Objectifs Thème 1
Animateur : François-Yves Bouget
Les paramètres physiques et chimiques de l'environnement, tels que l'intensité de la lumière, la durée du jour, la température et les nutriments (par exemple le nitrates, le phosphate, les vitamines, le fer) ont un impact majeur sur la physiologie des communautés microbiennes, y compris le phytoplancton eucaryotes, les cyanobactéries et les bactéries hétérotrophes.
Les principales questions abordées sont :
- Comment les bactéries hétérotrophes et le phytoplancton s'acclimatent et s'adaptent-ils aux concentrations de fer comme celles rencontrées dans de grandes régions de l'océan mondial?
- Comment la longueur et la température du jour affectent-elles la croissance, la prolifération et la saisonnalité du phytoplancton et des bactéries ?
- Comment les rayons UV et PAR influencent-ils la survie du bactérioplancton et les cycles du carbone et de l'azote ?
- Comment les facteurs environnementaux régulent l'excrétion de matière organique dissoute par les bactéries et le phytoplancton ?
Nous utilisons des approches du gène à l'écosystème, tels que des transformations génétiques sur des modèles d'organismes du phytoplancton et des bactéries, des expériences en microcosmes dans des conditions de laboratoire bien définies, des études sur le terrain sur des communautés microbiennes et des campagnes océanographiques à grande échelle.
Contact : François-Yves Bouget
E-mail : francois-yves.bouget @ obs-banyuls.fr
Tel : 33 (0)4 68 88 73 50
ACTUALITÉS
06.12.2015
Découverte d’un mécanisme d’adaptation de certaines espèces de phytoplancton marin à la carence en fer
Des chercheurs issus d’un consortium de laboratoires mené par le LOMIC ont précisé le rôle de la ferritine dans l'adaptation de certianes espèces de phytoplancton à la carence au fer.
La ferritine est une protéine présente dans les cellules de très nombreux organismes, de l’homme à la bactérie, qui possède la capacité de stocker de grandes quantités de fer. En permettant la réutilisation du fer...
23.11.2015
MOORE Foundation
$8M awarded to scientists from the Gordon and Betty Moore Foundation to accelerate development of experimental model systems in marine microbial ecology
Le LOMIC fait parti des bénéficiaires de l'initiative en Microbiologie Marine financé par la MOORE Foundation pour accélérer le développement de modèles expérimentaux de microorganismes marins.
Communiqué de presse de MOORE Foundation
11.11.2014
Publication in Plant Cell: Efficient gene targeting and foreign DNA removal by homologous recombination in the picoeukaryote Ostreococcus
With fewer than 8000 genes and a minimalist cellular organization, the green picoalga Ostreococcus tauri is one of the simplest photosynthetic eukaryotes. Ostreococcus tauri contains many plant-specific genes but exhibits a very low gene redundancy. The haploid genome is extremely dense with few repeated sequences and rare transposons. Thanks to the implementation of genetic transformation and vectors...
25.09.2014
Publication in Cell journal: Determination and Inference of Eukaryotic Transcription Factor Sequence Specificity
Détermination et prédiction des sites de reconnaissance des facteurs de transcription eucaryotes
Un consortium international mené par des chercheurs de l’Université de Toronto, auquel est associé le Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC, UMR7621 UPMC-CNRS, Observatoire Océanologique, Banyuls sur Mer) a déterminé et prédit les séquences ADN de fixation d’environ un tiers des facteurs de...
10.09.2014
ANR PHOTO-PHYTO. Effets du réchauffement climatique sur le déclenchement des blooms phytoplanctoniques marins
Le réchauffement des océans est le principal facteur responsable des changements globaux de productivité, biomasse et phénologie (moment des blooms) des communautés phytoplanctoniques.
Dans les océans tempérés, l’abondance et la diversité du phytoplancton augmentent de façon considérable entre l’hiver et le printemps. Ces blooms résultent vraisemblablement d’une combinaison de paramètres physiques...
30.11.2012
Symposium on UV radiation at COPAS
Dans le cadre du LIA MORFUN un symposium intitule "UV radiation and marine ecosystems: Current research and strategies for the future" sera organisé au COPAS (Concepcion, Chile) le 5-7 Decembre 2012.
Deux chercheurs de notre équipe, Camila Fernandez et Fabien Joux, sont invitées au symposium et presenteront leurs travaux recents sur le sujet.
Lire plus http://www2.udec.cl/oceanoudec/pag_ASI13/eng/descrpcion...
12.10.2012
Photorésistance UV de Photobacterium révélée par la protéomique
A lire dans :
Matallana-Surget S., JouxF., Wattiez
R., Lebaron P. (2012) Proteome analysis of the UVB-resistant marine bacterium, Photobacterium angustum S14.
PlosOne 7(8): e42299
23.02.2012
Utiliser la génomique pour étudier le cycle du fer dans l’océan
Une collaboration entre les équipes du laboratoire Biologie intégrative et organismes modèles (BIOM, CNRS / UPMC) et du Laboratoire d’océanographie microbienne (LOMIC, UPMC / CNRS) et un expert en modélisation du cycle du fer dans l’océan vient de montrer que l’analyse du génome de populations naturelles de microorganismes marins apportent des informations nouvelles sur les stratégies déployées par...
Nos dernières publications
Brodie J., Ball S.G., Bouget F-Y., Chan C.X., De Clerck O., Cock M., Gachon C., Grossman A.R., Mock T., Raven J., Saha M., Smith A., Vardi A., Yoon H.S., Bhattacharya D. (2017) Biotic interactions as drivers of algal origin and evolution. Nature Microbiology New Phytologist DOI: 10.1111/nph.14760
Paerl...
Mots-clefs
Ecophysiologie, forçages environnementaux, fer, phosphate, azote, lumière, photopériode