar
Le LOMIC et le Institut de Ciènciès del Mar ont organisé leur première rencontre scientifique du 28 au 29 septembre à Barcelone. Une trentaine de chercheurs dont 11 du LOMIC a participé à des présentations, discussions et moments de convivialité. Cette rencontre a été très enrichissante et rendez vous est pris pour la deuxième rencontre en 2012, à Banyuls sur mer.
17.10.2013
Réunion de travail sur les campagnes Dewex à Banyuls
Les participants aux campagnes DeWEX du projet MermEX se sont réunis à Banyuls sur Mer les 17 et 18 octobre 2013 pour présenter les résultats préliminaires et évoquer les perspectives et la valorisation des données des 2 campagnes de février et d’avril dans un contexte d’observation intensif de la Méditerranée Nord occidentale (hiver 2013 -2013).
16.06.2015
Séminaire Alessandro Tagliabue
Le Dr. Alessandro TAGLIABUE est accueilli au LOMIC par Stéphane BLAIN du 30 juin au 3 juillet 2015.
Il donnera à cette occasion une conférence le mercredi 1er juillet à 11h (Amphithéâtre A. Guille)
Role of Hydrothermal Vents in the Global Ocean Iron Cycle
SUMMARY:
Hydrothermal vents were only discovered in the late 1970s thanks to advances in undersea technology. Around the same time, new...
03.05.2012
Séminaire de Christophe Guinet
Effet de la variabilité des conditions océanographiques sur le comportement de pêche à fine échelle chez l'éléphant de mer
Séminaire Jeudi 03 mai 2012, Amphi A, 14:00Les ressources marines se répartissent dans l'espace en fonction des conditions océanographiques, qui jouent un rôle prépondérant (structure frontale, système upwelling, zone de glace de mer, zone d’apports fluviaux, teneur...
06.05.2011
Séminaire de Jean Armengaud
A l'invitation du LOMIC, Jean Armengaud, Chercheur au laboratoire de biochimie des systèmes perturbés du CEA à Marcoules, présente un séminaire intitulé : Les contes des mille et une protéines : protéo-génomique de microorganismes d’environnements extrêmes.
Il exposera notamment les derniers résultats de ses recherche montrant comment l'étude des protéomes bactériens...
20.02.2014
Séminaire de Stefan Bertilsson
Pr. Stefan Bertilsson (Limnology Department Evolutionary Biology Centre, University Uppsala, Sweden)
March 10th at 14:00 (Amphitheatre, bâtB)
"Exposing the freshwater microbiome at the level of genes, genomes and metagenomes"
Abstract:Freshwater lakes and marine ecosystems behave similarly in many ways, yet their resident microbial communities are fundamentally different...
10.09.2014
Séminaire Eva Sintes
Dr. Eva Sintes (Microbial Oceanography Lab, University of Vienna, Austria), présentera le 17 septembre à 11h une conférence intitulée "Functional biogeography of deep ocean microbes".
Abstract :Microbial biogeography and biodiversity have been studied extensively over the past decades. Most studies focused on the taxonomic characterization based on 16S rRNA gene. However...
23.04.2014
Séminaire Isabelle Carré
Isabelle CARRE (University of Warwick – UK) est présente au LOMIC dans le cadre d’Assemble (collaboration F-Y. Bouget), elle propose un exposé de ses travaux : Circadian clocks and their contribution to environmental stress tolerance Vendredi 25 avril à 11h00 en Amphithéâtre (Bat B)
Plants are unable to evade changes in their environment but are capable of adaptation. An endogenous 24-h biological...
19.04.2019
Sensing the Rainbow - conference Betty Sands
Betty Sands will give a talk on Friday the 19th April at 11:15 am at the amphitheatre.
She will describe her findings on the responses of the green algae Ostreococcus to red, green and blue light wavelengths and discuss her plans for further analysis. Techniques include differential gene expression from RNASeq data and comparison with measurements of photosynthetic parameters using the Phyto-PAM.
Betty...
19.06.2012
Soutenance de HDR de Ingrid Obernosterer
Les travaux intitulés : "Dissolved organic matter-bacteria interactions in the ocean" ont été présenté par Ingrid Obernosterer (CR CNRS) le lundi 18 juin à 14h dans l'amphithéâtre de l'observatoire devant le jury composé des rapporteurs Olivier Pringault (Chargé de Recherche, IRD, ECOSYM, Montpellier, Marie-Alexandrine Sicre (Directrice de Recherche, CNRS, LSCE...
06.06.2012
Soutenance de HDR de Jean-François Ghiglione
Jean-François Ghiglione a soutenu sa HDR le 5 juin 2012 dans l'amphithéâtre de l'observatoire. Ses travaux sont intitulés : Biodiversité bactérienne en milieu pélagique Influence des facteeus environnementaux et rôle dans le cycle du carbone
22.11.2010
Soutenance de thèse
Mélissa Lagdhass soutiendra sa thèse le Lundi 29 Novembre à 14 h dans l'amphithéâtre du bâtiment B. Son travail co-encadré par I. Obernosterer et P. Lebaron est intitulé :
Réponse de la communauté bactérienne marine à différentes sources nutritives : lien entre activité et diversité
Résumé:
L’étude de la relation entre la structure des communautés bactériennes marines et des différentes sources...
13.10.2020
Soutenance de thèse - Justine Jacquin
Justine Jacquin soutiendra sa thèse intitulée “Ecotoxicologie microbienne des plastiques en mer : colonisation et biodégradation par la plastisphère » le vendredi 16 octobre à 9h.
Résumé : De nos jours, les déchets plastiques ont envahi l’ensemble des écosystèmes marins du monde en n’épargnant aucune zone. La demande mondiale de plastique ne cesse de croitre d’année en année, malgré l’impact...
02.10.2017
Soutenance de thèse de Claire Dussud
Claire Dussud a soutenu sa thèse intitulée « La caractérisation des communautés microbiennes associées à la colonisation des déchets plastiques en mer » le 2 octobre 2017.
Résumé :
La prise de conscience récente de la menace qui pèse sur les océans, réceptacle final de la pollution plastique, a donné lieu à une effervescence dans le domaine scientifique. On estime que plus de 5,25 milliards de particules...
17.09.2012
Soutenance de thèse de Marion Fourquez
Marion présentera ses travaux de thèse intitulés, le lundi 24 Septembre, à 14 h dans l'amphithéâtre du Batiment A.
résumé des travaux : Le fer est un élément indispensable à la quasi-totalité des formes de vie sur Terre. Cependant, en milieu marin, sa biodisponibilité pour les microorganismes est particulièrement faible. En milieu océanique, le fer limite la production primaire et les processus...
20.09.2016
Soutenance de thèse de Mathieu Rembauville
Mathieu Rembauville a soutenu sa thèse intitulée « Ecological vectors of carbon and biomineral export in the Southern Ocean » le 20 septembre 2016 devant un jury composé de:
Stephanie Henson NOC, Southampton, Angleterre Rapporteur
Christine Klaas AWI, Bremerhaven, Allemagne Rapporteur
Tom Trull CSIRO, Hobart, Australie Examinateur
Bernard Quéguiner MIO, Marseille, France Examinateur
Damien Cardinal LOCEAN...
19.12.2014
Soutenance de thèse Hugo Botebol
Hugo Botebol a soutenu sa thèse le jeudi 11 décembre intitulée : "Influence de la lumière et de l'horloge circadienne dans la gestion de la carence en chez le genre Ostreococcus"
Résumé: Le fer est un élément présent en abondance dans la croûte terrestre, indispensable à la quasi totalité des êtres vivants. Cependant, en milieu marin la biodisponibilité du fer est souvent faible et sporadique...
27.01.2015
Soutenance de thèse Marine Blanchet
Marine BLANCHET a soutenu sa thèse en cotutelle UPMC - Université Conception (Chili) et intitulée "Metabolic and composition changes in marine bacterial community exposed to variable natural organic matter bioreactivity" le Vendredi 16 Janvier 2015 devant le jury composé de :
Dr. Emma Rochelle-Newall (rapporteur)
Dr. Cristian Vargas (rapporteur)
Dr. Thierry Bouvier (examinateur)
Dr. Cristian Gallardo...
08.09.2014
Soutenance de thèse Tatiana Séverin
Tatiana Séverin soutiendra le Mardi 23 septembre à 13h30 dans l'amphithéâtre sa thèse intitulée "Régulation des cycles biogéochimiques par les communautés microbiennes pélagiques sous influence de perturbations physiques à méso-échelle".
Résumé :
Les épisodes de convection en milieu hauturier sont des processus physiques hivernaux récurrents, mais irréguliers, ayant un fort pouvoir perturbateur...
05.01.2017
Soutenance HDR de Camila Fernandez
Camila Fernandez soutiendra son habilitation à diriger des recherches le vendredi 20 janvier 2017 à Banyuls.
Distribution, regulation and diversity of Nitrification and N2 fixation, two key processes of the marine nitrogen cycle
Résumé : Le cycle marin de l’azote fourni des sels nutritifs et/ou énergie pour une large fraction de la communauté microbienne. Il agit dans un continuum de conditions physico-chimiques...
03.01.2016
Soutenance thèse Denisse Sanchez
Denisse Sanchez a soutenu sa thèse intitulée "Rôle des mécanismes abiotiques et biotiques dans la dynamique de la matière organique dissoute dans les écosystèmes marins pélagiques (Méditerranée Nord Occidentale)" le Mardi 6 octobre 2015 à l'Observatoire Océanologique de Banyuls.
Résumé :
Dans la présente étude qui effectue un premier bilan de la distribution et du devenir de la CDOM/FDOM aux...
22.09.2014
Special Issue Publication Announcement: Microbial Ecotoxicology
A special issue of "Environmental Science and Pollution Research" (IF 2.76) dedicated to « Microbial Ecotoxicology » is open from 1st October 2014 to 31th January 2015.
This special issue welcomes the most recent developments, researches and ideas in microbial ecotoxicology, with no restriction of the ecosystem studied. Potential topics include, but are not limited to:• microbial bioassays, biomarkers...
29.01.2020
Start of LIA MAST
The international associated laboratory Multiscale Adaptive STrategies Laboratory (LIA MAST) provides a comprehensive analysis of the diverse adaptive strategies found in nature at distinct levels of biological organization including molecules, genes, cells, organisms and ecosystems. As this effort will integrate biological sciences, earth sciences and ecological sciences at 6 institutions in France...
18.07.2018
Suivez le LOMIC sur Twitter
Le Laboratoire d'Océanographie Microbienne LOMIC est maintenant sur Twitter - Suivez l'actualité de nos recherches et découvrez les projets auxquels nous participons !
https://twitter.com/LOMIC_UMR7621
09.04.2014
Sujets de thèse LOMIC 2014
Le Laboratoire d'Océanographie Microbienne propose deux sujets de thèses en 2014 soumis à financement à l'Ecole Doctorale Sciences de l'Environnement (ED129) :
Sujet 1 - Respiration microbienne et source de matière organique dans l’océan (Responsable : Dr. Ingrid Obernosterer)
Détail du sujet (77 KB)
Sujet 2 - Caractérisation des communautés microbiennes associées à la colonisation et à la...
30.11.2012
Symposium on UV radiation at COPAS
Dans le cadre du LIA MORFUN un symposium intitule "UV radiation and marine ecosystems: Current research and strategies for the future" sera organisé au COPAS (Concepcion, Chile) le 5-7 Decembre 2012.
Deux chercheurs de notre équipe, Camila Fernandez et Fabien Joux, sont invitées au symposium et presenteront leurs travaux recents sur le sujet.
Lire plus http://www2.udec.cl/oceanoudec/pag_ASI13/eng/descrpcion...
26.06.2019
Tara trace les plastiques des fleuves
Le 23 mai, la goélette de la Fondation Tara Océan a quitté Lorient pour une expédition de six mois sur les fleuves européens. À son bord, une quarantaine de scientifiques chargés d’évaluer la concentration de déchets plastiques charriés par les fleuves et leur impact sur les organismes marins.
Jean-François Gighiglione est le responsable de cette mission scientifique.
Journal du CNRS
https://lejournal...
16.08.2021
The missing ocean plastic sink: gone with the rivers
Jean-François Ghiglione est co-auteur d’un article qui vient d’être publié dans la revue Science, intitulé "The missing ocean plastic sink: gone with the rivers". Cet article a été piloté par nos collègues du CEFREM, en collaboration avec le LOMIC, le LEGOS et l’Université de Barcelone. Il fait partie d’un numéro spécial de la revue Science intitulé "Our plastics dilemma".
https://science.sciencemag...
20.09.2019
Thesis defenese - Yan LIU
Friday 20th September at 10:00, Yan LIU will be defending her PhD in the amphitheatre A. Guille.
Her thesis is titled: "Spatial and temporal patterns in diatom-prokaryote associations in the Southern Ocean"
and will be examined by the following jury committee members:
Josep Gasol, Sébastien Monchy, Dominique Lamy, Emma Rochelle-Newalland Ingrid Obernosterer.
21.10.2019
Thesis defense - Coco Koedooder
Monday, 21st of October at 14:00, Coco Koedooder will be defending her PhD in the amphitheatre A. Guille.
Her thesis is titled: "The interplay between Fe-limitation, carbon and light in a (photo)heterotrophic bacterium"
and will be examined by the following jury committee members:
Yeala Shaked, Hebrew University of Jerusalem, IS (rapporteur)Eric Rosenfeld, Université de la Rochelle, FR (rapporteur)Emma...
12.10.2020
Thesis defense - Jingguang Cheng
Monday, 12st of October at 14:00, Jingguang Chengwill defend his PhD tilted "Microplastics in the marine environment: an ecotoxicological perspective".
Abstract : Oceanic plastic pollution is of major concern, with several million tonnes of plastic dumped in the ocean every year that are causing health threat to marine creatures. Impacts have been found at all the trophic chain levels from the zooplankton...
18.10.2019
Thesis defense - Pavla Debeljak
Pavla Debeljak will defend her PhD titled « The coupling of carbon and iron cycles in the Southern Ocean through microbial metabolism» .
It will take place in the amphitheatre Alain Guille on Friday, 18th of October at 9.30 pm.
18.04.2019
Thesis defense - Stefan Lambert
On Thursday the 18th of April at 14h, Stefan Lambert will be defending his PhD on the Seasonality and dynamics of microbial consortia in the Bay of Banyuls.This will take place in the amphitheater A. Guille.
Résumé:Dans les océans tempérés, les transitions printanières annuelles sont accompagnées de blooms phytoplanctoniques. Le phytoplancton joue un rôle essentiel dans les cyclesbiogéochimiques et...
18.10.2018
Tom Delmont conference and introduction to the anvi'o interface
Tom Delmont, postdoc researcher at the Genoscope on the TARA Oceans project, will visit the LOMIC on Thursday 18th October.
http://merenlab.org/tutorials/infant-gut/
Tom will also give a research seminar at 14:00 entilted:
"From metagenomes to genomes and back: high resolution surveys of marine microbial populations"
https://www.researchgate.net/profile/Tom_Delmont
08.03.2010
Tremblement de terre au Chili
Camila Férnandez chercheuse CNRS au LOMIC, se trouvait à Conception lors du violent tremblement de terre qui a secoué la région le 27 février 2010. Elle y développe un actif programme de collaboration avec le COPAS. La station marine de Dichato a totalement été détruite par le tsunami ainsi que la plus part des équipements océanographiques (bateaux, outils de prélèvements, containers d'équipements)...
20.11.2013
Une microalgue pour détecter des produits toxiques
La microalgue marine Ostreocccus tauri est la plus petite cellule à noyau (eucaryote) connue. La transformation génétique de cette microalgue a permis de développer des biocapteurs luminescents capables de mesurer l’effet toxique de molécules utilisées dans les peintures antifouling de manière plus sensible que les tests écotoxicologiques classiques. L’automatisation du procédé de mesure...
08.11.2016
Une plateforme microalgale au service de la biotechnologie
La société Microphyt et le Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC – UPMC/CNRS) ont créé le laboratoire de recherche commun OTARI (acronyme de Ostreococcus tauri de la Recherche à l’Industrie), dont les coresponsables sont François-Yves Bouget (partie académique), directeur de recherche CNRS, et Rémi Pradelles (partie industrielle), en 2014 afin de développer une plateforme microalgale permettant...
11.04.2018
Une réévaluation de l'importance des petites diatomées du nanoplancton à l'échelle globale entraîne une révision des flux de carbone dans les écosystèmes pélagiques
Dans le cadre du programme DeWex-MERMEX, Mireille Pujo-Pay et Pascal Conan (LOMIC) ont participé à la rédaction d'un article paru dans Nature Communications en collaboration avec des membres du MIO de Marseille, du CEFREM de Perpignan, de l'École Normale Supérieure de Paris, du Simons Centre en inde, du CEA-Genoscope d'Evry, et de la station biologique de Roscoff.
Les diatomées sont l'un des principaux...
23.02.2012
Utiliser la génomique pour étudier le cycle du fer dans l’océan
Une collaboration entre les équipes du laboratoire Biologie intégrative et organismes modèles (BIOM, CNRS / UPMC) et du Laboratoire d’océanographie microbienne (LOMIC, UPMC / CNRS) et un expert en modélisation du cycle du fer dans l’océan vient de montrer que l’analyse du génome de populations naturelles de microorganismes marins apportent des informations nouvelles sur les stratégies déployées par...
11.06.2012
Visite de Phil Boyd
Philip Boyd, professeur à l'Université d'Otago, Dunedin (Nouvelle Zélande) sera en visite au LOMIC jeudi 14 juin. A cette occasion il donnera un séminaire à 11h dans l'amphithéâtre :
Mapping phytoplankton iron utilization: Insights into Southern Ocean supply mechanisms
The emerging field of ocean iron biogeochemistry has prompted interest in the identification and quantification of Fe...
22.10.2010
Visite de Maria Nielsdottir
Dr. Maria Nielsdottir is presently a visiting scientist in our research team. She is a post doctoral fellow at the University of Southamption (National Oceanography Centre, Southampton). Maria is currently working on iron uptake by phytoplankton in the North Atlantic Ocean.
14.10.2013
Workshop "When genetics meets oceanography" (14-16 October 2013 Banyuls-sur-Mer France)
Scientific Committee
Kathy Barbeau Scripps Institution of Oceanography/UC San Diego, USA. Stéphane Blain, Laboratoire d’Océanographie MIcrobienne, CNRS-Univ Paris06, Banyuls-sur-Mer France, François-Yves Bouget Laboratoire d’Océanographie MIcrobienne, CNRS-Univ Paris06, Banyuls-sur-Mer, France. Chris Bowler Département de Biologie, Ecole Normal Supérieure, Paris, France. Christel Hassler, Institut...
03.03.2017
Workshop LEFE-CYBER : Cycles biogéochimiques et diversité du vivant dans l’océan
Du 29 Mai 14:00h au 30 Mai 13:00h 2017 à l’Observatoire Océanologique de Banyuls.
Les micro- et macro-organismes sont des acteurs clef pour les cycles biogéochimiques des éléments majeurs et traces dans l’océan, le sédiment et aux interfaces. La prise en compte des caractéristiques biologiques des organismes et leur organisation au sein d’écosystèmes en termes de diversité, de fonctions ou d’interactions...